Protein–RNA interactions for Protein: Q0D2K3

RIPPLY1, Protein ripply1, humanhuman

Predictions only

Length 151 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIPPLY1Q0D2K3 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
RIPPLY1Q0D2K3 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
RIPPLY1Q0D2K3 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC13.78□□□□□ -0.2
RIPPLY1Q0D2K3 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
RIPPLY1Q0D2K3 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
RIPPLY1Q0D2K3 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC13.78□□□□□ -0.2
RIPPLY1Q0D2K3 PALD1-201ENST00000263563 4555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
RIPPLY1Q0D2K3 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
RIPPLY1Q0D2K3 PCDHGB1-202ENST00000611598 2592 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
RIPPLY1Q0D2K3 PPP2R1A-201ENST00000322088 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
RIPPLY1Q0D2K3 CA10-201ENST00000285273 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
RIPPLY1Q0D2K3 B4GALNT1-201ENST00000341156 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
RIPPLY1Q0D2K3 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.2
RIPPLY1Q0D2K3 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
RIPPLY1Q0D2K3 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
RIPPLY1Q0D2K3 FLI1-201ENST00000281428 4151 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
RIPPLY1Q0D2K3 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
RIPPLY1Q0D2K3 TRIM45-201ENST00000256649 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
RIPPLY1Q0D2K3 NEIL2-201ENST00000284503 2671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
RIPPLY1Q0D2K3 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
RIPPLY1Q0D2K3 MKRN3-201ENST00000314520 2337 ntAPPRIS P1 BASIC13.77□□□□□ -0.21
RIPPLY1Q0D2K3 IQCE-201ENST00000325979 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
RIPPLY1Q0D2K3 PORCN-201ENST00000326194 1755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
RIPPLY1Q0D2K3 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
RIPPLY1Q0D2K3 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
RIPPLY1Q0D2K3 RUSC1-202ENST00000368347 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
RIPPLY1Q0D2K3 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
RIPPLY1Q0D2K3 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
RIPPLY1Q0D2K3 TMPRSS6-202ENST00000381792 3260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
RIPPLY1Q0D2K3 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
RIPPLY1Q0D2K3 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
RIPPLY1Q0D2K3 SCAMP4-202ENST00000409472 2394 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
RIPPLY1Q0D2K3 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
RIPPLY1Q0D2K3 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
RIPPLY1Q0D2K3 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
RIPPLY1Q0D2K3 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
RIPPLY1Q0D2K3 DENND3-211ENST00000519811 5482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
RIPPLY1Q0D2K3 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
RIPPLY1Q0D2K3 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
RIPPLY1Q0D2K3 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
RIPPLY1Q0D2K3 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
RIPPLY1Q0D2K3 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC13.77□□□□□ -0.21
RIPPLY1Q0D2K3 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
RIPPLY1Q0D2K3 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
RIPPLY1Q0D2K3 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
RIPPLY1Q0D2K3 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
RIPPLY1Q0D2K3 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
RIPPLY1Q0D2K3 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
RIPPLY1Q0D2K3 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
RIPPLY1Q0D2K3 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
RIPPLY1Q0D2K3 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
RIPPLY1Q0D2K3 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
RIPPLY1Q0D2K3 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
RIPPLY1Q0D2K3 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
RIPPLY1Q0D2K3 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
RIPPLY1Q0D2K3 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
RIPPLY1Q0D2K3 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
RIPPLY1Q0D2K3 ZNF70-201ENST00000341976 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
RIPPLY1Q0D2K3 CCDC6-201ENST00000263102 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
RIPPLY1Q0D2K3 ARHGEF28-202ENST00000296799 4424 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
RIPPLY1Q0D2K3 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
RIPPLY1Q0D2K3 RBFADN-204ENST00000568911 5187 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
RIPPLY1Q0D2K3 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
RIPPLY1Q0D2K3 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
RIPPLY1Q0D2K3 COL6A3-206ENST00000409809 8916 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
RIPPLY1Q0D2K3 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
RIPPLY1Q0D2K3 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
RIPPLY1Q0D2K3 CSNK1A1P1-201ENST00000430593 2147 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
RIPPLY1Q0D2K3 HNRNPDL-208ENST00000621267 4139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
RIPPLY1Q0D2K3 TERT-201ENST00000310581 4018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
RIPPLY1Q0D2K3 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
RIPPLY1Q0D2K3 AFAP1-201ENST00000358461 7516 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
RIPPLY1Q0D2K3 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
RIPPLY1Q0D2K3 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
RIPPLY1Q0D2K3 AL731571.1-201ENST00000617058 5428 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
RIPPLY1Q0D2K3 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
RIPPLY1Q0D2K3 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
RIPPLY1Q0D2K3 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
RIPPLY1Q0D2K3 TGIF2-202ENST00000373874 3432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
RIPPLY1Q0D2K3 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
RIPPLY1Q0D2K3 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
RIPPLY1Q0D2K3 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
RIPPLY1Q0D2K3 AC114490.1-201ENST00000417456 3163 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
RIPPLY1Q0D2K3 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
RIPPLY1Q0D2K3 GALNTL6-205ENST00000511251 2905 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
RIPPLY1Q0D2K3 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
RIPPLY1Q0D2K3 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
RIPPLY1Q0D2K3 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
RIPPLY1Q0D2K3 CECR7-202ENST00000441006 2726 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
RIPPLY1Q0D2K3 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
RIPPLY1Q0D2K3 WDR20-203ENST00000335263 2616 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
RIPPLY1Q0D2K3 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
RIPPLY1Q0D2K3 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
RIPPLY1Q0D2K3 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
RIPPLY1Q0D2K3 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
RIPPLY1Q0D2K3 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
RIPPLY1Q0D2K3 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
RIPPLY1Q0D2K3 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
RIPPLY1Q0D2K3 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
RIPPLY1Q0D2K3 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms