Protein–RNA interactions for Protein: Q13541

EIF4EBP1, Eukaryotic translation initiation factor 4E-binding protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 118 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EIF4EBP1Q13541 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
EIF4EBP1Q13541 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
EIF4EBP1Q13541 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC12.53□□□□□ -0.4
EIF4EBP1Q13541 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC12.53□□□□□ -0.4
EIF4EBP1Q13541 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
EIF4EBP1Q13541 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC12.53□□□□□ -0.4
EIF4EBP1Q13541 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC12.53□□□□□ -0.4
EIF4EBP1Q13541 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC12.53□□□□□ -0.4
EIF4EBP1Q13541 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
EIF4EBP1Q13541 ACVR1B-206ENST00000542485 2362 ntTSL 2 BASIC12.53□□□□□ -0.4
EIF4EBP1Q13541 PARP10-201ENST00000313028 3497 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
EIF4EBP1Q13541 MFRP-201ENST00000360167 1663 ntTSL 2 BASIC12.53□□□□□ -0.4
EIF4EBP1Q13541 SYP-201ENST00000263233 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
EIF4EBP1Q13541 YME1L1-202ENST00000375972 2517 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
EIF4EBP1Q13541 NEDD4L-202ENST00000356462 3335 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
EIF4EBP1Q13541 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
EIF4EBP1Q13541 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
EIF4EBP1Q13541 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
EIF4EBP1Q13541 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
EIF4EBP1Q13541 CDKN2AIP-201ENST00000302350 2646 ntTSL 2 BASIC12.53□□□□□ -0.4
EIF4EBP1Q13541 F8-201ENST00000330287 2620 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
EIF4EBP1Q13541 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
EIF4EBP1Q13541 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
EIF4EBP1Q13541 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
EIF4EBP1Q13541 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
EIF4EBP1Q13541 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
EIF4EBP1Q13541 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.52□□□□□ -0.4
EIF4EBP1Q13541 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
EIF4EBP1Q13541 POLR2B-205ENST00000441246 3839 ntTSL 2 BASIC12.52□□□□□ -0.4
EIF4EBP1Q13541 TRAK1-208ENST00000484786 2008 ntTSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.4
EIF4EBP1Q13541 C5orf30-202ENST00000510890 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.52□□□□□ -0.4
EIF4EBP1Q13541 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
EIF4EBP1Q13541 AIFM1-209ENST00000535724 2468 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
EIF4EBP1Q13541 NOP2-222ENST00000617555 2017 ntTSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.4
EIF4EBP1Q13541 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
EIF4EBP1Q13541 AC025674.2-201ENST00000522622 2971 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
EIF4EBP1Q13541 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.4
EIF4EBP1Q13541 CD8A-203ENST00000409511 3048 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.52□□□□□ -0.4
EIF4EBP1Q13541 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
EIF4EBP1Q13541 LDLRAD4-205ENST00000585931 2118 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
EIF4EBP1Q13541 SLC52A3-202ENST00000381944 3060 ntTSL 2 BASIC12.52□□□□□ -0.4
EIF4EBP1Q13541 MVB12B-206ENST00000489637 2666 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
EIF4EBP1Q13541 POLR2E-211ENST00000612655 1749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.52□□□□□ -0.41
EIF4EBP1Q13541 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
EIF4EBP1Q13541 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
EIF4EBP1Q13541 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
EIF4EBP1Q13541 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
EIF4EBP1Q13541 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
EIF4EBP1Q13541 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC12.52□□□□□ -0.41
EIF4EBP1Q13541 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC12.52□□□□□ -0.41
EIF4EBP1Q13541 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC12.52□□□□□ -0.41
EIF4EBP1Q13541 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC12.52□□□□□ -0.41
EIF4EBP1Q13541 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC12.52□□□□□ -0.41
EIF4EBP1Q13541 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
EIF4EBP1Q13541 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
EIF4EBP1Q13541 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC12.52□□□□□ -0.41
EIF4EBP1Q13541 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC12.52□□□□□ -0.41
EIF4EBP1Q13541 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
EIF4EBP1Q13541 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC12.52□□□□□ -0.41
EIF4EBP1Q13541 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
EIF4EBP1Q13541 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC12.52□□□□□ -0.41
EIF4EBP1Q13541 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
EIF4EBP1Q13541 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
EIF4EBP1Q13541 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC12.52□□□□□ -0.41
EIF4EBP1Q13541 SIGLEC5-201ENST00000534261 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
EIF4EBP1Q13541 ZFP36L1-201ENST00000336440 3026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.52□□□□□ -0.41
EIF4EBP1Q13541 MAPK7-203ENST00000395602 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
EIF4EBP1Q13541 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC12.52□□□□□ -0.41
EIF4EBP1Q13541 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.52□□□□□ -0.41
EIF4EBP1Q13541 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
EIF4EBP1Q13541 TTC22-202ENST00000371276 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
EIF4EBP1Q13541 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
EIF4EBP1Q13541 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
EIF4EBP1Q13541 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
EIF4EBP1Q13541 CYP26A1-202ENST00000371531 2245 ntTSL 2 BASIC12.52□□□□□ -0.41
EIF4EBP1Q13541 SLC35C2-204ENST00000372230 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
EIF4EBP1Q13541 USP43-202ENST00000570475 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
EIF4EBP1Q13541 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC12.51□□□□□ -0.41
EIF4EBP1Q13541 FGD2-201ENST00000274963 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
EIF4EBP1Q13541 C1orf43-206ENST00000368521 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
EIF4EBP1Q13541 ALDOA-228ENST00000627059 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
EIF4EBP1Q13541 E2F6-212ENST00000546212 3191 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
EIF4EBP1Q13541 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
EIF4EBP1Q13541 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
EIF4EBP1Q13541 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
EIF4EBP1Q13541 TRIP10-208ENST00000596758 1920 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
EIF4EBP1Q13541 AC007686.3-201ENST00000619017 3487 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
EIF4EBP1Q13541 MAGEA2-209ENST00000623806 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.51□□□□□ -0.41
EIF4EBP1Q13541 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
EIF4EBP1Q13541 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
EIF4EBP1Q13541 TEAD3-201ENST00000338863 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
EIF4EBP1Q13541 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
EIF4EBP1Q13541 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.51□□□□□ -0.41
EIF4EBP1Q13541 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC12.51□□□□□ -0.41
EIF4EBP1Q13541 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
EIF4EBP1Q13541 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC12.51□□□□□ -0.41
EIF4EBP1Q13541 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
EIF4EBP1Q13541 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC12.51□□□□□ -0.41
EIF4EBP1Q13541 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
EIF4EBP1Q13541 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65 ms