Protein–RNA interactions for Protein: Q13564

NAE1, NEDD8-activating enzyme E1 regulatory subunit, humanhuman

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Length 534 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NAE1Q13564 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NAE1Q13564 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NAE1Q13564 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NAE1Q13564 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NAE1Q13564 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NAE1Q13564 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NAE1Q13564 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
NAE1Q13564 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NAE1Q13564 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
NAE1Q13564 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NAE1Q13564 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NAE1Q13564 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NAE1Q13564 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NAE1Q13564 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
NAE1Q13564 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NAE1Q13564 DDHD2-205ENST00000520272 4532 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NAE1Q13564 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NAE1Q13564 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NAE1Q13564 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NAE1Q13564 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NAE1Q13564 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NAE1Q13564 EML4-201ENST00000318522 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NAE1Q13564 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NAE1Q13564 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NAE1Q13564 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NAE1Q13564 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NAE1Q13564 SBF1-201ENST00000348911 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NAE1Q13564 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NAE1Q13564 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NAE1Q13564 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NAE1Q13564 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NAE1Q13564 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NAE1Q13564 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NAE1Q13564 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NAE1Q13564 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NAE1Q13564 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NAE1Q13564 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NAE1Q13564 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NAE1Q13564 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
NAE1Q13564 PER2-201ENST00000254657 6385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NAE1Q13564 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NAE1Q13564 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NAE1Q13564 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
NAE1Q13564 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NAE1Q13564 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NAE1Q13564 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NAE1Q13564 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NAE1Q13564 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NAE1Q13564 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NAE1Q13564 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NAE1Q13564 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NAE1Q13564 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NAE1Q13564 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NAE1Q13564 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NAE1Q13564 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NAE1Q13564 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NAE1Q13564 AK4-202ENST00000395334 6998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NAE1Q13564 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
NAE1Q13564 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NAE1Q13564 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
NAE1Q13564 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
NAE1Q13564 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NAE1Q13564 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NAE1Q13564 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NAE1Q13564 COL11A2-201ENST00000341947 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NAE1Q13564 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NAE1Q13564 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NAE1Q13564 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NAE1Q13564 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NAE1Q13564 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NAE1Q13564 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NAE1Q13564 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NAE1Q13564 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NAE1Q13564 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
NAE1Q13564 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NAE1Q13564 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NAE1Q13564 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NAE1Q13564 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NAE1Q13564 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NAE1Q13564 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NAE1Q13564 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NAE1Q13564 TOB2-201ENST00000327492 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NAE1Q13564 TTC28-AS1-219ENST00000454741 5064 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NAE1Q13564 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NAE1Q13564 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NAE1Q13564 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
NAE1Q13564 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NAE1Q13564 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NAE1Q13564 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NAE1Q13564 NR4A3-201ENST00000330847 4982 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NAE1Q13564 NFATC4-204ENST00000424781 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NAE1Q13564 INPP5B-202ENST00000373023 4694 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NAE1Q13564 BNIP2-201ENST00000267859 6325 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NAE1Q13564 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NAE1Q13564 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NAE1Q13564 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NAE1Q13564 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NAE1Q13564 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NAE1Q13564 PSMG3-AS1-201ENST00000437621 5701 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NAE1Q13564 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
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