Protein–RNA interactions for Protein: P20248

CCNA2, Cyclin-A2, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNA2P20248 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CCNA2P20248 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CCNA2P20248 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CCNA2P20248 PARP10-201ENST00000313028 3497 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CCNA2P20248 ZFP30-201ENST00000351218 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CCNA2P20248 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
CCNA2P20248 DDX50-206ENST00000610822 2510 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
CCNA2P20248 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
CCNA2P20248 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC14.77□□□□□ -0.04
CCNA2P20248 ABCG1-201ENST00000343687 3037 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
CCNA2P20248 ALDH4A1-206ENST00000538839 2957 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
CCNA2P20248 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
CCNA2P20248 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
CCNA2P20248 CALD1-222ENST00000495522 2199 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
CCNA2P20248 ZNF785-202ENST00000470110 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
CCNA2P20248 LIN9-201ENST00000328205 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
CCNA2P20248 ZNF596-201ENST00000308811 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
CCNA2P20248 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
CCNA2P20248 AGAP7P-201ENST00000582299 2062 ntBASIC14.77□□□□□ -0.04
CCNA2P20248 AGAP14-201ENST00000624701 2060 ntBASIC14.77□□□□□ -0.04
CCNA2P20248 TCOF1-201ENST00000323668 4832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
CCNA2P20248 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
CCNA2P20248 PDPR-202ENST00000398122 2734 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
CCNA2P20248 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
CCNA2P20248 EFNB1-201ENST00000204961 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
CCNA2P20248 DUOXA1-210ENST00000559014 1965 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
CCNA2P20248 DCUN1D2-201ENST00000332592 2626 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
CCNA2P20248 KIAA0930-203ENST00000391627 2623 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
CCNA2P20248 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
CCNA2P20248 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC14.77□□□□□ -0.04
CCNA2P20248 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
CCNA2P20248 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
CCNA2P20248 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
CCNA2P20248 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
CCNA2P20248 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
CCNA2P20248 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
CCNA2P20248 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
CCNA2P20248 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
CCNA2P20248 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
CCNA2P20248 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
CCNA2P20248 ABR-228ENST00000574437 3196 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
CCNA2P20248 AHCYL2-202ENST00000446544 5026 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
CCNA2P20248 SPIRE1-201ENST00000309836 1877 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
CCNA2P20248 ZMYM3-204ENST00000373982 1867 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
CCNA2P20248 STOML1-206ENST00000561656 1833 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
CCNA2P20248 PRDM4-201ENST00000228437 4210 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
CCNA2P20248 IL17RD-208ENST00000640796 2345 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
CCNA2P20248 ARHGEF28-202ENST00000296799 4424 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
CCNA2P20248 NATD1-201ENST00000611551 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
CCNA2P20248 SYNGAP1-203ENST00000428982 4339 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
CCNA2P20248 IL6R-201ENST00000344086 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
CCNA2P20248 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CCNA2P20248 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CCNA2P20248 LONP1-202ENST00000540670 3002 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CCNA2P20248 SEMA4F-210ENST00000611975 6007 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CCNA2P20248 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CCNA2P20248 HNRNPU-226ENST00000640218 6858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CCNA2P20248 DNAJC14-203ENST00000357606 3416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CCNA2P20248 AMACR-203ENST00000382072 2919 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CCNA2P20248 DDX59-206ENST00000447706 2900 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CCNA2P20248 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CCNA2P20248 C22orf34-201ENST00000343999 2816 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CCNA2P20248 TMPRSS6-202ENST00000381792 3260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CCNA2P20248 TEX13C-201ENST00000632600 5095 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CCNA2P20248 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CCNA2P20248 PPRC1-203ENST00000413464 4580 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CCNA2P20248 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CCNA2P20248 PLXNC1-202ENST00000545312 1813 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CCNA2P20248 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CCNA2P20248 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CCNA2P20248 LRRK1-201ENST00000388948 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CCNA2P20248 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CCNA2P20248 GAK-201ENST00000314167 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CCNA2P20248 ADAMTS14-201ENST00000373207 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CCNA2P20248 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CCNA2P20248 ERLIN2-205ENST00000518586 2623 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CCNA2P20248 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CCNA2P20248 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CCNA2P20248 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
CCNA2P20248 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
CCNA2P20248 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CCNA2P20248 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CCNA2P20248 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CCNA2P20248 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CCNA2P20248 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CCNA2P20248 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CCNA2P20248 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CCNA2P20248 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CCNA2P20248 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
CCNA2P20248 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
CCNA2P20248 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CCNA2P20248 OS9-204ENST00000389146 2091 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CCNA2P20248 AFAP1-204ENST00000420658 7768 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CCNA2P20248 FLNA-207ENST00000422373 8486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CCNA2P20248 AC138969.2-201ENST00000532739 9932 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
CCNA2P20248 APBB1IP-202ENST00000376236 2771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CCNA2P20248 C3orf62-201ENST00000343010 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CCNA2P20248 NFS1-203ENST00000374092 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CCNA2P20248 GREM1-202ENST00000560830 2648 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CCNA2P20248 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.3 ms