Protein–RNA interactions for Protein: P14136

GFAP, Glial fibrillary acidic protein, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GFAPP14136 SEZ6L-209ENST00000529632 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GFAPP14136 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GFAPP14136 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GFAPP14136 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GFAPP14136 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GFAPP14136 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GFAPP14136 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GFAPP14136 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GFAPP14136 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GFAPP14136 SAPCD2-201ENST00000409687 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GFAPP14136 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GFAPP14136 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GFAPP14136 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
GFAPP14136 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GFAPP14136 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GFAPP14136 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GFAPP14136 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GFAPP14136 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GFAPP14136 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GFAPP14136 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GFAPP14136 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
GFAPP14136 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GFAPP14136 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GFAPP14136 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GFAPP14136 GTPBP1-201ENST00000216044 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GFAPP14136 TBCD-202ENST00000539345 3975 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GFAPP14136 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GFAPP14136 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GFAPP14136 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GFAPP14136 SLC43A2-201ENST00000301335 8136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GFAPP14136 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GFAPP14136 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GFAPP14136 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GFAPP14136 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GFAPP14136 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GFAPP14136 GSG1L-203ENST00000447459 4916 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GFAPP14136 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GFAPP14136 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GFAPP14136 OSMR-201ENST00000274276 5539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GFAPP14136 C1R-202ENST00000536053 2347 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GFAPP14136 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GFAPP14136 ABCA7-203ENST00000435683 6211 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GFAPP14136 FBXO45-202ENST00000440469 3689 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GFAPP14136 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GFAPP14136 AFAP1-204ENST00000420658 7768 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GFAPP14136 RBBP8-201ENST00000327155 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GFAPP14136 TBK1-201ENST00000331710 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GFAPP14136 TMEM139-201ENST00000359333 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GFAPP14136 AL009178.2-201ENST00000597278 2719 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
GFAPP14136 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GFAPP14136 IL12RB2-206ENST00000544434 3782 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GFAPP14136 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GFAPP14136 TMEM30B-202ENST00000555868 4471 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GFAPP14136 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GFAPP14136 ANKMY1-203ENST00000373318 2449 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GFAPP14136 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GFAPP14136 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GFAPP14136 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GFAPP14136 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GFAPP14136 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GFAPP14136 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GFAPP14136 DLGAP2-215ENST00000637795 3380 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GFAPP14136 RGPD5-202ENST00000272454 2907 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GFAPP14136 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GFAPP14136 AP002990.1-202ENST00000496634 5064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GFAPP14136 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GFAPP14136 MAP1S-201ENST00000324096 3419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GFAPP14136 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GFAPP14136 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GFAPP14136 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GFAPP14136 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GFAPP14136 NOP9-201ENST00000267425 6033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GFAPP14136 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GFAPP14136 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GFAPP14136 SLC4A7-210ENST00000440156 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GFAPP14136 RHOXF1P3-203ENST00000640298 2668 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GFAPP14136 TMEM181-201ENST00000367090 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GFAPP14136 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GFAPP14136 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GFAPP14136 ATXN2L-202ENST00000336783 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GFAPP14136 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GFAPP14136 MGRN1-202ENST00000399577 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GFAPP14136 LINC00937-207ENST00000544461 3033 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GFAPP14136 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
GFAPP14136 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GFAPP14136 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GFAPP14136 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GFAPP14136 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GFAPP14136 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GFAPP14136 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GFAPP14136 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GFAPP14136 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
GFAPP14136 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GFAPP14136 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
GFAPP14136 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
GFAPP14136 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GFAPP14136 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GFAPP14136 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GFAPP14136 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
GFAPP14136 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.2 ms