Protein–RNA interactions for Protein: Q07627

KRTAP1-1, Keratin-associated protein 1-1, humanhuman

Predictions only

Length 177 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP1-1Q07627 AGER-201ENST00000375055 1369 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
KRTAP1-1Q07627 SMTNL1-202ENST00000527972 1649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
KRTAP1-1Q07627 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
KRTAP1-1Q07627 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
KRTAP1-1Q07627 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
KRTAP1-1Q07627 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
KRTAP1-1Q07627 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
KRTAP1-1Q07627 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
KRTAP1-1Q07627 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
KRTAP1-1Q07627 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
KRTAP1-1Q07627 TMEM51-204ENST00000428417 1942 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.25□□□□□ -0.45
KRTAP1-1Q07627 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
KRTAP1-1Q07627 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
KRTAP1-1Q07627 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
KRTAP1-1Q07627 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
KRTAP1-1Q07627 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
KRTAP1-1Q07627 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
KRTAP1-1Q07627 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
KRTAP1-1Q07627 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
KRTAP1-1Q07627 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
KRTAP1-1Q07627 MSR1-201ENST00000262101 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
KRTAP1-1Q07627 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
KRTAP1-1Q07627 KRT17-201ENST00000311208 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
KRTAP1-1Q07627 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
KRTAP1-1Q07627 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
KRTAP1-1Q07627 CRHR2-202ENST00000348438 1600 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
KRTAP1-1Q07627 PPIE-202ENST00000356511 1079 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
KRTAP1-1Q07627 SOD2-202ENST00000367054 815 ntTSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
KRTAP1-1Q07627 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
KRTAP1-1Q07627 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
KRTAP1-1Q07627 MAGEB2-201ENST00000378988 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
KRTAP1-1Q07627 ASB3-202ENST00000394717 1734 ntTSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
KRTAP1-1Q07627 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
KRTAP1-1Q07627 SETD7-203ENST00000406354 1127 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
KRTAP1-1Q07627 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC12.24□□□□□ -0.45
KRTAP1-1Q07627 AL391119.1-201ENST00000416563 271 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
KRTAP1-1Q07627 NTF3-202ENST00000423158 1336 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
KRTAP1-1Q07627 AC012362.1-201ENST00000434906 739 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
KRTAP1-1Q07627 UBXN7-AS1-201ENST00000442941 386 ntTSL 3 BASIC12.24□□□□□ -0.45
KRTAP1-1Q07627 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
KRTAP1-1Q07627 AC012507.1-201ENST00000454890 600 ntTSL 4 BASIC12.24□□□□□ -0.45
KRTAP1-1Q07627 PPOX-204ENST00000462866 473 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
KRTAP1-1Q07627 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
KRTAP1-1Q07627 FXYD2-205ENST00000528014 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.24□□□□□ -0.45
KRTAP1-1Q07627 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.24□□□□□ -0.45
KRTAP1-1Q07627 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
KRTAP1-1Q07627 ZSCAN10-205ENST00000572548 618 ntTSL 3 BASIC12.24□□□□□ -0.45
KRTAP1-1Q07627 NRN1L-202ENST00000576147 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
KRTAP1-1Q07627 AC145343.1-201ENST00000579629 650 ntTSL 3 BASIC12.24□□□□□ -0.45
KRTAP1-1Q07627 UBA52-208ENST00000596304 554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
KRTAP1-1Q07627 IRF3-225ENST00000600022 882 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
KRTAP1-1Q07627 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
KRTAP1-1Q07627 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
KRTAP1-1Q07627 IDH3B-212ENST00000613370 1400 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
KRTAP1-1Q07627 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
KRTAP1-1Q07627 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
KRTAP1-1Q07627 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC12.24□□□□□ -0.45
KRTAP1-1Q07627 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
KRTAP1-1Q07627 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
KRTAP1-1Q07627 MIR6858-201ENST00000620733 67 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
KRTAP1-1Q07627 RABL6-211ENST00000629216 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
KRTAP1-1Q07627 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
KRTAP1-1Q07627 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
KRTAP1-1Q07627 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
KRTAP1-1Q07627 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
KRTAP1-1Q07627 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
KRTAP1-1Q07627 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
KRTAP1-1Q07627 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
KRTAP1-1Q07627 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
KRTAP1-1Q07627 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
KRTAP1-1Q07627 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
KRTAP1-1Q07627 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
KRTAP1-1Q07627 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
KRTAP1-1Q07627 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
KRTAP1-1Q07627 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
KRTAP1-1Q07627 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
KRTAP1-1Q07627 ATP6AP2-213ENST00000636251 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
KRTAP1-1Q07627 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
KRTAP1-1Q07627 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
KRTAP1-1Q07627 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
KRTAP1-1Q07627 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
KRTAP1-1Q07627 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
KRTAP1-1Q07627 PEF1-201ENST00000373703 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
KRTAP1-1Q07627 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
KRTAP1-1Q07627 MAP2K6-205ENST00000589647 1512 ntTSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
KRTAP1-1Q07627 RPP40-202ENST00000380051 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
KRTAP1-1Q07627 MYADM-202ENST00000391768 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
KRTAP1-1Q07627 PLEKHB2-207ENST00000438882 1460 ntTSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
KRTAP1-1Q07627 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
KRTAP1-1Q07627 SYCN-201ENST00000318438 573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
KRTAP1-1Q07627 COX8C-201ENST00000342144 533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
KRTAP1-1Q07627 RHOG-203ENST00000396979 1289 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.23□□□□□ -0.45
KRTAP1-1Q07627 NUBP1-202ENST00000433392 1185 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
KRTAP1-1Q07627 AC026320.2-201ENST00000434379 478 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
KRTAP1-1Q07627 LINC00466-203ENST00000436475 1059 ntTSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
KRTAP1-1Q07627 TCERG1L-AS1-201ENST00000436942 472 ntTSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
KRTAP1-1Q07627 CSHL1-205ENST00000438387 566 ntTSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
KRTAP1-1Q07627 TREX1-202ENST00000444177 1200 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
KRTAP1-1Q07627 BUD31-205ENST00000456893 512 ntTSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
KRTAP1-1Q07627 RPL18AP3-201ENST00000462885 528 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms