Protein–RNA interactions for Protein: P57053

H2BFS, Histone H2B type F-S, humanhuman

Predictions only

Length 126 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2BFSP57053 PDP1-203ENST00000517764 2140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
H2BFSP57053 HADH-202ENST00000403312 1752 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
H2BFSP57053 MORC4-202ENST00000355610 3834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
H2BFSP57053 HGNC:18790-201ENST00000397958 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
H2BFSP57053 PIANP-202ENST00000534837 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
H2BFSP57053 NDRG4-255ENST00000570248 3207 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
H2BFSP57053 TOMM34-201ENST00000372813 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
H2BFSP57053 JPH3-201ENST00000284262 3985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
H2BFSP57053 GDPD5-201ENST00000336898 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
H2BFSP57053 CLPB-209ENST00000538039 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
H2BFSP57053 FAAP100-201ENST00000327787 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
H2BFSP57053 AC092506.1-201ENST00000634580 2275 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
H2BFSP57053 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
H2BFSP57053 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
H2BFSP57053 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
H2BFSP57053 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
H2BFSP57053 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
H2BFSP57053 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
H2BFSP57053 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
H2BFSP57053 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
H2BFSP57053 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
H2BFSP57053 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
H2BFSP57053 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
H2BFSP57053 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
H2BFSP57053 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
H2BFSP57053 KCNAB2-219ENST00000602612 2396 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
H2BFSP57053 VWA5B2-202ENST00000426955 4120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
H2BFSP57053 USP44-203ENST00000537435 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
H2BFSP57053 NID1-201ENST00000264187 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
H2BFSP57053 FFAR4-202ENST00000371483 3653 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
H2BFSP57053 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
H2BFSP57053 PCK2-216ENST00000561286 2012 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
H2BFSP57053 C9orf139-202ENST00000623196 4990 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
H2BFSP57053 MLXIPL-204ENST00000414749 3224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
H2BFSP57053 DDO-202ENST00000368924 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
H2BFSP57053 CALD1-206ENST00000424922 2124 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
H2BFSP57053 ADCY2-201ENST00000338316 6575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
H2BFSP57053 SNAP29-201ENST00000215730 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
H2BFSP57053 FADS2-201ENST00000257261 2964 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
H2BFSP57053 PPM1M-201ENST00000296487 2429 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
H2BFSP57053 ZMYND15-204ENST00000573751 2409 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
H2BFSP57053 KCNH4-201ENST00000264661 3920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
H2BFSP57053 DDX41-208ENST00000507955 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
H2BFSP57053 AL591122.2-201ENST00000624125 1853 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
H2BFSP57053 NAA60-202ENST00000407558 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
H2BFSP57053 BARHL2-201ENST00000370445 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
H2BFSP57053 AL357054.3-201ENST00000607084 2055 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
H2BFSP57053 RTF1-201ENST00000389629 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
H2BFSP57053 LINC00987-201ENST00000427111 2472 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
H2BFSP57053 POLL-204ENST00000370168 1536 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
H2BFSP57053 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
H2BFSP57053 DYSF-201ENST00000258104 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
H2BFSP57053 DYSF-204ENST00000409582 6790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
H2BFSP57053 DYSF-210ENST00000413539 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
H2BFSP57053 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
H2BFSP57053 EHMT2-201ENST00000375528 4047 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
H2BFSP57053 CAMKK2-201ENST00000324774 5598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
H2BFSP57053 B3GNT5-202ENST00000460419 3368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
H2BFSP57053 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
H2BFSP57053 RCAN3-207ENST00000538532 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
H2BFSP57053 SAFB-211ENST00000592224 3014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
H2BFSP57053 TOLLIP-202ENST00000317204 3617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
H2BFSP57053 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
H2BFSP57053 LMO4-201ENST00000370542 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
H2BFSP57053 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
H2BFSP57053 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
H2BFSP57053 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
H2BFSP57053 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
H2BFSP57053 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
H2BFSP57053 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
H2BFSP57053 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
H2BFSP57053 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
H2BFSP57053 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
H2BFSP57053 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
H2BFSP57053 RALGAPA1-203ENST00000389698 7864 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
H2BFSP57053 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
H2BFSP57053 PNMA1-201ENST00000316836 2590 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
H2BFSP57053 TBC1D9B-208ENST00000519746 2755 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
H2BFSP57053 SPOCK3-226ENST00000541354 2797 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
H2BFSP57053 CSRNP2-201ENST00000228515 4471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
H2BFSP57053 RUNX1-202ENST00000344691 7274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
H2BFSP57053 RNASEH2B-202ENST00000422660 4830 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
H2BFSP57053 ZBED1-202ENST00000381222 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
H2BFSP57053 SCNN1A-201ENST00000228916 3135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
H2BFSP57053 SCD5-202ENST00000319540 3101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
H2BFSP57053 ACADM-202ENST00000370841 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
H2BFSP57053 C7orf57-204ENST00000435376 1925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
H2BFSP57053 C7orf57-206ENST00000539619 1927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
H2BFSP57053 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
H2BFSP57053 AC027288.3-202ENST00000550268 1820 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
H2BFSP57053 RGS8-204ENST00000483095 1432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
H2BFSP57053 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
H2BFSP57053 MARK4-201ENST00000262891 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
H2BFSP57053 AC114689.3-201ENST00000583687 2991 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
H2BFSP57053 APOB-202ENST00000399256 3128 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
H2BFSP57053 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
H2BFSP57053 CNOT9-201ENST00000273064 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
H2BFSP57053 MLLT11-201ENST00000368921 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
H2BFSP57053 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
H2BFSP57053 SMARCA2-203ENST00000349721 5761 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms