Protein–RNA interactions for Protein: Q12996

CSTF3, Cleavage stimulation factor subunit 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 717 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSTF3Q12996 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CSTF3Q12996 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
CSTF3Q12996 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
CSTF3Q12996 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CSTF3Q12996 C9orf47-201ENST00000334490 4829 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CSTF3Q12996 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
CSTF3Q12996 HECW1-203ENST00000453890 5169 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CSTF3Q12996 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CSTF3Q12996 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CSTF3Q12996 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CSTF3Q12996 VSIG10L-201ENST00000335624 3397 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CSTF3Q12996 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CSTF3Q12996 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CSTF3Q12996 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
CSTF3Q12996 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CSTF3Q12996 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CSTF3Q12996 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CSTF3Q12996 TBC1D1-201ENST00000261439 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CSTF3Q12996 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CSTF3Q12996 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CSTF3Q12996 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CSTF3Q12996 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CSTF3Q12996 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CSTF3Q12996 GPD1L-201ENST00000282541 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CSTF3Q12996 AQP1-201ENST00000311813 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CSTF3Q12996 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CSTF3Q12996 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CSTF3Q12996 UMODL1-203ENST00000400424 5516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CSTF3Q12996 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CSTF3Q12996 XPO6-201ENST00000304658 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CSTF3Q12996 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CSTF3Q12996 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
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CSTF3Q12996 AC067750.1-201ENST00000608826 6545 ntBASIC15.05■□□□□ 0
CSTF3Q12996 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
CSTF3Q12996 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
CSTF3Q12996 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC15.05■□□□□ 0
CSTF3Q12996 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
CSTF3Q12996 VARS2-201ENST00000321897 4073 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CSTF3Q12996 EHHADH-203ENST00000456310 2577 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
CSTF3Q12996 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
CSTF3Q12996 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
CSTF3Q12996 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
CSTF3Q12996 RNF8-202ENST00000373479 5631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CSTF3Q12996 RPP14-202ENST00000445193 7985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CSTF3Q12996 PATZ1-202ENST00000266269 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CSTF3Q12996 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CSTF3Q12996 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
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CSTF3Q12996 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
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CSTF3Q12996 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
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CSTF3Q12996 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
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CSTF3Q12996 SPRED1-201ENST00000299084 7780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CSTF3Q12996 APOLD1-201ENST00000326765 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CSTF3Q12996 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
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CSTF3Q12996 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CSTF3Q12996 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
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CSTF3Q12996 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CSTF3Q12996 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CSTF3Q12996 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
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CSTF3Q12996 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CSTF3Q12996 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CSTF3Q12996 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CSTF3Q12996 ATP11B-201ENST00000323116 7325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CSTF3Q12996 TNRC18-203ENST00000399537 10572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CSTF3Q12996 TNRC18-205ENST00000430969 10562 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CSTF3Q12996 UBR2-201ENST00000372899 7857 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CSTF3Q12996 UBR2-202ENST00000372901 7857 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CSTF3Q12996 ANKRD50-202ENST00000515641 4212 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CSTF3Q12996 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CSTF3Q12996 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CSTF3Q12996 DTNB-228ENST00000496972 2328 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CSTF3Q12996 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CSTF3Q12996 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CSTF3Q12996 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CSTF3Q12996 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CSTF3Q12996 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CSTF3Q12996 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CSTF3Q12996 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC15.04■□□□□ -0
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