Protein–RNA interactions for Protein: P19474

TRIM21, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM21, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM21P19474 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TRIM21P19474 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TRIM21P19474 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TRIM21P19474 AL365209.1-201ENST00000624418 6473 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
TRIM21P19474 KCNQ4-201ENST00000347132 4099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TRIM21P19474 ZNF497-201ENST00000311044 3468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TRIM21P19474 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TRIM21P19474 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TRIM21P19474 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TRIM21P19474 ATP2A3-204ENST00000397035 4182 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TRIM21P19474 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TRIM21P19474 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TRIM21P19474 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TRIM21P19474 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TRIM21P19474 AC004943.2-201ENST00000563328 4842 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TRIM21P19474 ZNF800-201ENST00000265827 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TRIM21P19474 SEMA5B-206ENST00000451055 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TRIM21P19474 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TRIM21P19474 CEP63-212ENST00000513612 2903 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TRIM21P19474 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TRIM21P19474 MAMLD1-203ENST00000370401 4854 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TRIM21P19474 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TRIM21P19474 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TRIM21P19474 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TRIM21P19474 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TRIM21P19474 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TRIM21P19474 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TRIM21P19474 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TRIM21P19474 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TRIM21P19474 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TRIM21P19474 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
TRIM21P19474 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TRIM21P19474 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TRIM21P19474 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TRIM21P19474 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
TRIM21P19474 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
TRIM21P19474 PCDHB8-201ENST00000239444 2740 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TRIM21P19474 ARHGEF28-202ENST00000296799 4424 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TRIM21P19474 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TRIM21P19474 IER5-201ENST00000367577 4188 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TRIM21P19474 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TRIM21P19474 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TRIM21P19474 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TRIM21P19474 NAALADL1-203ENST00000356632 2118 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TRIM21P19474 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TRIM21P19474 AC106881.1-201ENST00000605849 3329 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
TRIM21P19474 AC005264.1-201ENST00000587587 2319 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TRIM21P19474 SLC25A27-201ENST00000371347 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TRIM21P19474 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TRIM21P19474 OR2I1P-209ENST00000641730 5365 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
TRIM21P19474 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TRIM21P19474 ZNF212-201ENST00000335870 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TRIM21P19474 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TRIM21P19474 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TRIM21P19474 UHRF1BP1-202ENST00000452449 4706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TRIM21P19474 NEDD4L-202ENST00000356462 3335 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TRIM21P19474 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TRIM21P19474 GSN-203ENST00000373808 2664 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TRIM21P19474 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TRIM21P19474 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TRIM21P19474 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TRIM21P19474 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
TRIM21P19474 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TRIM21P19474 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
TRIM21P19474 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TRIM21P19474 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TRIM21P19474 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TRIM21P19474 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
TRIM21P19474 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TRIM21P19474 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TRIM21P19474 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TRIM21P19474 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TRIM21P19474 PWP2-201ENST00000291576 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TRIM21P19474 ZC3H4-201ENST00000253048 6119 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TRIM21P19474 APP-208ENST00000439274 2517 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TRIM21P19474 IPO8-201ENST00000256079 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TRIM21P19474 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TRIM21P19474 MINDY2-203ENST00000559228 9238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TRIM21P19474 SPATA6-204ENST00000396199 4964 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TRIM21P19474 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
TRIM21P19474 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TRIM21P19474 FARP1-214ENST00000595437 4926 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TRIM21P19474 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TRIM21P19474 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TRIM21P19474 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TRIM21P19474 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TRIM21P19474 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TRIM21P19474 PHF19-203ENST00000419155 3525 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TRIM21P19474 DNM1P51-202ENST00000558801 8752 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TRIM21P19474 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TRIM21P19474 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TRIM21P19474 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TRIM21P19474 AGAP7P-201ENST00000582299 2062 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
TRIM21P19474 AGAP14-201ENST00000624701 2060 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
TRIM21P19474 ZNF280D-207ENST00000559237 4902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TRIM21P19474 NDFIP2-201ENST00000218652 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TRIM21P19474 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TRIM21P19474 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TRIM21P19474 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TRIM21P19474 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51 ms