Protein–RNA interactions for Protein: P98173

FAM3A, Protein FAM3A, humanhuman

Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM3AP98173 ATG2A-201ENST00000377264 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
FAM3AP98173 SRRT-217ENST00000618411 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
FAM3AP98173 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
FAM3AP98173 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
FAM3AP98173 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
FAM3AP98173 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
FAM3AP98173 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
FAM3AP98173 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
FAM3AP98173 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
FAM3AP98173 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
FAM3AP98173 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
FAM3AP98173 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
FAM3AP98173 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
FAM3AP98173 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
FAM3AP98173 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
FAM3AP98173 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
FAM3AP98173 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
FAM3AP98173 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
FAM3AP98173 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
FAM3AP98173 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
FAM3AP98173 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
FAM3AP98173 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
FAM3AP98173 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
FAM3AP98173 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
FAM3AP98173 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
FAM3AP98173 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
FAM3AP98173 DEGS2-201ENST00000305631 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
FAM3AP98173 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
FAM3AP98173 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
FAM3AP98173 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
FAM3AP98173 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
FAM3AP98173 BBS1-225ENST00000630659 1934 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
FAM3AP98173 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
FAM3AP98173 MEGF10-202ENST00000418761 2238 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
FAM3AP98173 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
FAM3AP98173 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
FAM3AP98173 FOXB1-201ENST00000396057 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
FAM3AP98173 REPIN1-209ENST00000479668 3182 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
FAM3AP98173 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
FAM3AP98173 RNASEH2B-202ENST00000422660 4830 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
FAM3AP98173 COBL-203ENST00000395542 5339 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
FAM3AP98173 OPA1-204ENST00000361828 6381 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
FAM3AP98173 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
FAM3AP98173 DCTN1-203ENST00000409240 4365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
FAM3AP98173 CYB561D1-204ENST00000420578 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
FAM3AP98173 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
FAM3AP98173 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
FAM3AP98173 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
FAM3AP98173 RHOXF1P3-203ENST00000640298 2668 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
FAM3AP98173 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
FAM3AP98173 ARHGEF16-201ENST00000378371 2219 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
FAM3AP98173 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
FAM3AP98173 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
FAM3AP98173 PRPS1-204ENST00000372435 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
FAM3AP98173 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
FAM3AP98173 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
FAM3AP98173 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
FAM3AP98173 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
FAM3AP98173 UNC13B-203ENST00000396787 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
FAM3AP98173 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
FAM3AP98173 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
FAM3AP98173 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
FAM3AP98173 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
FAM3AP98173 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
FAM3AP98173 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
FAM3AP98173 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
FAM3AP98173 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
FAM3AP98173 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
FAM3AP98173 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
FAM3AP98173 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
FAM3AP98173 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
FAM3AP98173 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
FAM3AP98173 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
FAM3AP98173 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC13.51□□□□□ -0.25
FAM3AP98173 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
FAM3AP98173 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
FAM3AP98173 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
FAM3AP98173 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
FAM3AP98173 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
FAM3AP98173 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
FAM3AP98173 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
FAM3AP98173 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
FAM3AP98173 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
FAM3AP98173 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
FAM3AP98173 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
FAM3AP98173 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
FAM3AP98173 ADAM15-204ENST00000359280 2874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
FAM3AP98173 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
FAM3AP98173 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
FAM3AP98173 TSPAN14-210ENST00000616406 2436 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
FAM3AP98173 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
FAM3AP98173 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
FAM3AP98173 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
FAM3AP98173 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
FAM3AP98173 ZNF334-202ENST00000457685 3487 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
FAM3AP98173 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
FAM3AP98173 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
FAM3AP98173 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
FAM3AP98173 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
FAM3AP98173 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.9 ms