Protein–RNA interactions for Protein: Q13185

CBX3, Chromobox protein homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX3Q13185 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.01□□□□□ -0.17
CBX3Q13185 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC14.01□□□□□ -0.17
CBX3Q13185 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
CBX3Q13185 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
CBX3Q13185 VAC14-AS1-201ENST00000398177 2145 ntTSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
CBX3Q13185 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
CBX3Q13185 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
CBX3Q13185 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC14.01□□□□□ -0.17
CBX3Q13185 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
CBX3Q13185 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC14.01□□□□□ -0.17
CBX3Q13185 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
CBX3Q13185 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
CBX3Q13185 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC14.01□□□□□ -0.17
CBX3Q13185 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
CBX3Q13185 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
CBX3Q13185 POMT1-201ENST00000341012 2912 ntTSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
CBX3Q13185 AC068987.4-201ENST00000562343 2094 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
CBX3Q13185 KRT42P-202ENST00000438131 2895 ntTSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
CBX3Q13185 FAM219B-201ENST00000357635 3550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
CBX3Q13185 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
CBX3Q13185 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
CBX3Q13185 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
CBX3Q13185 TTC38-201ENST00000381031 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
CBX3Q13185 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
CBX3Q13185 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
CBX3Q13185 AP1G2-201ENST00000308724 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
CBX3Q13185 AC015712.2-202ENST00000560068 3213 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
CBX3Q13185 KIFC3-211ENST00000562903 3221 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
CBX3Q13185 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
CBX3Q13185 SNX12-202ENST00000374274 2376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
CBX3Q13185 KCNAB2-219ENST00000602612 2396 ntTSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
CBX3Q13185 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
CBX3Q13185 LINC02396-202ENST00000550636 2324 ntTSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
CBX3Q13185 NUTM2E-202ENST00000602967 3623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
CBX3Q13185 TAGLN2-202ENST00000368096 1603 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
CBX3Q13185 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
CBX3Q13185 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
CBX3Q13185 GRIPAP1-215ENST00000622599 2881 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
CBX3Q13185 UQCRFS1-201ENST00000304863 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
CBX3Q13185 CASP2-207ENST00000619992 4006 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
CBX3Q13185 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
CBX3Q13185 KIF21B-201ENST00000332129 9897 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
CBX3Q13185 KLHL21-201ENST00000377658 4487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
CBX3Q13185 TBC1D3P2-203ENST00000581291 2088 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
CBX3Q13185 SPPL2A-201ENST00000261854 7372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
CBX3Q13185 TNFAIP8L1-201ENST00000327473 3814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
CBX3Q13185 GRIN1-204ENST00000371553 3751 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
CBX3Q13185 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC14□□□□□ -0.17
CBX3Q13185 FBLN2-203ENST00000404922 4318 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
CBX3Q13185 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
CBX3Q13185 GAL3ST4-202ENST00000411994 1404 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
CBX3Q13185 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC14□□□□□ -0.17
CBX3Q13185 ABAT-203ENST00000425191 1923 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
CBX3Q13185 C7orf57-204ENST00000435376 1925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
CBX3Q13185 C7orf57-206ENST00000539619 1927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
CBX3Q13185 MLLT11-201ENST00000368921 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
CBX3Q13185 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
CBX3Q13185 FOXM1-210ENST00000627656 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
CBX3Q13185 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
CBX3Q13185 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
CBX3Q13185 PPP2R1A-201ENST00000322088 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
CBX3Q13185 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
CBX3Q13185 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC14□□□□□ -0.17
CBX3Q13185 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
CBX3Q13185 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
CBX3Q13185 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
CBX3Q13185 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC14□□□□□ -0.17
CBX3Q13185 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
CBX3Q13185 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
CBX3Q13185 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
CBX3Q13185 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
CBX3Q13185 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
CBX3Q13185 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
CBX3Q13185 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC14□□□□□ -0.17
CBX3Q13185 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
CBX3Q13185 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC14□□□□□ -0.17
CBX3Q13185 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
CBX3Q13185 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
CBX3Q13185 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
CBX3Q13185 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
CBX3Q13185 ZBED1-202ENST00000381222 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
CBX3Q13185 MBP-208ENST00000397866 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
CBX3Q13185 PAX6-202ENST00000379107 2579 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
CBX3Q13185 NR1H3-211ENST00000441012 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
CBX3Q13185 TMEM229B-207ENST00000557006 3941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
CBX3Q13185 APCDD1L-AS1-203ENST00000427140 2092 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
CBX3Q13185 PREP-201ENST00000369110 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
CBX3Q13185 GJB1-203ENST00000374029 1587 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
CBX3Q13185 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
CBX3Q13185 HJURP-207ENST00000441687 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
CBX3Q13185 RBFADN-204ENST00000568911 5187 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
CBX3Q13185 PNRC2-201ENST00000334351 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
CBX3Q13185 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC14□□□□□ -0.17
CBX3Q13185 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC14□□□□□ -0.17
CBX3Q13185 TMPRSS2-202ENST00000398585 3240 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
CBX3Q13185 RBP1-203ENST00000483943 1935 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
CBX3Q13185 AGRN-201ENST00000379370 7323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CBX3Q13185 SETD1A-201ENST00000262519 6451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CBX3Q13185 P2RX5-207ENST00000551178 1863 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CBX3Q13185 TNPO2-202ENST00000425528 5122 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.9 ms