Protein–RNA interactions for Protein: A6NCL1

GMNC, Geminin coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GMNCA6NCL1 DHX16-202ENST00000376442 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GMNCA6NCL1 HOGA1-203ENST00000370647 1999 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GMNCA6NCL1 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GMNCA6NCL1 BCAT2-201ENST00000316273 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GMNCA6NCL1 BVES-201ENST00000314641 5567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GMNCA6NCL1 SLC35C2-201ENST00000243896 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GMNCA6NCL1 HECW1-203ENST00000453890 5169 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GMNCA6NCL1 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GMNCA6NCL1 VWA5B2-202ENST00000426955 4120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GMNCA6NCL1 PRKCSH-212ENST00000591462 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GMNCA6NCL1 JPH1-201ENST00000342232 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GMNCA6NCL1 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GMNCA6NCL1 GID4-201ENST00000268719 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GMNCA6NCL1 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GMNCA6NCL1 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GMNCA6NCL1 AC018442.1-201ENST00000421439 2061 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
GMNCA6NCL1 PTGES3-207ENST00000614328 2077 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GMNCA6NCL1 AC008894.2-201ENST00000597983 2987 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GMNCA6NCL1 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GMNCA6NCL1 APBA1-201ENST00000265381 6534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GMNCA6NCL1 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GMNCA6NCL1 RILPL1-202ENST00000376874 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GMNCA6NCL1 AC007326.2-201ENST00000624224 7579 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
GMNCA6NCL1 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GMNCA6NCL1 GDPD2-204ENST00000536730 2171 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GMNCA6NCL1 PPIL6-202ENST00000424445 4031 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GMNCA6NCL1 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GMNCA6NCL1 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GMNCA6NCL1 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GMNCA6NCL1 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
GMNCA6NCL1 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
GMNCA6NCL1 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
GMNCA6NCL1 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
GMNCA6NCL1 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GMNCA6NCL1 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GMNCA6NCL1 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
GMNCA6NCL1 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GMNCA6NCL1 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GMNCA6NCL1 MLLT11-201ENST00000368921 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GMNCA6NCL1 HAND2-AS1-202ENST00000502896 5278 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GMNCA6NCL1 SETD6-203ENST00000394266 3423 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GMNCA6NCL1 RIMS3-202ENST00000372684 7235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GMNCA6NCL1 CSNK1D-202ENST00000314028 3712 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GMNCA6NCL1 TNFRSF11A-206ENST00000617039 3756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GMNCA6NCL1 GAK-214ENST00000511163 4280 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GMNCA6NCL1 FES-202ENST00000394300 2302 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GMNCA6NCL1 TMEM143-201ENST00000293261 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GMNCA6NCL1 SLC22A12-202ENST00000377567 2599 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GMNCA6NCL1 WNT2B-202ENST00000369684 3818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GMNCA6NCL1 F8-201ENST00000330287 2620 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GMNCA6NCL1 GOLIM4-202ENST00000470487 4373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GMNCA6NCL1 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GMNCA6NCL1 UHRF1BP1L-201ENST00000279907 5168 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GMNCA6NCL1 CCDC186-202ENST00000369286 1928 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GMNCA6NCL1 NPRL3-212ENST00000620134 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GMNCA6NCL1 ZBED1-202ENST00000381222 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GMNCA6NCL1 NUDT4-201ENST00000337179 9753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GMNCA6NCL1 AC004754.1-201ENST00000600536 2242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GMNCA6NCL1 EFHC1-212ENST00000635984 3293 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GMNCA6NCL1 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GMNCA6NCL1 ABCA7-201ENST00000263094 6816 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GMNCA6NCL1 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GMNCA6NCL1 USP4-203ENST00000415188 1454 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GMNCA6NCL1 SERPINA4-203ENST00000557004 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GMNCA6NCL1 XG-201ENST00000381174 2315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GMNCA6NCL1 RARG-202ENST00000394426 2640 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GMNCA6NCL1 BAIAP3-202ENST00000397488 4583 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GMNCA6NCL1 DUSP28-202ENST00000405954 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GMNCA6NCL1 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GMNCA6NCL1 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GMNCA6NCL1 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GMNCA6NCL1 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GMNCA6NCL1 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GMNCA6NCL1 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GMNCA6NCL1 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
GMNCA6NCL1 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GMNCA6NCL1 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GMNCA6NCL1 PEX5L-215ENST00000485199 2992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GMNCA6NCL1 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GMNCA6NCL1 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GMNCA6NCL1 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GMNCA6NCL1 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GMNCA6NCL1 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
GMNCA6NCL1 WHRN-202ENST00000362057 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GMNCA6NCL1 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GMNCA6NCL1 KCNMA1-202ENST00000286628 6233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GMNCA6NCL1 SSTR2-201ENST00000357585 7683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GMNCA6NCL1 USP47-207ENST00000527733 4525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GMNCA6NCL1 GOPC-201ENST00000052569 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GMNCA6NCL1 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GMNCA6NCL1 ACSM2A-209ENST00000573854 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GMNCA6NCL1 MFAP3-201ENST00000322602 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GMNCA6NCL1 TNFAIP8L3-201ENST00000327536 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GMNCA6NCL1 FXR1-214ENST00000480918 1996 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GMNCA6NCL1 CPT1B-202ENST00000360719 2319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GMNCA6NCL1 AL662899.1-201ENST00000461287 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GMNCA6NCL1 CDC25B-205ENST00000439880 3096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GMNCA6NCL1 RNASEH2C-201ENST00000308418 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GMNCA6NCL1 LINC01225-202ENST00000562339 2113 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GMNCA6NCL1 MAPKAP1-204ENST00000373498 3131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.2 ms