Protein–RNA interactions for Protein: P28472

GABRB3, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRB3P28472 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
GABRB3P28472 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GABRB3P28472 ACSL3-202ENST00000392066 3147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GABRB3P28472 TGM6-201ENST00000202625 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GABRB3P28472 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GABRB3P28472 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GABRB3P28472 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GABRB3P28472 SRRT-217ENST00000618411 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GABRB3P28472 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GABRB3P28472 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GABRB3P28472 WDR20-202ENST00000322340 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GABRB3P28472 PVR-203ENST00000403059 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GABRB3P28472 PXYLP1-201ENST00000286353 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GABRB3P28472 AL390755.1-201ENST00000623716 2027 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
GABRB3P28472 ZNF165-201ENST00000377325 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GABRB3P28472 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GABRB3P28472 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GABRB3P28472 E2F6-202ENST00000381525 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GABRB3P28472 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GABRB3P28472 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GABRB3P28472 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GABRB3P28472 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GABRB3P28472 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
GABRB3P28472 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GABRB3P28472 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GABRB3P28472 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GABRB3P28472 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GABRB3P28472 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GABRB3P28472 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GABRB3P28472 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GABRB3P28472 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GABRB3P28472 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
GABRB3P28472 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GABRB3P28472 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GABRB3P28472 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GABRB3P28472 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GABRB3P28472 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GABRB3P28472 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GABRB3P28472 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GABRB3P28472 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GABRB3P28472 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
GABRB3P28472 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GABRB3P28472 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GABRB3P28472 ZNF485-201ENST00000361807 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GABRB3P28472 SCAMP4-202ENST00000409472 2394 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GABRB3P28472 AC058822.1-201ENST00000507166 2550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GABRB3P28472 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GABRB3P28472 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GABRB3P28472 RPH3AL-201ENST00000323434 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GABRB3P28472 BHMG1-201ENST00000457052 2749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GABRB3P28472 RGS3-201ENST00000317613 2542 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GABRB3P28472 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GABRB3P28472 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GABRB3P28472 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GABRB3P28472 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GABRB3P28472 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GABRB3P28472 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GABRB3P28472 EPB41L3-206ENST00000544123 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GABRB3P28472 FAM149A-202ENST00000356371 2997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GABRB3P28472 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GABRB3P28472 GDAP1L1-201ENST00000342560 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GABRB3P28472 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GABRB3P28472 FCHO1-206ENST00000594202 3214 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GABRB3P28472 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GABRB3P28472 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GABRB3P28472 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GABRB3P28472 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GABRB3P28472 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GABRB3P28472 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GABRB3P28472 AC026748.1-201ENST00000624349 3251 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
GABRB3P28472 HTR3A-202ENST00000355556 2331 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GABRB3P28472 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GABRB3P28472 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GABRB3P28472 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
GABRB3P28472 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GABRB3P28472 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GABRB3P28472 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GABRB3P28472 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GABRB3P28472 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GABRB3P28472 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GABRB3P28472 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
GABRB3P28472 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GABRB3P28472 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GABRB3P28472 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
GABRB3P28472 SLC52A3-205ENST00000632431 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GABRB3P28472 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GABRB3P28472 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GABRB3P28472 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GABRB3P28472 IRF8-201ENST00000268638 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GABRB3P28472 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GABRB3P28472 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GABRB3P28472 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GABRB3P28472 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GABRB3P28472 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GABRB3P28472 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GABRB3P28472 CFAP53-201ENST00000398545 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GABRB3P28472 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GABRB3P28472 CYB561D1-204ENST00000420578 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GABRB3P28472 DNAJC7-202ENST00000426588 1774 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GABRB3P28472 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms