Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4K3

TRAF6, TNF receptor-associated factor 6, humanhuman

Predictions only

Length 522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF6Q9Y4K3 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TRAF6Q9Y4K3 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TRAF6Q9Y4K3 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TRAF6Q9Y4K3 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TRAF6Q9Y4K3 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TRAF6Q9Y4K3 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TRAF6Q9Y4K3 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TRAF6Q9Y4K3 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TRAF6Q9Y4K3 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TRAF6Q9Y4K3 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TRAF6Q9Y4K3 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
TRAF6Q9Y4K3 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
TRAF6Q9Y4K3 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
TRAF6Q9Y4K3 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TRAF6Q9Y4K3 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TRAF6Q9Y4K3 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TRAF6Q9Y4K3 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TRAF6Q9Y4K3 AGTPBP1-208ENST00000628899 4222 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TRAF6Q9Y4K3 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TRAF6Q9Y4K3 WDR25-204ENST00000554175 2055 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TRAF6Q9Y4K3 HPGD-202ENST00000296522 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
TRAF6Q9Y4K3 B4GALNT1-201ENST00000341156 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
TRAF6Q9Y4K3 ANXA6-215ENST00000523714 2451 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
TRAF6Q9Y4K3 BBS1-225ENST00000630659 1934 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
TRAF6Q9Y4K3 CASC2-203ENST00000435944 3270 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
TRAF6Q9Y4K3 ITGB4-206ENST00000579662 5554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
TRAF6Q9Y4K3 CPEB3-201ENST00000265997 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
TRAF6Q9Y4K3 TAF1C-216ENST00000566732 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
TRAF6Q9Y4K3 YPEL1-201ENST00000339468 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
TRAF6Q9Y4K3 SLC4A9-203ENST00000506545 2838 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
TRAF6Q9Y4K3 LTBP2-201ENST00000261978 8567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRAF6Q9Y4K3 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRAF6Q9Y4K3 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRAF6Q9Y4K3 SFI1-209ENST00000443011 3579 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRAF6Q9Y4K3 MSH5-203ENST00000375750 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRAF6Q9Y4K3 AMPD3-203ENST00000396554 3806 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRAF6Q9Y4K3 ZNF324-201ENST00000196482 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRAF6Q9Y4K3 GPD1L-201ENST00000282541 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRAF6Q9Y4K3 RPH3AL-202ENST00000331302 2606 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRAF6Q9Y4K3 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRAF6Q9Y4K3 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRAF6Q9Y4K3 RIMS1-216ENST00000521978 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRAF6Q9Y4K3 FAM114A2-215ENST00000522858 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRAF6Q9Y4K3 SNX11-202ENST00000393405 2733 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRAF6Q9Y4K3 PATZ1-203ENST00000351933 3638 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRAF6Q9Y4K3 DDHD2-205ENST00000520272 4532 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRAF6Q9Y4K3 ADCY2-201ENST00000338316 6575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRAF6Q9Y4K3 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRAF6Q9Y4K3 PCDHGB1-202ENST00000611598 2592 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRAF6Q9Y4K3 UBE2I-201ENST00000325437 2832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRAF6Q9Y4K3 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRAF6Q9Y4K3 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRAF6Q9Y4K3 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRAF6Q9Y4K3 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRAF6Q9Y4K3 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRAF6Q9Y4K3 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
TRAF6Q9Y4K3 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRAF6Q9Y4K3 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
TRAF6Q9Y4K3 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRAF6Q9Y4K3 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRAF6Q9Y4K3 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRAF6Q9Y4K3 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRAF6Q9Y4K3 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRAF6Q9Y4K3 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRAF6Q9Y4K3 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRAF6Q9Y4K3 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRAF6Q9Y4K3 CRYBG2-210ENST00000527815 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRAF6Q9Y4K3 GRK6-203ENST00000393576 2792 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRAF6Q9Y4K3 FAM219A-204ENST00000379081 3543 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRAF6Q9Y4K3 ASF1A-201ENST00000229595 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRAF6Q9Y4K3 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRAF6Q9Y4K3 DIAPH2-204ENST00000373054 3376 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRAF6Q9Y4K3 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRAF6Q9Y4K3 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRAF6Q9Y4K3 EXOC6B-209ENST00000634650 2583 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRAF6Q9Y4K3 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRAF6Q9Y4K3 UHRF1BP1-202ENST00000452449 4706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRAF6Q9Y4K3 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRAF6Q9Y4K3 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRAF6Q9Y4K3 IRAK1-203ENST00000369980 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRAF6Q9Y4K3 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRAF6Q9Y4K3 TIGD4-201ENST00000304337 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRAF6Q9Y4K3 NUTM2D-202ENST00000412718 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRAF6Q9Y4K3 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRAF6Q9Y4K3 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRAF6Q9Y4K3 MALSU1-202ENST00000466681 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRAF6Q9Y4K3 SLC52A3-205ENST00000632431 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRAF6Q9Y4K3 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
TRAF6Q9Y4K3 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRAF6Q9Y4K3 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRAF6Q9Y4K3 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRAF6Q9Y4K3 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRAF6Q9Y4K3 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRAF6Q9Y4K3 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRAF6Q9Y4K3 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRAF6Q9Y4K3 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRAF6Q9Y4K3 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRAF6Q9Y4K3 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRAF6Q9Y4K3 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRAF6Q9Y4K3 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.5 ms