Protein–RNA interactions for Protein: P60880

SNAP25, Synaptosomal-associated protein 25, humanhuman

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAP25P60880 AL590640.2-201ENST00000457038 527 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
SNAP25P60880 POLR2F-208ENST00000470701 584 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SNAP25P60880 STAG3L5P-205ENST00000473757 1255 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SNAP25P60880 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SNAP25P60880 AP000812.2-201ENST00000538934 718 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
SNAP25P60880 KRT90P-201ENST00000549264 1064 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
SNAP25P60880 AL583810.1-201ENST00000553344 1045 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
SNAP25P60880 AC105020.3-201ENST00000566036 560 ntTSL 4 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SNAP25P60880 MIR4538-201ENST00000581377 78 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
SNAP25P60880 AP005019.2-201ENST00000615104 511 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
SNAP25P60880 FP236240.1-202ENST00000624019 601 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SNAP25P60880 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SNAP25P60880 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SNAP25P60880 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SNAP25P60880 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SNAP25P60880 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SNAP25P60880 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SNAP25P60880 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SNAP25P60880 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SNAP25P60880 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SNAP25P60880 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SNAP25P60880 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SNAP25P60880 TRMO-203ENST00000375119 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SNAP25P60880 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SNAP25P60880 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SNAP25P60880 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SNAP25P60880 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SNAP25P60880 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SNAP25P60880 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SNAP25P60880 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SNAP25P60880 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SNAP25P60880 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SNAP25P60880 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SNAP25P60880 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SNAP25P60880 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SNAP25P60880 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SNAP25P60880 NTMT1-202ENST00000372481 741 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SNAP25P60880 SPEG-202ENST00000396686 1086 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SNAP25P60880 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SNAP25P60880 SEPT7P9-202ENST00000489259 743 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SNAP25P60880 AC092658.1-201ENST00000505836 891 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
SNAP25P60880 AL163974.1-201ENST00000554540 466 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SNAP25P60880 ANAPC11-216ENST00000579133 563 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SNAP25P60880 SPATA21-206ENST00000612240 603 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SNAP25P60880 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SNAP25P60880 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SNAP25P60880 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SNAP25P60880 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SNAP25P60880 SULT2B1-202ENST00000323090 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SNAP25P60880 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SNAP25P60880 CHI3L2-212ENST00000524472 1435 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SNAP25P60880 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SNAP25P60880 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SNAP25P60880 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SNAP25P60880 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SNAP25P60880 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SNAP25P60880 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SNAP25P60880 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SNAP25P60880 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SNAP25P60880 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SNAP25P60880 KRT8P35-201ENST00000483942 1338 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
SNAP25P60880 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SNAP25P60880 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SNAP25P60880 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SNAP25P60880 FAM86MP-201ENST00000340703 885 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
SNAP25P60880 GZMB-202ENST00000382540 816 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SNAP25P60880 MASP2-202ENST00000400898 726 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SNAP25P60880 BLVRA-202ENST00000402924 1161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SNAP25P60880 ROPN1-202ENST00000405845 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SNAP25P60880 KLF2P2-201ENST00000416807 1039 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
SNAP25P60880 AC128709.1-201ENST00000445908 600 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SNAP25P60880 BX322559.1-201ENST00000456613 319 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SNAP25P60880 HOXC-AS3-201ENST00000509870 544 ntTSL 4 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SNAP25P60880 AC025279.2-201ENST00000569730 653 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
SNAP25P60880 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SNAP25P60880 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SNAP25P60880 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SNAP25P60880 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SNAP25P60880 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SNAP25P60880 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SNAP25P60880 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SNAP25P60880 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SNAP25P60880 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SNAP25P60880 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SNAP25P60880 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
SNAP25P60880 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SNAP25P60880 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SNAP25P60880 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SNAP25P60880 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SNAP25P60880 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SNAP25P60880 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SNAP25P60880 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SNAP25P60880 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SNAP25P60880 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SNAP25P60880 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SNAP25P60880 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SNAP25P60880 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SNAP25P60880 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SNAP25P60880 AL138709.1-201ENST00000614840 1693 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
SNAP25P60880 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms