Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPV9

TRAK1, Trafficking kinesin-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 953 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAK1Q9UPV9 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TRAK1Q9UPV9 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TRAK1Q9UPV9 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TRAK1Q9UPV9 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TRAK1Q9UPV9 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TRAK1Q9UPV9 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TRAK1Q9UPV9 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TRAK1Q9UPV9 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TRAK1Q9UPV9 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TRAK1Q9UPV9 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TRAK1Q9UPV9 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TRAK1Q9UPV9 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TRAK1Q9UPV9 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TRAK1Q9UPV9 LINC02273-201ENST00000499452 1592 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TRAK1Q9UPV9 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TRAK1Q9UPV9 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TRAK1Q9UPV9 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TRAK1Q9UPV9 AL451065.1-201ENST00000428958 238 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TRAK1Q9UPV9 AP003171.2-201ENST00000528208 925 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
TRAK1Q9UPV9 AC136428.1-201ENST00000569103 349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TRAK1Q9UPV9 AP005329.1-201ENST00000578800 1035 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TRAK1Q9UPV9 AL358473.2-201ENST00000610411 556 ntTSL 4 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TRAK1Q9UPV9 LINC01002-220ENST00000632790 449 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TRAK1Q9UPV9 HCRTR1-202ENST00000373706 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TRAK1Q9UPV9 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TRAK1Q9UPV9 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TRAK1Q9UPV9 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TRAK1Q9UPV9 TUBA8-202ENST00000330423 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TRAK1Q9UPV9 GRN-222ENST00000639447 1314 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TRAK1Q9UPV9 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TRAK1Q9UPV9 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TRAK1Q9UPV9 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TRAK1Q9UPV9 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TRAK1Q9UPV9 SLC5A10-202ENST00000395643 1982 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TRAK1Q9UPV9 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TRAK1Q9UPV9 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TRAK1Q9UPV9 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TRAK1Q9UPV9 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TRAK1Q9UPV9 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TRAK1Q9UPV9 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TRAK1Q9UPV9 C8orf74-201ENST00000304519 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TRAK1Q9UPV9 LSM10-201ENST00000315732 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TRAK1Q9UPV9 HIST3H3-201ENST00000366696 481 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TRAK1Q9UPV9 SNX21-203ENST00000372541 771 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TRAK1Q9UPV9 POM121L8P-201ENST00000417732 1281 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
TRAK1Q9UPV9 LINC01762-204ENST00000434879 436 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TRAK1Q9UPV9 POM121L9P-203ENST00000441984 1285 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
TRAK1Q9UPV9 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TRAK1Q9UPV9 CDK2AP2-205ENST00000531506 634 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TRAK1Q9UPV9 SFTA2-203ENST00000634371 815 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TRAK1Q9UPV9 AC068587.10-201ENST00000641210 219 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
TRAK1Q9UPV9 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TRAK1Q9UPV9 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TRAK1Q9UPV9 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TRAK1Q9UPV9 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
TRAK1Q9UPV9 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
TRAK1Q9UPV9 AURKC-203ENST00000448930 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
TRAK1Q9UPV9 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
TRAK1Q9UPV9 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
TRAK1Q9UPV9 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.03
TRAK1Q9UPV9 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
TRAK1Q9UPV9 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TRAK1Q9UPV9 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TRAK1Q9UPV9 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TRAK1Q9UPV9 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TRAK1Q9UPV9 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TRAK1Q9UPV9 AL162231.1-201ENST00000421828 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TRAK1Q9UPV9 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TRAK1Q9UPV9 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TRAK1Q9UPV9 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TRAK1Q9UPV9 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TRAK1Q9UPV9 TDRKH-204ENST00000368825 2651 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TRAK1Q9UPV9 OCEL1-201ENST00000215061 1133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TRAK1Q9UPV9 EIF3G-201ENST00000253108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TRAK1Q9UPV9 CSH1-201ENST00000316193 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TRAK1Q9UPV9 SLURP2-201ENST00000317543 599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TRAK1Q9UPV9 BEX5-201ENST00000333643 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TRAK1Q9UPV9 C1orf43-205ENST00000368519 1163 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TRAK1Q9UPV9 LMO4-201ENST00000370542 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TRAK1Q9UPV9 ITPA-201ENST00000380113 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TRAK1Q9UPV9 ITPA-202ENST00000399838 897 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TRAK1Q9UPV9 KRTAP10-13P-201ENST00000412914 571 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
TRAK1Q9UPV9 LINC01840-201ENST00000421870 571 ntTSL 4 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TRAK1Q9UPV9 FAM8A4P-201ENST00000435433 1213 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
TRAK1Q9UPV9 H2AFV-206ENST00000437072 589 ntTSL 4 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TRAK1Q9UPV9 AL450003.2-201ENST00000450445 428 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TRAK1Q9UPV9 VGLL4-214ENST00000451674 938 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TRAK1Q9UPV9 LAMA5-AS1-203ENST00000478167 690 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TRAK1Q9UPV9 FBXL8-208ENST00000521920 574 ntTSL 4 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TRAK1Q9UPV9 AL133523.1-201ENST00000554537 331 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TRAK1Q9UPV9 MAP1LC3B2-202ENST00000556529 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TRAK1Q9UPV9 AC026495.1-203ENST00000557528 906 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TRAK1Q9UPV9 TMEM219-203ENST00000561899 1249 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TRAK1Q9UPV9 LINC00595-217ENST00000635545 549 ntTSL 4 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TRAK1Q9UPV9 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TRAK1Q9UPV9 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TRAK1Q9UPV9 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TRAK1Q9UPV9 CBX3-203ENST00000409747 1717 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TRAK1Q9UPV9 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TRAK1Q9UPV9 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.7 ms