Protein–RNA interactions for Protein: P81133

SIM1, Single-minded homolog 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 766 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIM1P81133 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SIM1P81133 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SIM1P81133 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SIM1P81133 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SIM1P81133 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SIM1P81133 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SIM1P81133 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SIM1P81133 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SIM1P81133 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SIM1P81133 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SIM1P81133 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SIM1P81133 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SIM1P81133 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
SIM1P81133 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SIM1P81133 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SIM1P81133 CBX3-203ENST00000409747 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SIM1P81133 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
SIM1P81133 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SIM1P81133 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SIM1P81133 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SIM1P81133 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SIM1P81133 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SIM1P81133 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SIM1P81133 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SIM1P81133 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SIM1P81133 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SIM1P81133 PGPEP1-201ENST00000252813 1409 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SIM1P81133 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SIM1P81133 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SIM1P81133 TEAD4-203ENST00000397122 1396 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SIM1P81133 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SIM1P81133 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SIM1P81133 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SIM1P81133 NEU2-201ENST00000233840 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SIM1P81133 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SIM1P81133 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SIM1P81133 DUSP13-202ENST00000372700 781 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SIM1P81133 ZNF248-202ENST00000374648 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SIM1P81133 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
SIM1P81133 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SIM1P81133 AL929472.3-201ENST00000433474 700 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SIM1P81133 FGF13-204ENST00000436198 1165 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SIM1P81133 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
SIM1P81133 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SIM1P81133 CNGA4-202ENST00000533426 936 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SIM1P81133 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SIM1P81133 MIR4741-201ENST00000579822 90 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
SIM1P81133 AC020914.3-201ENST00000594712 304 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
SIM1P81133 KLK3-211ENST00000597483 810 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SIM1P81133 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SIM1P81133 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SIM1P81133 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SIM1P81133 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SIM1P81133 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SIM1P81133 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SIM1P81133 ST7L-207ENST00000369669 1743 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SIM1P81133 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
SIM1P81133 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SIM1P81133 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SIM1P81133 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SIM1P81133 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SIM1P81133 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SIM1P81133 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SIM1P81133 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SIM1P81133 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SIM1P81133 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SIM1P81133 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SIM1P81133 KLHDC3-203ENST00000332245 1494 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SIM1P81133 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SIM1P81133 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SIM1P81133 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SIM1P81133 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SIM1P81133 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SIM1P81133 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SIM1P81133 SPIN2A-201ENST00000374906 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SIM1P81133 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SIM1P81133 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SIM1P81133 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SIM1P81133 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SIM1P81133 NAT8-201ENST00000272425 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SIM1P81133 EMC3-AS1-202ENST00000366264 559 ntTSL 4 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SIM1P81133 PGGT1B-202ENST00000379615 903 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SIM1P81133 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SIM1P81133 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
SIM1P81133 CNN2P8-201ENST00000421872 913 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
SIM1P81133 AL591846.1-201ENST00000451736 433 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
SIM1P81133 AC074194.1-201ENST00000505025 622 ntTSL 4 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SIM1P81133 ADM-202ENST00000524948 584 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SIM1P81133 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SIM1P81133 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SIM1P81133 AC105129.2-201ENST00000559536 390 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
SIM1P81133 SSTR5-AS1-201ENST00000565992 575 ntTSL 4 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SIM1P81133 AC025810.1-201ENST00000569986 981 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SIM1P81133 PRCD-204ENST00000586148 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SIM1P81133 PRCD-210ENST00000592014 462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SIM1P81133 U62317.3-201ENST00000608319 855 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
SIM1P81133 AL445288.1-201ENST00000610846 654 ntTSL 4 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SIM1P81133 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SIM1P81133 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
SIM1P81133 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.6 ms