Protein–RNA interactions for Protein: O75323

NIPSNAP2, Protein NipSnap homolog 2, humanhuman

Predictions only

Length 286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPSNAP2O75323 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NIPSNAP2O75323 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NIPSNAP2O75323 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NIPSNAP2O75323 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NIPSNAP2O75323 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NIPSNAP2O75323 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NIPSNAP2O75323 NEDD4L-202ENST00000356462 3335 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NIPSNAP2O75323 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NIPSNAP2O75323 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NIPSNAP2O75323 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NIPSNAP2O75323 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
NIPSNAP2O75323 PHF19-203ENST00000419155 3525 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NIPSNAP2O75323 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NIPSNAP2O75323 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NIPSNAP2O75323 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NIPSNAP2O75323 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NIPSNAP2O75323 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NIPSNAP2O75323 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NIPSNAP2O75323 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NIPSNAP2O75323 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NIPSNAP2O75323 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NIPSNAP2O75323 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NIPSNAP2O75323 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NIPSNAP2O75323 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NIPSNAP2O75323 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
NIPSNAP2O75323 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
NIPSNAP2O75323 ZNF334-202ENST00000457685 3487 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NIPSNAP2O75323 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
NIPSNAP2O75323 ISPD-202ENST00000407010 5524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NIPSNAP2O75323 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
NIPSNAP2O75323 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NIPSNAP2O75323 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NIPSNAP2O75323 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NIPSNAP2O75323 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NIPSNAP2O75323 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NIPSNAP2O75323 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NIPSNAP2O75323 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NIPSNAP2O75323 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NIPSNAP2O75323 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NIPSNAP2O75323 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NIPSNAP2O75323 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NIPSNAP2O75323 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NIPSNAP2O75323 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NIPSNAP2O75323 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NIPSNAP2O75323 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NIPSNAP2O75323 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NIPSNAP2O75323 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NIPSNAP2O75323 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NIPSNAP2O75323 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NIPSNAP2O75323 RHPN1-201ENST00000289013 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NIPSNAP2O75323 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NIPSNAP2O75323 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NIPSNAP2O75323 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NIPSNAP2O75323 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NIPSNAP2O75323 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NIPSNAP2O75323 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NIPSNAP2O75323 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NIPSNAP2O75323 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
NIPSNAP2O75323 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
NIPSNAP2O75323 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
NIPSNAP2O75323 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NIPSNAP2O75323 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NIPSNAP2O75323 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NIPSNAP2O75323 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NIPSNAP2O75323 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NIPSNAP2O75323 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NIPSNAP2O75323 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
NIPSNAP2O75323 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NIPSNAP2O75323 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NIPSNAP2O75323 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NIPSNAP2O75323 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NIPSNAP2O75323 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NIPSNAP2O75323 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
NIPSNAP2O75323 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NIPSNAP2O75323 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NIPSNAP2O75323 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
NIPSNAP2O75323 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
NIPSNAP2O75323 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NIPSNAP2O75323 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NIPSNAP2O75323 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NIPSNAP2O75323 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NIPSNAP2O75323 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NIPSNAP2O75323 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NIPSNAP2O75323 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NIPSNAP2O75323 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NIPSNAP2O75323 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NIPSNAP2O75323 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NIPSNAP2O75323 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NIPSNAP2O75323 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NIPSNAP2O75323 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NIPSNAP2O75323 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NIPSNAP2O75323 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NIPSNAP2O75323 REPIN1-209ENST00000479668 3182 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NIPSNAP2O75323 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NIPSNAP2O75323 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NIPSNAP2O75323 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NIPSNAP2O75323 GRID2IP-202ENST00000452113 3428 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NIPSNAP2O75323 AGAP7P-201ENST00000582299 2062 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
NIPSNAP2O75323 AGAP14-201ENST00000624701 2060 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
NIPSNAP2O75323 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 122.2 ms