Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP91

SLC6A20, Sodium- and chloride-dependent transporter XTRP3, humanhuman

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Length 592 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC6A20Q9NP91 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SLC6A20Q9NP91 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SLC6A20Q9NP91 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
SLC6A20Q9NP91 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SLC6A20Q9NP91 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SLC6A20Q9NP91 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SLC6A20Q9NP91 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SLC6A20Q9NP91 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SLC6A20Q9NP91 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SLC6A20Q9NP91 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SLC6A20Q9NP91 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SLC6A20Q9NP91 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SLC6A20Q9NP91 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SLC6A20Q9NP91 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
SLC6A20Q9NP91 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SLC6A20Q9NP91 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SLC6A20Q9NP91 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SLC6A20Q9NP91 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SLC6A20Q9NP91 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SLC6A20Q9NP91 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SLC6A20Q9NP91 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SLC6A20Q9NP91 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SLC6A20Q9NP91 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SLC6A20Q9NP91 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SLC6A20Q9NP91 SELENOT-203ENST00000477889 944 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SLC6A20Q9NP91 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SLC6A20Q9NP91 NAA50-208ENST00000497255 789 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SLC6A20Q9NP91 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SLC6A20Q9NP91 EEF1AKMT3-204ENST00000551420 836 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SLC6A20Q9NP91 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SLC6A20Q9NP91 NOP53-AS1-201ENST00000602048 540 ntTSL 4 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SLC6A20Q9NP91 TMEM261P1-201ENST00000604899 340 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
SLC6A20Q9NP91 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SLC6A20Q9NP91 AL031056.2-201ENST00000637957 1217 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SLC6A20Q9NP91 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SLC6A20Q9NP91 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SLC6A20Q9NP91 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SLC6A20Q9NP91 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SLC6A20Q9NP91 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SLC6A20Q9NP91 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SLC6A20Q9NP91 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SLC6A20Q9NP91 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SLC6A20Q9NP91 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SLC6A20Q9NP91 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SLC6A20Q9NP91 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SLC6A20Q9NP91 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SLC6A20Q9NP91 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SLC6A20Q9NP91 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SLC6A20Q9NP91 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SLC6A20Q9NP91 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SLC6A20Q9NP91 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SLC6A20Q9NP91 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SLC6A20Q9NP91 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SLC6A20Q9NP91 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SLC6A20Q9NP91 LINC00668-205ENST00000581571 1748 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SLC6A20Q9NP91 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SLC6A20Q9NP91 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SLC6A20Q9NP91 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SLC6A20Q9NP91 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SLC6A20Q9NP91 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SLC6A20Q9NP91 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SLC6A20Q9NP91 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SLC6A20Q9NP91 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SLC6A20Q9NP91 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SLC6A20Q9NP91 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SLC6A20Q9NP91 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SLC6A20Q9NP91 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SLC6A20Q9NP91 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SLC6A20Q9NP91 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SLC6A20Q9NP91 AP006294.1-201ENST00000415407 339 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
SLC6A20Q9NP91 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SLC6A20Q9NP91 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SLC6A20Q9NP91 AJ271736.1-201ENST00000483543 773 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SLC6A20Q9NP91 SMIM22-202ENST00000586440 549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SLC6A20Q9NP91 KXD1-204ENST00000595073 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SLC6A20Q9NP91 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SLC6A20Q9NP91 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SLC6A20Q9NP91 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SLC6A20Q9NP91 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SLC6A20Q9NP91 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SLC6A20Q9NP91 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SLC6A20Q9NP91 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SLC6A20Q9NP91 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SLC6A20Q9NP91 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SLC6A20Q9NP91 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SLC6A20Q9NP91 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SLC6A20Q9NP91 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SLC6A20Q9NP91 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SLC6A20Q9NP91 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
SLC6A20Q9NP91 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SLC6A20Q9NP91 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SLC6A20Q9NP91 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SLC6A20Q9NP91 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SLC6A20Q9NP91 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SLC6A20Q9NP91 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
SLC6A20Q9NP91 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SLC6A20Q9NP91 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SLC6A20Q9NP91 SPAAR-202ENST00000443779 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SLC6A20Q9NP91 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SLC6A20Q9NP91 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
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