Protein–RNA interactions for Protein: Q12907

LMAN2, Vesicular integral-membrane protein VIP36, humanhuman

Predictions only

Length 356 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMAN2Q12907 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LMAN2Q12907 MUTYH-234ENST00000528013 1662 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LMAN2Q12907 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LMAN2Q12907 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LMAN2Q12907 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LMAN2Q12907 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LMAN2Q12907 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LMAN2Q12907 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
LMAN2Q12907 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
LMAN2Q12907 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
LMAN2Q12907 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
LMAN2Q12907 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
LMAN2Q12907 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
LMAN2Q12907 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
LMAN2Q12907 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
LMAN2Q12907 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
LMAN2Q12907 IFNL2-201ENST00000331982 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
LMAN2Q12907 GZMB-202ENST00000382540 816 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
LMAN2Q12907 FTH1P14-201ENST00000482930 551 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
LMAN2Q12907 GNAL-204ENST00000535121 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
LMAN2Q12907 AC018653.3-202ENST00000538062 735 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
LMAN2Q12907 C17orf49-209ENST00000552775 779 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
LMAN2Q12907 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
LMAN2Q12907 AL118558.1-202ENST00000557242 451 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
LMAN2Q12907 CX3CL1-203ENST00000564948 563 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
LMAN2Q12907 AC010491.1-202ENST00000567048 528 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
LMAN2Q12907 AP005019.2-201ENST00000615104 511 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
LMAN2Q12907 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
LMAN2Q12907 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
LMAN2Q12907 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
LMAN2Q12907 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
LMAN2Q12907 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
LMAN2Q12907 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
LMAN2Q12907 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
LMAN2Q12907 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
LMAN2Q12907 KLHDC3-203ENST00000332245 1494 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
LMAN2Q12907 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
LMAN2Q12907 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
LMAN2Q12907 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
LMAN2Q12907 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LMAN2Q12907 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LMAN2Q12907 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LMAN2Q12907 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LMAN2Q12907 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LMAN2Q12907 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
LMAN2Q12907 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LMAN2Q12907 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LMAN2Q12907 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LMAN2Q12907 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LMAN2Q12907 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LMAN2Q12907 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LMAN2Q12907 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LMAN2Q12907 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LMAN2Q12907 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LMAN2Q12907 EMC4-201ENST00000249209 852 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LMAN2Q12907 SETD4-205ENST00000399208 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LMAN2Q12907 NGDN-202ENST00000408901 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LMAN2Q12907 H2AFV-206ENST00000437072 589 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LMAN2Q12907 RPL7P3-201ENST00000441388 714 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
LMAN2Q12907 AP000552.1-208ENST00000452952 576 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LMAN2Q12907 TMEM14B-204ENST00000461342 559 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LMAN2Q12907 PLEKHB1-206ENST00000535129 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LMAN2Q12907 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LMAN2Q12907 SCGB1C2-201ENST00000595228 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LMAN2Q12907 LINC02351-201ENST00000614728 289 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LMAN2Q12907 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LMAN2Q12907 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LMAN2Q12907 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LMAN2Q12907 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LMAN2Q12907 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LMAN2Q12907 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LMAN2Q12907 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LMAN2Q12907 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LMAN2Q12907 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LMAN2Q12907 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LMAN2Q12907 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LMAN2Q12907 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LMAN2Q12907 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LMAN2Q12907 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LMAN2Q12907 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LMAN2Q12907 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LMAN2Q12907 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LMAN2Q12907 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LMAN2Q12907 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LMAN2Q12907 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LMAN2Q12907 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LMAN2Q12907 POLD4-201ENST00000312419 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LMAN2Q12907 CATSPERZ-201ENST00000328404 743 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LMAN2Q12907 RNU1-114P-201ENST00000365297 166 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
LMAN2Q12907 RBM8A-201ENST00000369307 796 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LMAN2Q12907 PGGT1BP2-201ENST00000398621 1028 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
LMAN2Q12907 AC018467.1-201ENST00000421581 717 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LMAN2Q12907 USB1-202ENST00000423271 1217 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LMAN2Q12907 DHDDS-206ENST00000427245 868 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LMAN2Q12907 HIST2H2BA-202ENST00000430394 752 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LMAN2Q12907 HLA-DPB2-205ENST00000435074 1188 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
LMAN2Q12907 AC115284.1-201ENST00000488257 547 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LMAN2Q12907 AP001453.3-201ENST00000545800 853 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LMAN2Q12907 AC079316.1-201ENST00000548397 411 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
LMAN2Q12907 GNRHR2-203ENST00000581100 1187 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.7 ms