Protein–RNA interactions for Protein: O60486

PLXNC1, Plexin-C1, humanhuman

Predictions only

Length 1,568 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLXNC1O60486 PSMD13-215ENST00000621534 1572 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PLXNC1O60486 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PLXNC1O60486 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PLXNC1O60486 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PLXNC1O60486 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PLXNC1O60486 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PLXNC1O60486 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PLXNC1O60486 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PLXNC1O60486 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PLXNC1O60486 OXNAD1-202ENST00000435829 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PLXNC1O60486 MVK-214ENST00000629016 1591 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PLXNC1O60486 E2F3P2-201ENST00000447755 1422 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
PLXNC1O60486 FAM90A7P-201ENST00000382628 1395 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
PLXNC1O60486 FAM90A23P-201ENST00000400136 1395 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
PLXNC1O60486 RPS9-201ENST00000302907 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PLXNC1O60486 RN7SKP214-201ENST00000364208 315 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
PLXNC1O60486 AL357558.1-201ENST00000416646 456 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PLXNC1O60486 AC104073.2-201ENST00000453737 312 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
PLXNC1O60486 PRSS30P-205ENST00000506153 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PLXNC1O60486 ALG3P1-201ENST00000508806 1114 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
PLXNC1O60486 AF111169.4-201ENST00000556368 749 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PLXNC1O60486 AL136295.7-201ENST00000619226 1200 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
PLXNC1O60486 IGHV1OR21-1-201ENST00000622028 353 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PLXNC1O60486 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PLXNC1O60486 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PLXNC1O60486 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PLXNC1O60486 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PLXNC1O60486 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PLXNC1O60486 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PLXNC1O60486 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PLXNC1O60486 ERGIC3-203ENST00000357394 1357 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PLXNC1O60486 FIS1-201ENST00000223136 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PLXNC1O60486 TMSB10-201ENST00000233143 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PLXNC1O60486 IGHV3-49-201ENST00000390625 439 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PLXNC1O60486 TEX33-202ENST00000402860 986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PLXNC1O60486 AL606489.1-201ENST00000443515 486 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PLXNC1O60486 AP001547.1-201ENST00000527440 374 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PLXNC1O60486 AC145343.1-201ENST00000579629 650 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PLXNC1O60486 RN7SL163P-201ENST00000583100 276 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
PLXNC1O60486 TUBB4A-212ENST00000601152 590 ntTSL 4 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PLXNC1O60486 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PLXNC1O60486 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PLXNC1O60486 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PLXNC1O60486 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PLXNC1O60486 LENEP-202ENST00000392487 555 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PLXNC1O60486 AC243961.1-201ENST00000432559 384 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PLXNC1O60486 AC245056.1-201ENST00000437631 384 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PLXNC1O60486 NDUFC2-204ENST00000528164 561 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PLXNC1O60486 AP000229.1-202ENST00000609365 559 ntTSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PLXNC1O60486 CNOT7-213ENST00000628418 432 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PLXNC1O60486 AL805961.1-201ENST00000642026 753 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
PLXNC1O60486 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PLXNC1O60486 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PLXNC1O60486 EXOC7-213ENST00000467929 2260 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PLXNC1O60486 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
PLXNC1O60486 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PLXNC1O60486 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PLXNC1O60486 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PLXNC1O60486 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PLXNC1O60486 ALPL-207ENST00000540617 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PLXNC1O60486 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PLXNC1O60486 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PLXNC1O60486 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PLXNC1O60486 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PLXNC1O60486 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PLXNC1O60486 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PLXNC1O60486 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PLXNC1O60486 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PLXNC1O60486 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PLXNC1O60486 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PLXNC1O60486 NELFE-201ENST00000375425 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PLXNC1O60486 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PLXNC1O60486 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
PLXNC1O60486 PCOLCE-201ENST00000223061 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PLXNC1O60486 OXA1L-201ENST00000285848 1719 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PLXNC1O60486 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PLXNC1O60486 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PLXNC1O60486 TRO-205ENST00000399736 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PLXNC1O60486 RPL13AP19-201ENST00000434320 584 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
PLXNC1O60486 AC090857.1-201ENST00000527400 390 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
PLXNC1O60486 AL132639.2-202ENST00000553520 467 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PLXNC1O60486 AL845331.2-201ENST00000561882 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PLXNC1O60486 ELOF1-202ENST00000586120 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PLXNC1O60486 Metazoa_SRP.65-201ENST00000615602 264 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
PLXNC1O60486 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PLXNC1O60486 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PLXNC1O60486 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PLXNC1O60486 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PLXNC1O60486 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PLXNC1O60486 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PLXNC1O60486 BRMS1-201ENST00000359957 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PLXNC1O60486 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PLXNC1O60486 CRISPLD2-203ENST00000564567 1651 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PLXNC1O60486 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PLXNC1O60486 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PLXNC1O60486 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PLXNC1O60486 MUC1-203ENST00000342482 537 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PLXNC1O60486 MYL3-202ENST00000395869 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PLXNC1O60486 AC145207.1-201ENST00000415556 691 ntTSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PLXNC1O60486 NDUFS6P1-201ENST00000485187 316 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39 ms