Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVF7

FBXO28, F-box only protein 28, humanhuman

Predictions only

Length 368 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXO28Q9NVF7 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
FBXO28Q9NVF7 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
FBXO28Q9NVF7 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
FBXO28Q9NVF7 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
FBXO28Q9NVF7 TPM1-206ENST00000358278 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
FBXO28Q9NVF7 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
FBXO28Q9NVF7 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
FBXO28Q9NVF7 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
FBXO28Q9NVF7 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
FBXO28Q9NVF7 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
FBXO28Q9NVF7 NMNAT3-201ENST00000296202 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
FBXO28Q9NVF7 KATNA1-201ENST00000335643 1564 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
FBXO28Q9NVF7 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
FBXO28Q9NVF7 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
FBXO28Q9NVF7 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
FBXO28Q9NVF7 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
FBXO28Q9NVF7 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
FBXO28Q9NVF7 AL133338.1-201ENST00000565695 1517 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
FBXO28Q9NVF7 LRRC59-203ENST00000576448 1531 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
FBXO28Q9NVF7 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
FBXO28Q9NVF7 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
FBXO28Q9NVF7 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
FBXO28Q9NVF7 C20orf202-201ENST00000400633 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
FBXO28Q9NVF7 NPPC-201ENST00000295440 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
FBXO28Q9NVF7 DBNDD2-201ENST00000357275 1036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
FBXO28Q9NVF7 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
FBXO28Q9NVF7 UROS-203ENST00000368786 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
FBXO28Q9NVF7 EIF3FP3-201ENST00000434851 1086 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
FBXO28Q9NVF7 CHIA-209ENST00000483391 1188 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
FBXO28Q9NVF7 AC078785.1-201ENST00000496389 734 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
FBXO28Q9NVF7 LYRM9-204ENST00000503642 432 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
FBXO28Q9NVF7 GTF2H2C-215ENST00000514162 610 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
FBXO28Q9NVF7 IL32-218ENST00000530890 774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
FBXO28Q9NVF7 PLEKHB1-206ENST00000535129 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
FBXO28Q9NVF7 CRISPLD2-210ENST00000569090 808 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
FBXO28Q9NVF7 MIR3615-201ENST00000581999 87 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
FBXO28Q9NVF7 KLK3-211ENST00000597483 810 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
FBXO28Q9NVF7 CCL5-202ENST00000605140 1244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
FBXO28Q9NVF7 PRKN-211ENST00000615065 261 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
FBXO28Q9NVF7 UPK1A-204ENST00000617999 1268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
FBXO28Q9NVF7 ST7L-207ENST00000369669 1743 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
FBXO28Q9NVF7 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
FBXO28Q9NVF7 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
FBXO28Q9NVF7 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
FBXO28Q9NVF7 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
FBXO28Q9NVF7 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
FBXO28Q9NVF7 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
FBXO28Q9NVF7 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
FBXO28Q9NVF7 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
FBXO28Q9NVF7 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
FBXO28Q9NVF7 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
FBXO28Q9NVF7 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
FBXO28Q9NVF7 TEX264-205ENST00000416589 1313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
FBXO28Q9NVF7 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
FBXO28Q9NVF7 FBXO8-202ENST00000503293 1546 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
FBXO28Q9NVF7 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
FBXO28Q9NVF7 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
FBXO28Q9NVF7 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
FBXO28Q9NVF7 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
FBXO28Q9NVF7 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
FBXO28Q9NVF7 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
FBXO28Q9NVF7 CCDC88B-201ENST00000301897 870 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
FBXO28Q9NVF7 GTSF1-201ENST00000305879 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
FBXO28Q9NVF7 MUC1-202ENST00000338684 1107 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
FBXO28Q9NVF7 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
FBXO28Q9NVF7 C15orf48-202ENST00000396650 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
FBXO28Q9NVF7 MIR1247-201ENST00000408206 136 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
FBXO28Q9NVF7 AC007969.1-201ENST00000433675 447 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
FBXO28Q9NVF7 AP000350.4-201ENST00000433835 788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
FBXO28Q9NVF7 Z93015.1-201ENST00000451718 390 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
FBXO28Q9NVF7 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
FBXO28Q9NVF7 MUC1-218ENST00000471283 635 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
FBXO28Q9NVF7 AC093879.1-201ENST00000508959 1176 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
FBXO28Q9NVF7 AP001790.1-201ENST00000511947 570 ntTSL 4 BASIC17.73■□□□□ 0.43
FBXO28Q9NVF7 AC011365.2-201ENST00000520041 810 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
FBXO28Q9NVF7 RN7SL48P-201ENST00000579283 293 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
FBXO28Q9NVF7 PSMC3-212ENST00000602866 1373 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
FBXO28Q9NVF7 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
FBXO28Q9NVF7 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
FBXO28Q9NVF7 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
FBXO28Q9NVF7 KRTAP10-7-201ENST00000609664 1578 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
FBXO28Q9NVF7 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
FBXO28Q9NVF7 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
FBXO28Q9NVF7 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
FBXO28Q9NVF7 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
FBXO28Q9NVF7 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
FBXO28Q9NVF7 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
FBXO28Q9NVF7 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
FBXO28Q9NVF7 SNRNP27-202ENST00000409116 1339 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
FBXO28Q9NVF7 SNAP47-203ENST00000366760 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
FBXO28Q9NVF7 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
FBXO28Q9NVF7 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
FBXO28Q9NVF7 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
FBXO28Q9NVF7 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
FBXO28Q9NVF7 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
FBXO28Q9NVF7 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
FBXO28Q9NVF7 TMEM198B-201ENST00000471276 1958 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
FBXO28Q9NVF7 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
FBXO28Q9NVF7 FANCA-213ENST00000563673 1694 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
FBXO28Q9NVF7 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms