Protein–RNA interactions for Protein: Q13554

CAMK2B, Calcium/calmodulin-dependent protein kinase type II subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 666 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAMK2BQ13554 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CAMK2BQ13554 SLC40A1-201ENST00000261024 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CAMK2BQ13554 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CAMK2BQ13554 PTBP1-201ENST00000349038 3155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CAMK2BQ13554 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CAMK2BQ13554 PALLD-215ENST00000512127 2958 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CAMK2BQ13554 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CAMK2BQ13554 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CAMK2BQ13554 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CAMK2BQ13554 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CAMK2BQ13554 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CAMK2BQ13554 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CAMK2BQ13554 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CAMK2BQ13554 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CAMK2BQ13554 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CAMK2BQ13554 AC006504.5-203ENST00000590628 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CAMK2BQ13554 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CAMK2BQ13554 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CAMK2BQ13554 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
CAMK2BQ13554 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CAMK2BQ13554 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CAMK2BQ13554 AC004943.2-201ENST00000563328 4842 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CAMK2BQ13554 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
CAMK2BQ13554 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CAMK2BQ13554 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CAMK2BQ13554 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CAMK2BQ13554 HIKESHI-201ENST00000278483 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CAMK2BQ13554 ZBTB12BP-201ENST00000314232 1122 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
CAMK2BQ13554 C3orf22-201ENST00000318225 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CAMK2BQ13554 MBP-203ENST00000359645 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CAMK2BQ13554 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CAMK2BQ13554 AC018467.1-201ENST00000421581 717 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CAMK2BQ13554 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CAMK2BQ13554 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CAMK2BQ13554 AC080188.2-201ENST00000508985 552 ntTSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CAMK2BQ13554 RNU6-362P-201ENST00000516736 90 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
CAMK2BQ13554 AC122713.1-201ENST00000518368 1015 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
CAMK2BQ13554 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CAMK2BQ13554 AKIP1-210ENST00000534147 1022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CAMK2BQ13554 AC079316.1-201ENST00000548397 411 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
CAMK2BQ13554 LINC02299-201ENST00000556669 430 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CAMK2BQ13554 AL390726.5-201ENST00000562942 871 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CAMK2BQ13554 DUX4L45-201ENST00000566406 1057 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
CAMK2BQ13554 CRISPLD2-210ENST00000569090 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CAMK2BQ13554 ZNF180-204ENST00000586637 1023 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CAMK2BQ13554 AC112220.4-201ENST00000604982 1263 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
CAMK2BQ13554 AC009542.2-202ENST00000619004 1067 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
CAMK2BQ13554 AC006449.3-201ENST00000620144 563 ntTSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CAMK2BQ13554 SIGLEC12-203ENST00000598614 1434 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CAMK2BQ13554 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CAMK2BQ13554 AGBL3-202ENST00000435976 2495 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CAMK2BQ13554 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CAMK2BQ13554 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CAMK2BQ13554 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CAMK2BQ13554 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CAMK2BQ13554 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
CAMK2BQ13554 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CAMK2BQ13554 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CAMK2BQ13554 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CAMK2BQ13554 CABP4-201ENST00000325656 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CAMK2BQ13554 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CAMK2BQ13554 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CAMK2BQ13554 RAF1-205ENST00000442415 3085 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CAMK2BQ13554 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CAMK2BQ13554 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CAMK2BQ13554 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CAMK2BQ13554 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CAMK2BQ13554 RGS6-218ENST00000556437 1689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CAMK2BQ13554 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CAMK2BQ13554 ARFIP1-202ENST00000356064 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CAMK2BQ13554 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CAMK2BQ13554 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CAMK2BQ13554 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CAMK2BQ13554 TTC32-201ENST00000333610 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CAMK2BQ13554 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CAMK2BQ13554 MASP2-202ENST00000400898 726 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CAMK2BQ13554 AC026954.1-201ENST00000429771 1293 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
CAMK2BQ13554 KLK4-202ENST00000431178 481 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CAMK2BQ13554 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
CAMK2BQ13554 AC139149.1-202ENST00000442532 783 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CAMK2BQ13554 AC114495.2-201ENST00000452686 437 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
CAMK2BQ13554 TNFRSF14-AS1-206ENST00000452793 569 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CAMK2BQ13554 GLYCTK-203ENST00000461183 889 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CAMK2BQ13554 APOPT1-207ENST00000477116 906 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CAMK2BQ13554 FTH1P14-201ENST00000482930 551 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
CAMK2BQ13554 AC108142.1-201ENST00000505389 286 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CAMK2BQ13554 GTF2H2C-215ENST00000514162 610 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CAMK2BQ13554 AP006295.1-201ENST00000532605 585 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CAMK2BQ13554 RIT1-205ENST00000539040 919 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CAMK2BQ13554 AC026495.1-203ENST00000557528 906 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CAMK2BQ13554 COG4-212ENST00000564653 590 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CAMK2BQ13554 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CAMK2BQ13554 RN7SL560P-201ENST00000577943 264 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
CAMK2BQ13554 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CAMK2BQ13554 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CAMK2BQ13554 AC011497.1-201ENST00000596781 561 ntTSL 4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CAMK2BQ13554 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CAMK2BQ13554 AC114490.1-201ENST00000417456 3163 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CAMK2BQ13554 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CAMK2BQ13554 HARS2-202ENST00000448069 1426 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms