Protein–RNA interactions for Protein: P62995

TRA2B, Transformer-2 protein homolog beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 288 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRA2BP62995 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TRA2BP62995 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
TRA2BP62995 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TRA2BP62995 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TRA2BP62995 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TRA2BP62995 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TRA2BP62995 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TRA2BP62995 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TRA2BP62995 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
TRA2BP62995 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TRA2BP62995 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TRA2BP62995 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TRA2BP62995 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TRA2BP62995 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TRA2BP62995 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TRA2BP62995 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TRA2BP62995 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TRA2BP62995 POR-201ENST00000394893 2532 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TRA2BP62995 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TRA2BP62995 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TRA2BP62995 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TRA2BP62995 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TRA2BP62995 GPI-205ENST00000586425 1799 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TRA2BP62995 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TRA2BP62995 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TRA2BP62995 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TRA2BP62995 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.07
TRA2BP62995 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRA2BP62995 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRA2BP62995 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRA2BP62995 JAKMIP1-205ENST00000410077 1835 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRA2BP62995 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRA2BP62995 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRA2BP62995 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
TRA2BP62995 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRA2BP62995 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRA2BP62995 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRA2BP62995 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRA2BP62995 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRA2BP62995 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRA2BP62995 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRA2BP62995 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
TRA2BP62995 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRA2BP62995 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRA2BP62995 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRA2BP62995 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
TRA2BP62995 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRA2BP62995 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRA2BP62995 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRA2BP62995 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRA2BP62995 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
TRA2BP62995 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRA2BP62995 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRA2BP62995 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRA2BP62995 RRP7BP-205ENST00000566851 833 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
TRA2BP62995 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRA2BP62995 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
TRA2BP62995 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
TRA2BP62995 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRA2BP62995 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRA2BP62995 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRA2BP62995 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRA2BP62995 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRA2BP62995 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRA2BP62995 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
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TRA2BP62995 PXYLP1-201ENST00000286353 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRA2BP62995 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRA2BP62995 INPP5D-201ENST00000359570 5274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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TRA2BP62995 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRA2BP62995 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRA2BP62995 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRA2BP62995 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRA2BP62995 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
TRA2BP62995 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRA2BP62995 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRA2BP62995 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRA2BP62995 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRA2BP62995 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRA2BP62995 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
TRA2BP62995 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRA2BP62995 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRA2BP62995 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRA2BP62995 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRA2BP62995 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRA2BP62995 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRA2BP62995 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRA2BP62995 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRA2BP62995 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRA2BP62995 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRA2BP62995 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRA2BP62995 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRA2BP62995 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRA2BP62995 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRA2BP62995 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRA2BP62995 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRA2BP62995 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRA2BP62995 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
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