Protein–RNA interactions for Protein: Q12947

FOXF2, Forkhead box protein F2, humanhuman

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Length 444 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXF2Q12947 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
FOXF2Q12947 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
FOXF2Q12947 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
FOXF2Q12947 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
FOXF2Q12947 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
FOXF2Q12947 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
FOXF2Q12947 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
FOXF2Q12947 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
FOXF2Q12947 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
FOXF2Q12947 PRR19-201ENST00000341747 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
FOXF2Q12947 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
FOXF2Q12947 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
FOXF2Q12947 CHI3L2-212ENST00000524472 1435 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
FOXF2Q12947 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
FOXF2Q12947 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
FOXF2Q12947 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
FOXF2Q12947 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
FOXF2Q12947 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
FOXF2Q12947 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
FOXF2Q12947 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
FOXF2Q12947 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
FOXF2Q12947 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
FOXF2Q12947 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
FOXF2Q12947 AL138709.1-201ENST00000614840 1693 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
FOXF2Q12947 RWDD4-205ENST00000510968 1551 ntTSL 4 BASIC13.63□□□□□ -0.23
FOXF2Q12947 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
FOXF2Q12947 ACP2-205ENST00000527256 1499 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
FOXF2Q12947 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
FOXF2Q12947 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
FOXF2Q12947 AC012531.2-201ENST00000512206 1389 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
FOXF2Q12947 NEDD1-213ENST00000557644 2367 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
FOXF2Q12947 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
FOXF2Q12947 UPK3A-201ENST00000216211 1051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
FOXF2Q12947 TRMT112-201ENST00000308774 561 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
FOXF2Q12947 AKIP1-202ENST00000309357 1232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
FOXF2Q12947 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
FOXF2Q12947 KLF2P2-201ENST00000416807 1039 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
FOXF2Q12947 CNN2P8-201ENST00000421872 913 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
FOXF2Q12947 DHDDS-206ENST00000427245 868 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
FOXF2Q12947 FAM197Y7-201ENST00000432892 766 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
FOXF2Q12947 GEMIN4-202ENST00000437269 1182 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
FOXF2Q12947 CR589904.1-201ENST00000437830 732 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
FOXF2Q12947 AC004522.2-201ENST00000456499 680 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
FOXF2Q12947 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
FOXF2Q12947 STARD4-205ENST00000505803 803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
FOXF2Q12947 AC106786.2-201ENST00000506859 561 ntTSL 4 BASIC13.63□□□□□ -0.23
FOXF2Q12947 STARD4-207ENST00000509887 1186 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
FOXF2Q12947 RNA5SP412-201ENST00000516234 123 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
FOXF2Q12947 OSGIN2-203ENST00000520659 801 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
FOXF2Q12947 AP002992.1-201ENST00000527519 491 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
FOXF2Q12947 USB1-203ENST00000539737 1212 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
FOXF2Q12947 AC090502.1-201ENST00000549905 748 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
FOXF2Q12947 AC090502.1-204ENST00000551210 469 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
FOXF2Q12947 AL133153.2-201ENST00000557524 303 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
FOXF2Q12947 AC120498.3-201ENST00000568884 542 ntTSL 4 BASIC13.63□□□□□ -0.23
FOXF2Q12947 AC068473.4-201ENST00000587527 585 ntTSL 4 BASIC13.63□□□□□ -0.23
FOXF2Q12947 FBXL12-211ENST00000591009 1005 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
FOXF2Q12947 SPATA21-206ENST00000612240 603 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
FOXF2Q12947 LARP4-220ENST00000615080 856 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
FOXF2Q12947 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
FOXF2Q12947 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
FOXF2Q12947 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
FOXF2Q12947 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
FOXF2Q12947 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
FOXF2Q12947 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
FOXF2Q12947 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
FOXF2Q12947 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
FOXF2Q12947 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
FOXF2Q12947 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
FOXF2Q12947 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
FOXF2Q12947 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
FOXF2Q12947 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
FOXF2Q12947 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
FOXF2Q12947 SULT2B1-202ENST00000323090 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
FOXF2Q12947 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
FOXF2Q12947 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
FOXF2Q12947 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
FOXF2Q12947 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
FOXF2Q12947 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
FOXF2Q12947 CHST10-203ENST00000409701 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
FOXF2Q12947 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
FOXF2Q12947 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
FOXF2Q12947 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
FOXF2Q12947 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
FOXF2Q12947 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
FOXF2Q12947 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
FOXF2Q12947 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
FOXF2Q12947 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
FOXF2Q12947 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
FOXF2Q12947 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
FOXF2Q12947 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
FOXF2Q12947 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
FOXF2Q12947 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
FOXF2Q12947 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
FOXF2Q12947 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
FOXF2Q12947 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
FOXF2Q12947 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
FOXF2Q12947 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
FOXF2Q12947 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
FOXF2Q12947 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
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