Protein–RNA interactions for Protein: P61601

NCALD, Neurocalcin-delta, humanhuman

Predictions only

Length 193 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCALDP61601 RASGEF1A-202ENST00000374459 3264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NCALDP61601 FAM90A1-203ENST00000538603 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NCALDP61601 EGFR-206ENST00000454757 5464 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NCALDP61601 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NCALDP61601 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NCALDP61601 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NCALDP61601 SRP54-202ENST00000546080 2187 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NCALDP61601 PITPNM1-216ENST00000534749 4189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NCALDP61601 AC022400.6-201ENST00000603027 5818 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NCALDP61601 TCOF1-201ENST00000323668 4832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NCALDP61601 GLIPR1L2-204ENST00000550916 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NCALDP61601 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NCALDP61601 TLE1-203ENST00000376499 3893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NCALDP61601 CD6-201ENST00000313421 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NCALDP61601 SYT13-201ENST00000020926 5144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NCALDP61601 KIAA1468-202ENST00000398130 6178 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NCALDP61601 OR2I1P-209ENST00000641730 5365 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
NCALDP61601 DYDC2-204ENST00000372199 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NCALDP61601 RALGPS2-204ENST00000367635 5834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NCALDP61601 KIAA0513-207ENST00000567328 1873 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NCALDP61601 UNC13A-202ENST00000519716 9838 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NCALDP61601 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NCALDP61601 UNC5A-201ENST00000329542 3812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NCALDP61601 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NCALDP61601 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NCALDP61601 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NCALDP61601 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NCALDP61601 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
NCALDP61601 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NCALDP61601 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NCALDP61601 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
NCALDP61601 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NCALDP61601 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NCALDP61601 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NCALDP61601 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NCALDP61601 ZNF516-201ENST00000443185 8118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NCALDP61601 SLC22A12-202ENST00000377567 2599 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NCALDP61601 USP48-213ENST00000529637 3228 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NCALDP61601 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NCALDP61601 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NCALDP61601 NCOR2-203ENST00000404621 8520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NCALDP61601 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NCALDP61601 CAMK2D-205ENST00000394524 5294 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NCALDP61601 MFAP3-201ENST00000322602 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NCALDP61601 KLHL13-207ENST00000540167 3396 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NCALDP61601 TLN1-201ENST00000314888 8823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NCALDP61601 KIF1C-201ENST00000320785 7919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NCALDP61601 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NCALDP61601 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NCALDP61601 ENDOV-206ENST00000518901 2549 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NCALDP61601 LSS-211ENST00000522411 2523 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NCALDP61601 UBR2-201ENST00000372899 7857 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NCALDP61601 UBR2-202ENST00000372901 7857 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NCALDP61601 TAGLN2-202ENST00000368096 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NCALDP61601 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NCALDP61601 KCNT1-209ENST00000490355 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NCALDP61601 WSCD1-201ENST00000317744 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NCALDP61601 GTF2IRD1-205ENST00000476977 5868 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NCALDP61601 NDUFS7-202ENST00000313408 2818 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NCALDP61601 ADD3-202ENST00000356080 3081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NCALDP61601 DNAJA1-201ENST00000330899 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NCALDP61601 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NCALDP61601 TNS2-201ENST00000314250 5010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NCALDP61601 ABCA7-203ENST00000435683 6211 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NCALDP61601 AC109583.3-201ENST00000641183 3128 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NCALDP61601 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NCALDP61601 EHF-210ENST00000531794 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NCALDP61601 C1orf43-206ENST00000368521 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NCALDP61601 BEND6-203ENST00000370748 3497 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NCALDP61601 DNER-201ENST00000341772 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NCALDP61601 CDCA7-202ENST00000347703 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NCALDP61601 HDAC9-208ENST00000417496 2524 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NCALDP61601 SERPINA4-203ENST00000557004 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NCALDP61601 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NCALDP61601 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NCALDP61601 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NCALDP61601 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NCALDP61601 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NCALDP61601 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NCALDP61601 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NCALDP61601 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NCALDP61601 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NCALDP61601 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NCALDP61601 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NCALDP61601 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NCALDP61601 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NCALDP61601 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NCALDP61601 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NCALDP61601 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
NCALDP61601 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NCALDP61601 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NCALDP61601 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NCALDP61601 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NCALDP61601 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NCALDP61601 FAM219A-203ENST00000379080 3591 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NCALDP61601 SPEG-201ENST00000312358 10782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NCALDP61601 CARHSP1-220ENST00000619881 2849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NCALDP61601 AL669831.1-201ENST00000506640 6432 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NCALDP61601 EML4-201ENST00000318522 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NCALDP61601 ADAMTS14-202ENST00000373208 5269 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.2 ms