Protein–RNA interactions for Protein: Q9P003

CNIH4, Protein cornichon homolog 4, humanhuman

Predictions only

Length 139 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNIH4Q9P003 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CNIH4Q9P003 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CNIH4Q9P003 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CNIH4Q9P003 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CNIH4Q9P003 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CNIH4Q9P003 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
CNIH4Q9P003 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CNIH4Q9P003 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
CNIH4Q9P003 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CNIH4Q9P003 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CNIH4Q9P003 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CNIH4Q9P003 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CNIH4Q9P003 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CNIH4Q9P003 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CNIH4Q9P003 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CNIH4Q9P003 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CNIH4Q9P003 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
CNIH4Q9P003 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
CNIH4Q9P003 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CNIH4Q9P003 SLITRK2-202ENST00000370490 7672 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CNIH4Q9P003 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CNIH4Q9P003 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CNIH4Q9P003 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CNIH4Q9P003 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CNIH4Q9P003 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CNIH4Q9P003 MFRP-205ENST00000619721 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CNIH4Q9P003 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CNIH4Q9P003 BRD2-202ENST00000374831 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CNIH4Q9P003 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CNIH4Q9P003 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CNIH4Q9P003 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CNIH4Q9P003 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CNIH4Q9P003 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CNIH4Q9P003 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CNIH4Q9P003 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CNIH4Q9P003 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CNIH4Q9P003 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CNIH4Q9P003 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CNIH4Q9P003 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CNIH4Q9P003 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CNIH4Q9P003 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CNIH4Q9P003 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CNIH4Q9P003 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CNIH4Q9P003 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CNIH4Q9P003 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CNIH4Q9P003 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CNIH4Q9P003 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CNIH4Q9P003 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CNIH4Q9P003 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CNIH4Q9P003 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CNIH4Q9P003 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CNIH4Q9P003 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CNIH4Q9P003 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CNIH4Q9P003 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CNIH4Q9P003 NTRK3-203ENST00000357724 2980 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CNIH4Q9P003 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CNIH4Q9P003 DLGAP1-214ENST00000539435 2402 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CNIH4Q9P003 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CNIH4Q9P003 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CNIH4Q9P003 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CNIH4Q9P003 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CNIH4Q9P003 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
CNIH4Q9P003 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CNIH4Q9P003 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CNIH4Q9P003 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CNIH4Q9P003 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CNIH4Q9P003 COQ6-210ENST00000554920 649 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CNIH4Q9P003 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CNIH4Q9P003 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CNIH4Q9P003 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CNIH4Q9P003 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CNIH4Q9P003 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
CNIH4Q9P003 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CNIH4Q9P003 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
CNIH4Q9P003 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CNIH4Q9P003 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
CNIH4Q9P003 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
CNIH4Q9P003 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
CNIH4Q9P003 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
CNIH4Q9P003 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
CNIH4Q9P003 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
CNIH4Q9P003 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CNIH4Q9P003 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
CNIH4Q9P003 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CNIH4Q9P003 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CNIH4Q9P003 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CNIH4Q9P003 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CNIH4Q9P003 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CNIH4Q9P003 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CNIH4Q9P003 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CNIH4Q9P003 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CNIH4Q9P003 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CNIH4Q9P003 RPS23-201ENST00000296674 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CNIH4Q9P003 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CNIH4Q9P003 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CNIH4Q9P003 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CNIH4Q9P003 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CNIH4Q9P003 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CNIH4Q9P003 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CNIH4Q9P003 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms