Protein–RNA interactions for Protein: Q13401

PMS2P3, Putative postmeiotic segregation increased 2-like protein 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS2P3Q13401 USP19-205ENST00000398898 4474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PMS2P3Q13401 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PMS2P3Q13401 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PMS2P3Q13401 WNT9B-202ENST00000393461 2654 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PMS2P3Q13401 RBM26-203ENST00000438737 4132 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PMS2P3Q13401 LINC00910-206ENST00000592135 2438 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PMS2P3Q13401 LINC00476-204ENST00000429781 2825 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PMS2P3Q13401 COBL-203ENST00000395542 5339 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PMS2P3Q13401 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PMS2P3Q13401 TRMT1-217ENST00000592062 2579 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PMS2P3Q13401 RNASEH2B-202ENST00000422660 4830 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PMS2P3Q13401 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PMS2P3Q13401 HTR3A-202ENST00000355556 2331 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PMS2P3Q13401 GCK-204ENST00000403799 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PMS2P3Q13401 THTPA-201ENST00000288014 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PMS2P3Q13401 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PMS2P3Q13401 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PMS2P3Q13401 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PMS2P3Q13401 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PMS2P3Q13401 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
PMS2P3Q13401 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PMS2P3Q13401 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PMS2P3Q13401 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PMS2P3Q13401 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PMS2P3Q13401 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PMS2P3Q13401 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PMS2P3Q13401 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PMS2P3Q13401 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
PMS2P3Q13401 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
PMS2P3Q13401 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
PMS2P3Q13401 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PMS2P3Q13401 TTC28-AS1-219ENST00000454741 5064 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PMS2P3Q13401 CICP17-201ENST00000418553 2377 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
PMS2P3Q13401 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PMS2P3Q13401 ZFYVE28-211ENST00000515312 3247 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PMS2P3Q13401 POLR2E-211ENST00000612655 1749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PMS2P3Q13401 SDC1-201ENST00000254351 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PMS2P3Q13401 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PMS2P3Q13401 NMUR1-201ENST00000305141 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PMS2P3Q13401 NRP2-205ENST00000412873 2730 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PMS2P3Q13401 FBXL16-201ENST00000324361 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PMS2P3Q13401 MYD88-203ENST00000417037 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PMS2P3Q13401 PAK4-208ENST00000599386 5735 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PMS2P3Q13401 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PMS2P3Q13401 NEDD4L-205ENST00000400345 3647 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PMS2P3Q13401 GPR132-203ENST00000539291 2779 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PMS2P3Q13401 ZFR2-201ENST00000262961 4756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PMS2P3Q13401 BX640514.1-201ENST00000583223 1918 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
PMS2P3Q13401 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
PMS2P3Q13401 AGPS-201ENST00000264167 7764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PMS2P3Q13401 PAPSS2-201ENST00000361175 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PMS2P3Q13401 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PMS2P3Q13401 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PMS2P3Q13401 SAFB2-201ENST00000252542 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PMS2P3Q13401 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PMS2P3Q13401 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PMS2P3Q13401 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PMS2P3Q13401 PDPK1-201ENST00000268673 4728 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PMS2P3Q13401 PHTF1-204ENST00000369604 3273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PMS2P3Q13401 OSBPL10-201ENST00000396556 6600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PMS2P3Q13401 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PMS2P3Q13401 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PMS2P3Q13401 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
PMS2P3Q13401 WDR77-201ENST00000235090 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PMS2P3Q13401 RFX2-222ENST00000592546 2578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PMS2P3Q13401 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PMS2P3Q13401 GLG1-203ENST00000447066 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PMS2P3Q13401 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PMS2P3Q13401 HOXA3-201ENST00000317201 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PMS2P3Q13401 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PMS2P3Q13401 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PMS2P3Q13401 ALAS2-201ENST00000330807 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PMS2P3Q13401 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PMS2P3Q13401 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PMS2P3Q13401 LRRFIP1-204ENST00000392000 3365 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PMS2P3Q13401 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PMS2P3Q13401 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PMS2P3Q13401 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PMS2P3Q13401 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PMS2P3Q13401 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PMS2P3Q13401 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PMS2P3Q13401 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
PMS2P3Q13401 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PMS2P3Q13401 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PMS2P3Q13401 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
PMS2P3Q13401 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PMS2P3Q13401 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
PMS2P3Q13401 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
PMS2P3Q13401 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PMS2P3Q13401 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
PMS2P3Q13401 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PMS2P3Q13401 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PMS2P3Q13401 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
PMS2P3Q13401 TGOLN2-203ENST00000398263 6138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PMS2P3Q13401 SIGLEC5-201ENST00000534261 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PMS2P3Q13401 AC079447.1-201ENST00000424491 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PMS2P3Q13401 KIF19-202ENST00000389916 3643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PMS2P3Q13401 RLIM-202ENST00000349225 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PMS2P3Q13401 ABCC1-201ENST00000399408 6594 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PMS2P3Q13401 ABCC1-202ENST00000399410 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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