Protein–RNA interactions for Protein: B4DXG7

cDNA FLJ57652, highly similar to Ephrin-A3, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
B4DXG7 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
B4DXG7 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC14.49□□□□□ -0.09
B4DXG7 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
B4DXG7 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.49□□□□□ -0.09
B4DXG7 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
B4DXG7 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
B4DXG7 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
B4DXG7 NRP2-203ENST00000357785 2926 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
B4DXG7 MIOS-201ENST00000340080 3453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
B4DXG7 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
B4DXG7 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
B4DXG7 GRID2IP-202ENST00000452113 3428 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
B4DXG7 DLX6-202ENST00000518156 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
B4DXG7 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
B4DXG7 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
B4DXG7 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
B4DXG7 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
B4DXG7 PRMT9-201ENST00000322396 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
B4DXG7 GPSM1-202ENST00000354753 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
B4DXG7 SLC11A2-204ENST00000541174 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
B4DXG7 PATZ1-202ENST00000266269 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
B4DXG7 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
B4DXG7 KCNT1-211ENST00000491806 3678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
B4DXG7 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
B4DXG7 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
B4DXG7 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
B4DXG7 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
B4DXG7 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
B4DXG7 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
B4DXG7 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
B4DXG7 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
B4DXG7 APP-208ENST00000439274 2517 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
B4DXG7 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
B4DXG7 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
B4DXG7 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
B4DXG7 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
B4DXG7 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
B4DXG7 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
B4DXG7 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
B4DXG7 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
B4DXG7 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
B4DXG7 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
B4DXG7 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
B4DXG7 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
B4DXG7 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
B4DXG7 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
B4DXG7 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
B4DXG7 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
B4DXG7 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
B4DXG7 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
B4DXG7 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
B4DXG7 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
B4DXG7 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
B4DXG7 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
B4DXG7 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
B4DXG7 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
B4DXG7 GRM5-205ENST00000455756 7927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
B4DXG7 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
B4DXG7 TMEM38A-201ENST00000187762 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
B4DXG7 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
B4DXG7 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
B4DXG7 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
B4DXG7 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
B4DXG7 TBC1D2-203ENST00000375064 3174 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
B4DXG7 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
B4DXG7 MCM3AP-AS1-203ENST00000421927 2280 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
B4DXG7 PHKG2-204ENST00000563588 5539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
B4DXG7 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
B4DXG7 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
B4DXG7 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
B4DXG7 ADORA1-201ENST00000309502 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
B4DXG7 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
B4DXG7 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
B4DXG7 XRCC1-201ENST00000262887 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
B4DXG7 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
B4DXG7 TAF4B-203ENST00000578121 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
B4DXG7 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
B4DXG7 PHF14-215ENST00000634607 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
B4DXG7 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
B4DXG7 IMPDH1-203ENST00000354269 2580 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
B4DXG7 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
B4DXG7 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
B4DXG7 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
B4DXG7 SYT5-201ENST00000354308 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
B4DXG7 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
B4DXG7 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
B4DXG7 DEGS2-201ENST00000305631 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
B4DXG7 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
B4DXG7 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
B4DXG7 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
B4DXG7 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
B4DXG7 GNAO1-201ENST00000262493 3337 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
B4DXG7 MFRP-205ENST00000619721 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
B4DXG7 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
B4DXG7 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
B4DXG7 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
B4DXG7 COG3-201ENST00000349995 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
B4DXG7 ANKHD1-202ENST00000297183 7606 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
B4DXG7 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
B4DXG7 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.5 ms