Protein–RNA interactions for Protein: O96006

ZBED1, Zinc finger BED domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 694 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED1O96006 AL161785.3-201ENST00000435157 395 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ZBED1O96006 FADS2-205ENST00000517839 469 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ZBED1O96006 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ZBED1O96006 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ZBED1O96006 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ZBED1O96006 TP53TG3HP-202ENST00000569755 579 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
ZBED1O96006 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
ZBED1O96006 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
ZBED1O96006 AC005391.1-201ENST00000613285 341 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ZBED1O96006 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ZBED1O96006 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ZBED1O96006 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ZBED1O96006 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ZBED1O96006 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ZBED1O96006 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
ZBED1O96006 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ZBED1O96006 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ZBED1O96006 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ZBED1O96006 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ZBED1O96006 KIF21A-202ENST00000361961 6601 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ZBED1O96006 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ZBED1O96006 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ZBED1O96006 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
ZBED1O96006 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ZBED1O96006 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ZBED1O96006 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ZBED1O96006 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ZBED1O96006 KCTD7-206ENST00000639828 5951 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
ZBED1O96006 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
ZBED1O96006 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
ZBED1O96006 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
ZBED1O96006 SEMA3G-201ENST00000231721 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
ZBED1O96006 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
ZBED1O96006 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
ZBED1O96006 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
ZBED1O96006 IDH3G-212ENST00000619865 1339 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ZBED1O96006 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ZBED1O96006 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
ZBED1O96006 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ZBED1O96006 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ZBED1O96006 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ZBED1O96006 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ZBED1O96006 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ZBED1O96006 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
ZBED1O96006 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ZBED1O96006 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
ZBED1O96006 BRD2-202ENST00000374831 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ZBED1O96006 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ZBED1O96006 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ZBED1O96006 PXMP4-202ENST00000344022 989 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ZBED1O96006 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
ZBED1O96006 AC104135.1-201ENST00000418001 763 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ZBED1O96006 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
ZBED1O96006 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ZBED1O96006 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
ZBED1O96006 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ZBED1O96006 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ZBED1O96006 AC093726.1-201ENST00000608064 963 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
ZBED1O96006 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ZBED1O96006 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ZBED1O96006 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ZBED1O96006 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ZBED1O96006 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ZBED1O96006 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
ZBED1O96006 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ZBED1O96006 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ZBED1O96006 COBL-203ENST00000395542 5339 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ZBED1O96006 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ZBED1O96006 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ZBED1O96006 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
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ZBED1O96006 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ZBED1O96006 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ZBED1O96006 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ZBED1O96006 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ZBED1O96006 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ZBED1O96006 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ZBED1O96006 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
ZBED1O96006 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ZBED1O96006 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
ZBED1O96006 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ZBED1O96006 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ZBED1O96006 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ZBED1O96006 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ZBED1O96006 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ZBED1O96006 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZBED1O96006 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZBED1O96006 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZBED1O96006 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZBED1O96006 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZBED1O96006 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZBED1O96006 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZBED1O96006 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZBED1O96006 FBXO46-201ENST00000317683 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZBED1O96006 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZBED1O96006 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZBED1O96006 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZBED1O96006 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZBED1O96006 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZBED1O96006 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
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