Protein–RNA interactions for Protein: P09455

RBP1, Retinol-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBP1P09455 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RBP1P09455 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
RBP1P09455 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RBP1P09455 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
RBP1P09455 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RBP1P09455 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RBP1P09455 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RBP1P09455 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RBP1P09455 C9orf139-202ENST00000623196 4990 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RBP1P09455 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RBP1P09455 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RBP1P09455 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RBP1P09455 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RBP1P09455 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RBP1P09455 CFAP53-201ENST00000398545 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RBP1P09455 RALGPS2-204ENST00000367635 5834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RBP1P09455 TGM6-201ENST00000202625 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RBP1P09455 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RBP1P09455 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RBP1P09455 GPKOW-201ENST00000156109 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RBP1P09455 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RBP1P09455 C9orf47-201ENST00000334490 4829 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RBP1P09455 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RBP1P09455 MVK-207ENST00000539575 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RBP1P09455 INO80-201ENST00000361937 6439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RBP1P09455 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RBP1P09455 STXBP6-201ENST00000323944 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RBP1P09455 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RBP1P09455 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RBP1P09455 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RBP1P09455 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RBP1P09455 DLGAP2-215ENST00000637795 3380 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RBP1P09455 MMP25-201ENST00000336577 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RBP1P09455 CACNA1I-203ENST00000404898 9892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RBP1P09455 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RBP1P09455 AL390755.1-201ENST00000623716 2027 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
RBP1P09455 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RBP1P09455 EP400-203ENST00000333577 3092 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RBP1P09455 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RBP1P09455 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RBP1P09455 PCDHB8-201ENST00000239444 2740 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RBP1P09455 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RBP1P09455 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RBP1P09455 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RBP1P09455 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RBP1P09455 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RBP1P09455 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RBP1P09455 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RBP1P09455 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RBP1P09455 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RBP1P09455 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RBP1P09455 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RBP1P09455 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RBP1P09455 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RBP1P09455 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RBP1P09455 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RBP1P09455 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RBP1P09455 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RBP1P09455 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RBP1P09455 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RBP1P09455 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RBP1P09455 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
RBP1P09455 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RBP1P09455 BAG4-201ENST00000287322 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RBP1P09455 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RBP1P09455 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RBP1P09455 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RBP1P09455 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RBP1P09455 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RBP1P09455 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RBP1P09455 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RBP1P09455 USP25-201ENST00000285679 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RBP1P09455 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RBP1P09455 TRIM29-210ENST00000528870 2217 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RBP1P09455 MYLK3-201ENST00000394809 6911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RBP1P09455 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RBP1P09455 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RBP1P09455 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RBP1P09455 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RBP1P09455 CEP170B-204ENST00000556508 6683 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RBP1P09455 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RBP1P09455 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
RBP1P09455 CDS2-203ENST00000460006 9298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RBP1P09455 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RBP1P09455 C12orf49-201ENST00000261318 8404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RBP1P09455 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RBP1P09455 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RBP1P09455 MEIOC-201ENST00000409122 4604 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RBP1P09455 SLC24A3-201ENST00000328041 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RBP1P09455 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RBP1P09455 GRB7-203ENST00000394209 1955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RBP1P09455 AJ011931.1-201ENST00000618749 2492 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
RBP1P09455 DYSF-201ENST00000258104 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RBP1P09455 DYSF-204ENST00000409582 6790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RBP1P09455 DYSF-210ENST00000413539 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RBP1P09455 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RBP1P09455 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RBP1P09455 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RBP1P09455 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RBP1P09455 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.7 ms