Protein–RNA interactions for Protein: Q06124

PTPN11, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 11, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 597 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN11Q06124 LCN9-204ENST00000619315 528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PTPN11Q06124 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PTPN11Q06124 RHD-204ENST00000417538 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PTPN11Q06124 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PTPN11Q06124 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PTPN11Q06124 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PTPN11Q06124 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PTPN11Q06124 FANCA-213ENST00000563673 1694 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PTPN11Q06124 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PTPN11Q06124 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PTPN11Q06124 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PTPN11Q06124 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PTPN11Q06124 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
PTPN11Q06124 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PTPN11Q06124 TEX13B-201ENST00000302917 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PTPN11Q06124 TPM3P8-201ENST00000330554 643 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
PTPN11Q06124 RNU1-114P-201ENST00000365297 166 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
PTPN11Q06124 MPV17-205ENST00000402310 906 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PTPN11Q06124 AC099552.1-201ENST00000431083 744 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PTPN11Q06124 CR589904.1-201ENST00000437830 732 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PTPN11Q06124 AL450003.2-201ENST00000450445 428 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PTPN11Q06124 AL590640.2-201ENST00000457038 527 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
PTPN11Q06124 XXYLT1-AS1-201ENST00000458531 431 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PTPN11Q06124 GTF2H2-204ENST00000517900 659 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PTPN11Q06124 AC005833.2-201ENST00000527518 1249 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PTPN11Q06124 UBXN1-218ENST00000616865 1002 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PTPN11Q06124 ECSIT-209ENST00000591104 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PTPN11Q06124 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PTPN11Q06124 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PTPN11Q06124 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PTPN11Q06124 AC138028.6-201ENST00000616106 1482 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
PTPN11Q06124 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PTPN11Q06124 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PTPN11Q06124 SNRPN-202ENST00000390687 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PTPN11Q06124 AL365199.1-201ENST00000421320 1714 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PTPN11Q06124 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PTPN11Q06124 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PTPN11Q06124 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PTPN11Q06124 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PTPN11Q06124 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PTPN11Q06124 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PTPN11Q06124 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PTPN11Q06124 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PTPN11Q06124 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PTPN11Q06124 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PTPN11Q06124 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PTPN11Q06124 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PTPN11Q06124 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PTPN11Q06124 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PTPN11Q06124 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PTPN11Q06124 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PTPN11Q06124 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PTPN11Q06124 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PTPN11Q06124 RPS15-201ENST00000233609 534 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PTPN11Q06124 DUSP23-202ENST00000368108 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PTPN11Q06124 AL157392.1-201ENST00000412388 373 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PTPN11Q06124 AC004945.1-201ENST00000416738 983 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
PTPN11Q06124 AC127070.2-201ENST00000424075 555 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PTPN11Q06124 AC006003.1-201ENST00000448541 613 ntTSL 4 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PTPN11Q06124 ARL16-210ENST00000574938 751 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PTPN11Q06124 AC104982.3-201ENST00000581995 514 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
PTPN11Q06124 PRCD-204ENST00000586148 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PTPN11Q06124 RPS15-205ENST00000586686 562 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PTPN11Q06124 CYGB-203ENST00000589145 788 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PTPN11Q06124 LINC00479-204ENST00000589300 718 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PTPN11Q06124 ANGPTL8-203ENST00000591200 504 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PTPN11Q06124 RPS15-208ENST00000591804 711 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PTPN11Q06124 PRCD-210ENST00000592014 462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PTPN11Q06124 RPS15-209ENST00000592588 510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PTPN11Q06124 OCEL1-213ENST00000601529 942 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PTPN11Q06124 LINC01233-203ENST00000601708 494 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PTPN11Q06124 AC106872.11-201ENST00000605838 421 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
PTPN11Q06124 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
PTPN11Q06124 Metazoa_SRP.166-201ENST00000612530 253 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
PTPN11Q06124 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PTPN11Q06124 CENPBD1P1-204ENST00000487264 1308 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PTPN11Q06124 HARS-202ENST00000415192 1401 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PTPN11Q06124 DMAC2-204ENST00000438807 1454 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PTPN11Q06124 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PTPN11Q06124 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PTPN11Q06124 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PTPN11Q06124 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PTPN11Q06124 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PTPN11Q06124 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PTPN11Q06124 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PTPN11Q06124 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PTPN11Q06124 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PTPN11Q06124 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
PTPN11Q06124 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.33
PTPN11Q06124 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
PTPN11Q06124 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
PTPN11Q06124 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
PTPN11Q06124 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
PTPN11Q06124 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
PTPN11Q06124 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
PTPN11Q06124 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
PTPN11Q06124 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
PTPN11Q06124 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
PTPN11Q06124 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
PTPN11Q06124 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 91.7 ms