Protein–RNA interactions for Protein: Q12829

RAB40B, Ras-related protein Rab-40B, humanhuman

Predictions only

Length 278 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB40BQ12829 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
RAB40BQ12829 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
RAB40BQ12829 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
RAB40BQ12829 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC13.96□□□□□ -0.17
RAB40BQ12829 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
RAB40BQ12829 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
RAB40BQ12829 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
RAB40BQ12829 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
RAB40BQ12829 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
RAB40BQ12829 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
RAB40BQ12829 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
RAB40BQ12829 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
RAB40BQ12829 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
RAB40BQ12829 WARS2-202ENST00000369426 2811 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
RAB40BQ12829 KIAA0930-203ENST00000391627 2623 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
RAB40BQ12829 TSC2-203ENST00000382538 5264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
RAB40BQ12829 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
RAB40BQ12829 ZNF683-201ENST00000349618 1610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
RAB40BQ12829 DFNA5-201ENST00000342947 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
RAB40BQ12829 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
RAB40BQ12829 TRIM46-202ENST00000368382 3127 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.18
RAB40BQ12829 ZNF256-201ENST00000282308 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
RAB40BQ12829 AC136759.1-202ENST00000530858 2194 ntBASIC13.96□□□□□ -0.18
RAB40BQ12829 EVL-201ENST00000392920 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
RAB40BQ12829 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.96□□□□□ -0.18
RAB40BQ12829 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
RAB40BQ12829 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC13.96□□□□□ -0.18
RAB40BQ12829 UHRF1-204ENST00000616255 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
RAB40BQ12829 ALDH4A1-205ENST00000538309 1940 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.18
RAB40BQ12829 SLC25A21-AS1-201ENST00000556667 1924 ntBASIC13.96□□□□□ -0.18
RAB40BQ12829 AC027601.5-201ENST00000624065 2482 ntBASIC13.96□□□□□ -0.18
RAB40BQ12829 HIST1H2AG-201ENST00000359193 2250 ntAPPRIS P1 BASIC13.95□□□□□ -0.18
RAB40BQ12829 SCAP-206ENST00000428413 3749 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
RAB40BQ12829 SERP1-201ENST00000239944 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
RAB40BQ12829 DPY19L2P2-201ENST00000312132 4078 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
RAB40BQ12829 INO80-201ENST00000361937 6439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
RAB40BQ12829 BRD1-205ENST00000457780 4997 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
RAB40BQ12829 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
RAB40BQ12829 SRD5A3-201ENST00000264228 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
RAB40BQ12829 ARFGAP1-203ENST00000370283 3281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
RAB40BQ12829 CACTIN-203ENST00000429344 3612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
RAB40BQ12829 OSBPL10-201ENST00000396556 6600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
RAB40BQ12829 UBXN11-206ENST00000374222 2043 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
RAB40BQ12829 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
RAB40BQ12829 MTHFR-210ENST00000641407 2387 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
RAB40BQ12829 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
RAB40BQ12829 IMPACT-201ENST00000284202 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
RAB40BQ12829 ZPBP2-202ENST00000377940 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
RAB40BQ12829 TAF8-203ENST00000372982 1805 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
RAB40BQ12829 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
RAB40BQ12829 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
RAB40BQ12829 PPM1B-205ENST00000409432 3025 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
RAB40BQ12829 ZNF607-201ENST00000355202 4364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
RAB40BQ12829 TERT-201ENST00000310581 4018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
RAB40BQ12829 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
RAB40BQ12829 SRPRA-206ENST00000532259 2453 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
RAB40BQ12829 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
RAB40BQ12829 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
RAB40BQ12829 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
RAB40BQ12829 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
RAB40BQ12829 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
RAB40BQ12829 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
RAB40BQ12829 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
RAB40BQ12829 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
RAB40BQ12829 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
RAB40BQ12829 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
RAB40BQ12829 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
RAB40BQ12829 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
RAB40BQ12829 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
RAB40BQ12829 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
RAB40BQ12829 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
RAB40BQ12829 ANKRD46-205ENST00000520311 3270 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
RAB40BQ12829 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
RAB40BQ12829 NKIRAS2-201ENST00000307641 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
RAB40BQ12829 PODN-207ENST00000618387 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
RAB40BQ12829 COQ7-209ENST00000569127 2575 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
RAB40BQ12829 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
RAB40BQ12829 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
RAB40BQ12829 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
RAB40BQ12829 AC117489.1-201ENST00000625169 3217 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
RAB40BQ12829 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
RAB40BQ12829 COL9A2-202ENST00000372748 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
RAB40BQ12829 ARHGEF26-203ENST00000465817 2353 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
RAB40BQ12829 PAK2-201ENST00000327134 6139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
RAB40BQ12829 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
RAB40BQ12829 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
RAB40BQ12829 RBPMS-201ENST00000287771 2974 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
RAB40BQ12829 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
RAB40BQ12829 PPP1R13L-202ENST00000418234 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
RAB40BQ12829 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
RAB40BQ12829 AAK1-202ENST00000409068 2606 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
RAB40BQ12829 LIN9-201ENST00000328205 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
RAB40BQ12829 TM4SF19-AS1-203ENST00000452051 1829 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
RAB40BQ12829 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
RAB40BQ12829 FGD5-206ENST00000543601 5768 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
RAB40BQ12829 MYH6-202ENST00000405093 5941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
RAB40BQ12829 SLC32A1-201ENST00000217420 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
RAB40BQ12829 AC058822.1-201ENST00000507166 2550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
RAB40BQ12829 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
RAB40BQ12829 PITPNM3-201ENST00000262483 7086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.3 ms