Protein–RNA interactions for Protein: P54198

HIRA, Protein HIRA, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,017 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIRAP54198 COX6A1P2-201ENST00000620597 330 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
HIRAP54198 CCDC197-205ENST00000636493 1279 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
HIRAP54198 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HIRAP54198 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HIRAP54198 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HIRAP54198 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HIRAP54198 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HIRAP54198 SLCO6A1-207ENST00000513675 1611 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
HIRAP54198 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
HIRAP54198 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
HIRAP54198 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HIRAP54198 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HIRAP54198 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HIRAP54198 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HIRAP54198 SELPLG-201ENST00000228463 1704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
HIRAP54198 MAGEA1-201ENST00000356661 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HIRAP54198 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HIRAP54198 STYXL1-201ENST00000248600 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HIRAP54198 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HIRAP54198 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
HIRAP54198 CATSPER2P1-203ENST00000429276 1466 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
HIRAP54198 SPERT-204ENST00000610924 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
HIRAP54198 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
HIRAP54198 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HIRAP54198 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HIRAP54198 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
HIRAP54198 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
HIRAP54198 PON3-201ENST00000265627 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HIRAP54198 UBL4A-201ENST00000369653 711 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
HIRAP54198 MYL3-202ENST00000395869 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HIRAP54198 AC073150.1-201ENST00000450406 1084 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
HIRAP54198 RPL18P13-201ENST00000478088 569 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
HIRAP54198 RN7SL818P-201ENST00000485099 259 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
HIRAP54198 AC246817.2-203ENST00000517357 569 ntTSL 4 BASIC18.14■□□□□ 0.49
HIRAP54198 AC246817.2-202ENST00000519393 564 ntTSL 4 BASIC18.14■□□□□ 0.49
HIRAP54198 NEU3-205ENST00000531619 582 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
HIRAP54198 PGAM1P5-201ENST00000548011 764 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
HIRAP54198 AL445483.1-201ENST00000568695 736 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HIRAP54198 AL031282.1-201ENST00000577672 409 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
HIRAP54198 TPGS2-209ENST00000589049 1102 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HIRAP54198 RN7SL725P-201ENST00000606439 259 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
HIRAP54198 AP000229.1-202ENST00000609365 559 ntTSL 4 BASIC18.14■□□□□ 0.49
HIRAP54198 AL805961.1-201ENST00000642026 753 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
HIRAP54198 ATP6V0E2-207ENST00000479613 1666 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
HIRAP54198 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HIRAP54198 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HIRAP54198 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
HIRAP54198 CXorf40B-202ENST00000370404 1316 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
HIRAP54198 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
HIRAP54198 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
HIRAP54198 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HIRAP54198 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
HIRAP54198 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HIRAP54198 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
HIRAP54198 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HIRAP54198 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HIRAP54198 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HIRAP54198 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HIRAP54198 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HIRAP54198 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HIRAP54198 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HIRAP54198 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HIRAP54198 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HIRAP54198 TGFB1I1-214ENST00000567607 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HIRAP54198 RPS16-202ENST00000339471 643 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HIRAP54198 ALG1L-201ENST00000340333 805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HIRAP54198 RN7SKP214-201ENST00000364208 315 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
HIRAP54198 GSG1L-201ENST00000380897 1173 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HIRAP54198 MRPL23-204ENST00000397297 613 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HIRAP54198 LINC01006-202ENST00000418309 640 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HIRAP54198 AL021707.5-201ENST00000420118 461 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HIRAP54198 TREML1-202ENST00000426005 981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HIRAP54198 AL137856.1-201ENST00000429398 773 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HIRAP54198 RAMP3-202ENST00000481345 559 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HIRAP54198 SMIM23-202ENST00000523047 573 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HIRAP54198 AP003065.1-201ENST00000540912 562 ntTSL 4 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HIRAP54198 FKBP11-212ENST00000552878 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HIRAP54198 LINC01629-201ENST00000553613 581 ntTSL 4 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HIRAP54198 AC108134.4-201ENST00000570700 302 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HIRAP54198 AC011825.3-201ENST00000583184 565 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HIRAP54198 ALG1L-202ENST00000611639 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HIRAP54198 MIR6842-201ENST00000612539 65 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
HIRAP54198 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HIRAP54198 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HIRAP54198 OSCP1-204ENST00000433045 1381 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HIRAP54198 LINC02405-201ENST00000512624 1361 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HIRAP54198 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HIRAP54198 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HIRAP54198 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HIRAP54198 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HIRAP54198 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HIRAP54198 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HIRAP54198 EPHX1-202ENST00000366837 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HIRAP54198 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HIRAP54198 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HIRAP54198 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HIRAP54198 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HIRAP54198 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HIRAP54198 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HIRAP54198 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms