Protein–RNA interactions for Protein: P08034

GJB1, Gap junction beta-1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJB1P08034 DBNDD2-201ENST00000357275 1036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GJB1P08034 COL5A1-AS1-201ENST00000371813 336 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GJB1P08034 CRCP-204ENST00000398684 492 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GJB1P08034 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GJB1P08034 NUP210P1-202ENST00000504322 710 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
GJB1P08034 AC022217.1-201ENST00000521069 738 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
GJB1P08034 RNF41-210ENST00000552244 716 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GJB1P08034 AC005597.1-201ENST00000588092 420 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GJB1P08034 AC008805.2-201ENST00000590069 435 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GJB1P08034 SCN1B-204ENST00000596348 1176 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GJB1P08034 AL645939.5-201ENST00000606834 243 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
GJB1P08034 AP000346.4-201ENST00000614827 381 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
GJB1P08034 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GJB1P08034 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GJB1P08034 ANXA6-202ENST00000377751 1430 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GJB1P08034 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GJB1P08034 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GJB1P08034 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GJB1P08034 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GJB1P08034 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GJB1P08034 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GJB1P08034 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GJB1P08034 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GJB1P08034 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GJB1P08034 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GJB1P08034 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GJB1P08034 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GJB1P08034 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
GJB1P08034 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
GJB1P08034 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GJB1P08034 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GJB1P08034 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
GJB1P08034 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
GJB1P08034 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
GJB1P08034 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GJB1P08034 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GJB1P08034 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GJB1P08034 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GJB1P08034 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GJB1P08034 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
GJB1P08034 PSME1-202ENST00000382708 1136 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
GJB1P08034 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
GJB1P08034 PRPS2-205ENST00000489404 763 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
GJB1P08034 AC018680.1-202ENST00000500324 525 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
GJB1P08034 WSPAR-201ENST00000513561 683 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
GJB1P08034 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
GJB1P08034 DYRK1B-208ENST00000601972 772 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
GJB1P08034 PRRC2B-210ENST00000638390 1084 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GJB1P08034 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GJB1P08034 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GJB1P08034 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GJB1P08034 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GJB1P08034 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
GJB1P08034 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GJB1P08034 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
GJB1P08034 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GJB1P08034 LINC00658-202ENST00000420529 1542 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GJB1P08034 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
GJB1P08034 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
GJB1P08034 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
GJB1P08034 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
GJB1P08034 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
GJB1P08034 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
GJB1P08034 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
GJB1P08034 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
GJB1P08034 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
GJB1P08034 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
GJB1P08034 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
GJB1P08034 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
GJB1P08034 SYCE2-201ENST00000293695 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
GJB1P08034 NUDT1-202ENST00000343985 771 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
GJB1P08034 FAM24B-202ENST00000368898 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
GJB1P08034 CELA2B-201ENST00000375910 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
GJB1P08034 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
GJB1P08034 KRTAP20-4-201ENST00000382828 224 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
GJB1P08034 AIMP2-202ENST00000395236 860 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
GJB1P08034 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
GJB1P08034 AC128709.1-201ENST00000445908 600 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
GJB1P08034 SRSF10-211ENST00000484146 1089 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
GJB1P08034 AC105389.3-201ENST00000508038 907 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
GJB1P08034 LY6E-208ENST00000520531 490 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
GJB1P08034 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
GJB1P08034 RCE1-204ENST00000525356 1270 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
GJB1P08034 MRPL34-203ENST00000595444 863 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
GJB1P08034 ZCCHC4-206ENST00000612982 938 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
GJB1P08034 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
GJB1P08034 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
GJB1P08034 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
GJB1P08034 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
GJB1P08034 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
GJB1P08034 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
GJB1P08034 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
GJB1P08034 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
GJB1P08034 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
GJB1P08034 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
GJB1P08034 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
GJB1P08034 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
GJB1P08034 PPP1CA-201ENST00000312989 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
GJB1P08034 SMARCE1-205ENST00000431889 1569 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
GJB1P08034 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.3 ms