Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRW1

RAB6B, Ras-related protein Rab-6B, humanhuman

Predictions only

Length 208 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB6BQ9NRW1 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RAB6BQ9NRW1 EP400-203ENST00000333577 3092 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RAB6BQ9NRW1 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RAB6BQ9NRW1 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RAB6BQ9NRW1 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RAB6BQ9NRW1 AC017007.3-201ENST00000479865 435 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
RAB6BQ9NRW1 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RAB6BQ9NRW1 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RAB6BQ9NRW1 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RAB6BQ9NRW1 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RAB6BQ9NRW1 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RAB6BQ9NRW1 SALL3-201ENST00000536229 3997 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RAB6BQ9NRW1 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RAB6BQ9NRW1 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RAB6BQ9NRW1 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RAB6BQ9NRW1 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RAB6BQ9NRW1 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RAB6BQ9NRW1 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RAB6BQ9NRW1 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RAB6BQ9NRW1 PHLDA1-203ENST00000619060 5913 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RAB6BQ9NRW1 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RAB6BQ9NRW1 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RAB6BQ9NRW1 ZBTB7C-204ENST00000586438 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RAB6BQ9NRW1 OPA1-208ENST00000392438 6340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RAB6BQ9NRW1 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RAB6BQ9NRW1 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RAB6BQ9NRW1 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RAB6BQ9NRW1 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RAB6BQ9NRW1 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RAB6BQ9NRW1 SEMA5B-201ENST00000195173 4523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RAB6BQ9NRW1 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RAB6BQ9NRW1 RALGDS-202ENST00000372050 3634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RAB6BQ9NRW1 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RAB6BQ9NRW1 NACC1-201ENST00000292431 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RAB6BQ9NRW1 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
RAB6BQ9NRW1 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RAB6BQ9NRW1 CNOT9-208ENST00000542068 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RAB6BQ9NRW1 DIS3-202ENST00000377780 5232 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RAB6BQ9NRW1 CRHR2-208ENST00000506074 3109 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RAB6BQ9NRW1 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RAB6BQ9NRW1 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RAB6BQ9NRW1 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RAB6BQ9NRW1 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RAB6BQ9NRW1 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RAB6BQ9NRW1 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RAB6BQ9NRW1 MYH11-211ENST00000576790 6272 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RAB6BQ9NRW1 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RAB6BQ9NRW1 MTRF1L-201ENST00000367230 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RAB6BQ9NRW1 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RAB6BQ9NRW1 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RAB6BQ9NRW1 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RAB6BQ9NRW1 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RAB6BQ9NRW1 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RAB6BQ9NRW1 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RAB6BQ9NRW1 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
RAB6BQ9NRW1 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RAB6BQ9NRW1 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
RAB6BQ9NRW1 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RAB6BQ9NRW1 KDM5C-205ENST00000404049 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RAB6BQ9NRW1 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RAB6BQ9NRW1 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RAB6BQ9NRW1 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RAB6BQ9NRW1 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RAB6BQ9NRW1 CALD1-222ENST00000495522 2199 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RAB6BQ9NRW1 KCNG4-202ENST00000568181 2199 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RAB6BQ9NRW1 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
RAB6BQ9NRW1 FMR1-203ENST00000370470 1774 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RAB6BQ9NRW1 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RAB6BQ9NRW1 ABCG4-205ENST00000619701 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RAB6BQ9NRW1 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RAB6BQ9NRW1 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RAB6BQ9NRW1 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RAB6BQ9NRW1 TNS2-201ENST00000314250 5010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RAB6BQ9NRW1 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RAB6BQ9NRW1 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
RAB6BQ9NRW1 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RAB6BQ9NRW1 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RAB6BQ9NRW1 FKBP5-201ENST00000357266 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RAB6BQ9NRW1 PIDD1-202ENST00000411829 2886 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RAB6BQ9NRW1 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RAB6BQ9NRW1 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RAB6BQ9NRW1 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RAB6BQ9NRW1 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RAB6BQ9NRW1 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RAB6BQ9NRW1 NFATC4-204ENST00000424781 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RAB6BQ9NRW1 GLIDR-202ENST00000625350 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RAB6BQ9NRW1 COL11A2-201ENST00000341947 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RAB6BQ9NRW1 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RAB6BQ9NRW1 C18orf25-206ENST00000619301 5264 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RAB6BQ9NRW1 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RAB6BQ9NRW1 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RAB6BQ9NRW1 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RAB6BQ9NRW1 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RAB6BQ9NRW1 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RAB6BQ9NRW1 SALL3-205ENST00000575389 3996 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RAB6BQ9NRW1 STRA6-207ENST00000535552 2631 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RAB6BQ9NRW1 UHMK1-202ENST00000489294 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RAB6BQ9NRW1 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RAB6BQ9NRW1 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RAB6BQ9NRW1 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms