Protein–RNA interactions for Protein: Q13547

HDAC1, Histone deacetylase 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 482 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC1Q13547 SLC25A27-201ENST00000371347 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
HDAC1Q13547 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
HDAC1Q13547 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
HDAC1Q13547 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
HDAC1Q13547 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
HDAC1Q13547 RPH3AL-201ENST00000323434 2809 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
HDAC1Q13547 ANKRD44-203ENST00000409153 2724 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
HDAC1Q13547 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
HDAC1Q13547 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
HDAC1Q13547 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
HDAC1Q13547 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
HDAC1Q13547 LINC02395-201ENST00000546821 3157 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
HDAC1Q13547 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
HDAC1Q13547 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
HDAC1Q13547 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
HDAC1Q13547 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
HDAC1Q13547 LYSMD4-204ENST00000409796 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
HDAC1Q13547 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
HDAC1Q13547 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
HDAC1Q13547 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
HDAC1Q13547 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
HDAC1Q13547 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
HDAC1Q13547 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
HDAC1Q13547 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
HDAC1Q13547 HM13-201ENST00000335574 1809 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
HDAC1Q13547 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
HDAC1Q13547 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
HDAC1Q13547 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
HDAC1Q13547 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
HDAC1Q13547 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC19.24■□□□□ 0.67
HDAC1Q13547 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
HDAC1Q13547 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
HDAC1Q13547 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.24■□□□□ 0.67
HDAC1Q13547 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
HDAC1Q13547 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
HDAC1Q13547 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC19.24■□□□□ 0.67
HDAC1Q13547 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
HDAC1Q13547 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
HDAC1Q13547 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
HDAC1Q13547 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
HDAC1Q13547 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
HDAC1Q13547 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
HDAC1Q13547 MOCS1-201ENST00000340692 2747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
HDAC1Q13547 FGF7P3-202ENST00000640245 1707 ntTSL 4 BASIC19.24■□□□□ 0.67
HDAC1Q13547 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
HDAC1Q13547 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
HDAC1Q13547 HOXB4-201ENST00000332503 3757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
HDAC1Q13547 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
HDAC1Q13547 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
HDAC1Q13547 SPHK2-210ENST00000599748 2683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
HDAC1Q13547 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
HDAC1Q13547 AC058822.1-201ENST00000507166 2550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
HDAC1Q13547 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
HDAC1Q13547 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
HDAC1Q13547 NPY5R-203ENST00000515560 3183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
HDAC1Q13547 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
HDAC1Q13547 AC007191.1-201ENST00000623179 2995 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
HDAC1Q13547 KRT20-201ENST00000167588 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
HDAC1Q13547 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
HDAC1Q13547 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
HDAC1Q13547 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
HDAC1Q13547 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
HDAC1Q13547 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
HDAC1Q13547 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
HDAC1Q13547 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
HDAC1Q13547 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
HDAC1Q13547 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
HDAC1Q13547 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
HDAC1Q13547 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
HDAC1Q13547 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
HDAC1Q13547 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
HDAC1Q13547 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC19.23■□□□□ 0.67
HDAC1Q13547 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
HDAC1Q13547 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
HDAC1Q13547 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
HDAC1Q13547 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
HDAC1Q13547 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
HDAC1Q13547 SCLY-202ENST00000409736 1774 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
HDAC1Q13547 AC123912.2-201ENST00000594927 2409 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
HDAC1Q13547 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
HDAC1Q13547 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
HDAC1Q13547 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
HDAC1Q13547 E2F6-211ENST00000542100 3450 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
HDAC1Q13547 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
HDAC1Q13547 SRPRA-206ENST00000532259 2453 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
HDAC1Q13547 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
HDAC1Q13547 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
HDAC1Q13547 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
HDAC1Q13547 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
HDAC1Q13547 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
HDAC1Q13547 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
HDAC1Q13547 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
HDAC1Q13547 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
HDAC1Q13547 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
HDAC1Q13547 LIMK2-204ENST00000406516 2657 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
HDAC1Q13547 CDC25B-203ENST00000344256 3071 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
HDAC1Q13547 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
HDAC1Q13547 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
HDAC1Q13547 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
HDAC1Q13547 B3GNTL1-211ENST00000576599 1787 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
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