Protein–RNA interactions for Protein: P0C875

FAM228B, Protein FAM228B, humanhuman

Predictions only

Length 321 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM228BP0C875 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
FAM228BP0C875 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
FAM228BP0C875 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
FAM228BP0C875 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
FAM228BP0C875 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
FAM228BP0C875 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
FAM228BP0C875 KCNQ4-201ENST00000347132 4099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
FAM228BP0C875 AC140479.7-201ENST00000636301 2332 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
FAM228BP0C875 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
FAM228BP0C875 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
FAM228BP0C875 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
FAM228BP0C875 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
FAM228BP0C875 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
FAM228BP0C875 DBR1-201ENST00000260803 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
FAM228BP0C875 ZNF30-202ENST00000439785 2651 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
FAM228BP0C875 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
FAM228BP0C875 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
FAM228BP0C875 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
FAM228BP0C875 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
FAM228BP0C875 MRPS17-201ENST00000285298 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
FAM228BP0C875 ARHGAP4-202ENST00000370016 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
FAM228BP0C875 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
FAM228BP0C875 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
FAM228BP0C875 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
FAM228BP0C875 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
FAM228BP0C875 VARS2-211ENST00000541562 3566 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
FAM228BP0C875 HSPB7-202ENST00000375718 2415 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
FAM228BP0C875 ZNF365-205ENST00000395254 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
FAM228BP0C875 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
FAM228BP0C875 CTBP1-AS2-205ENST00000578730 2757 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
FAM228BP0C875 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
FAM228BP0C875 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
FAM228BP0C875 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
FAM228BP0C875 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
FAM228BP0C875 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
FAM228BP0C875 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
FAM228BP0C875 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
FAM228BP0C875 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
FAM228BP0C875 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
FAM228BP0C875 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
FAM228BP0C875 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
FAM228BP0C875 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
FAM228BP0C875 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
FAM228BP0C875 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
FAM228BP0C875 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
FAM228BP0C875 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
FAM228BP0C875 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
FAM228BP0C875 ABCG4-205ENST00000619701 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
FAM228BP0C875 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
FAM228BP0C875 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
FAM228BP0C875 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
FAM228BP0C875 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
FAM228BP0C875 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
FAM228BP0C875 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
FAM228BP0C875 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
FAM228BP0C875 SPATA7-203ENST00000393545 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
FAM228BP0C875 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
FAM228BP0C875 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
FAM228BP0C875 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
FAM228BP0C875 AC009053.1-204ENST00000429810 2355 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
FAM228BP0C875 HOXA-AS2-202ENST00000517635 2455 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
FAM228BP0C875 SLC22A7-202ENST00000372585 2555 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
FAM228BP0C875 PPIL2-212ENST00000626352 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
FAM228BP0C875 AC139749.1-202ENST00000617529 3139 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
FAM228BP0C875 BCAR1-204ENST00000418647 3387 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
FAM228BP0C875 C17orf80-203ENST00000359042 3645 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
FAM228BP0C875 NANOS1-202ENST00000425699 4017 ntAPPRIS P2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
FAM228BP0C875 ANKRD50-202ENST00000515641 4212 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
FAM228BP0C875 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
FAM228BP0C875 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
FAM228BP0C875 WASH2P-202ENST00000538033 2800 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
FAM228BP0C875 GCK-204ENST00000403799 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
FAM228BP0C875 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
FAM228BP0C875 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
FAM228BP0C875 WFIKKN2-202ENST00000426127 2193 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
FAM228BP0C875 ANO10-213ENST00000451430 2019 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
FAM228BP0C875 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
FAM228BP0C875 KRT20-201ENST00000167588 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
FAM228BP0C875 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
FAM228BP0C875 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
FAM228BP0C875 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
FAM228BP0C875 SAP130-201ENST00000259234 4140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
FAM228BP0C875 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
FAM228BP0C875 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
FAM228BP0C875 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
FAM228BP0C875 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
FAM228BP0C875 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
FAM228BP0C875 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
FAM228BP0C875 GPSM1-202ENST00000354753 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
FAM228BP0C875 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
FAM228BP0C875 ARC-201ENST00000356613 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
FAM228BP0C875 SLC35A3-209ENST00000638338 2890 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
FAM228BP0C875 TSEN2-205ENST00000444864 2697 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
FAM228BP0C875 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
FAM228BP0C875 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
FAM228BP0C875 STK40-204ENST00000373132 3621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
FAM228BP0C875 JPH4-205ENST00000622501 3489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
FAM228BP0C875 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
FAM228BP0C875 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
FAM228BP0C875 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.2 ms