Protein–RNA interactions for Protein: P18858

LIG1, DNA ligase 1, humanhuman

Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIG1P18858 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
LIG1P18858 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
LIG1P18858 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
LIG1P18858 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
LIG1P18858 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
LIG1P18858 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
LIG1P18858 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
LIG1P18858 DIAPH2-204ENST00000373054 3376 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
LIG1P18858 DNAH14-204ENST00000366849 2215 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
LIG1P18858 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
LIG1P18858 AC005089.1-201ENST00000619486 2241 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
LIG1P18858 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
LIG1P18858 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
LIG1P18858 SNX11-202ENST00000393405 2733 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
LIG1P18858 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
LIG1P18858 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
LIG1P18858 TCP10-210ENST00000617120 2182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.46
LIG1P18858 HPGD-202ENST00000296522 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
LIG1P18858 SYBU-206ENST00000424158 3007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
LIG1P18858 ANKHD1-202ENST00000297183 7606 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.46
LIG1P18858 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.46
LIG1P18858 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
LIG1P18858 CCDC22-201ENST00000376227 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
LIG1P18858 KCNT1-211ENST00000491806 3678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
LIG1P18858 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
LIG1P18858 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
LIG1P18858 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
LIG1P18858 PRF1-201ENST00000373209 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
LIG1P18858 ADAM15-204ENST00000359280 2874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
LIG1P18858 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
LIG1P18858 FBXL19-202ENST00000380310 3796 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
LIG1P18858 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
LIG1P18858 PHF14-215ENST00000634607 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
LIG1P18858 AC114490.1-201ENST00000417456 3163 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
LIG1P18858 PBX3-203ENST00000373487 2902 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
LIG1P18858 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
LIG1P18858 SAFB-202ENST00000454510 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
LIG1P18858 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
LIG1P18858 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
LIG1P18858 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
LIG1P18858 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
LIG1P18858 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
LIG1P18858 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC17.95■□□□□ 0.46
LIG1P18858 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
LIG1P18858 AC005912.2-201ENST00000619492 2400 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
LIG1P18858 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
LIG1P18858 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
LIG1P18858 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
LIG1P18858 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
LIG1P18858 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
LIG1P18858 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
LIG1P18858 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
LIG1P18858 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
LIG1P18858 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
LIG1P18858 SPATA7-203ENST00000393545 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
LIG1P18858 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
LIG1P18858 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
LIG1P18858 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
LIG1P18858 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
LIG1P18858 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
LIG1P18858 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
LIG1P18858 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
LIG1P18858 ZSWIM8-221ENST00000604729 6075 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
LIG1P18858 TP53I11-208ENST00000525680 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
LIG1P18858 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
LIG1P18858 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
LIG1P18858 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
LIG1P18858 TMEM201-202ENST00000340381 3776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
LIG1P18858 CRYBG2-210ENST00000527815 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
LIG1P18858 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
LIG1P18858 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
LIG1P18858 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
LIG1P18858 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
LIG1P18858 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
LIG1P18858 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
LIG1P18858 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
LIG1P18858 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
LIG1P18858 AC025674.2-201ENST00000522622 2971 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
LIG1P18858 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC17.94■□□□□ 0.46
LIG1P18858 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
LIG1P18858 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
LIG1P18858 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
LIG1P18858 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
LIG1P18858 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
LIG1P18858 PODN-202ENST00000371500 3287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
LIG1P18858 PLEKHN1-203ENST00000379410 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
LIG1P18858 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
LIG1P18858 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
LIG1P18858 DNAJC14-201ENST00000317269 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
LIG1P18858 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
LIG1P18858 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
LIG1P18858 WDR20-203ENST00000335263 2616 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
LIG1P18858 POLR2B-205ENST00000441246 3839 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
LIG1P18858 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
LIG1P18858 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
LIG1P18858 AKAP7-204ENST00000431975 2954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
LIG1P18858 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
LIG1P18858 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
LIG1P18858 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
LIG1P18858 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45 ms