Protein–RNA interactions for Protein: Q96S38

RPS6KC1, Ribosomal protein S6 kinase delta-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,066 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS6KC1Q96S38 IL32-235ENST00000613483 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
RPS6KC1Q96S38 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
RPS6KC1Q96S38 AL033527.5-201ENST00000641382 801 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
RPS6KC1Q96S38 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
RPS6KC1Q96S38 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
RPS6KC1Q96S38 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
RPS6KC1Q96S38 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
RPS6KC1Q96S38 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
RPS6KC1Q96S38 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
RPS6KC1Q96S38 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
RPS6KC1Q96S38 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
RPS6KC1Q96S38 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
RPS6KC1Q96S38 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
RPS6KC1Q96S38 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
RPS6KC1Q96S38 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
RPS6KC1Q96S38 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RPS6KC1Q96S38 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RPS6KC1Q96S38 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RPS6KC1Q96S38 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
RPS6KC1Q96S38 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RPS6KC1Q96S38 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RPS6KC1Q96S38 RABEPK-206ENST00000628863 1537 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RPS6KC1Q96S38 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RPS6KC1Q96S38 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RPS6KC1Q96S38 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RPS6KC1Q96S38 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RPS6KC1Q96S38 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RPS6KC1Q96S38 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RPS6KC1Q96S38 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
RPS6KC1Q96S38 MIOX-203ENST00000395733 1021 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RPS6KC1Q96S38 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RPS6KC1Q96S38 FAM86LP-201ENST00000478302 853 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
RPS6KC1Q96S38 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RPS6KC1Q96S38 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RPS6KC1Q96S38 FUZ-207ENST00000526575 482 ntTSL 4 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RPS6KC1Q96S38 AC006064.3-201ENST00000537921 477 ntTSL 4 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RPS6KC1Q96S38 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RPS6KC1Q96S38 AC008969.1-205ENST00000553254 876 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RPS6KC1Q96S38 FXYD6-216ENST00000584230 566 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RPS6KC1Q96S38 APOC4-201ENST00000591600 348 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RPS6KC1Q96S38 KXD1-204ENST00000595073 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RPS6KC1Q96S38 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RPS6KC1Q96S38 NDUFB1-207ENST00000617122 417 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RPS6KC1Q96S38 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RPS6KC1Q96S38 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RPS6KC1Q96S38 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RPS6KC1Q96S38 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RPS6KC1Q96S38 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RPS6KC1Q96S38 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RPS6KC1Q96S38 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RPS6KC1Q96S38 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RPS6KC1Q96S38 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RPS6KC1Q96S38 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RPS6KC1Q96S38 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
RPS6KC1Q96S38 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RPS6KC1Q96S38 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RPS6KC1Q96S38 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RPS6KC1Q96S38 PTPRO-202ENST00000348962 5061 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RPS6KC1Q96S38 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RPS6KC1Q96S38 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RPS6KC1Q96S38 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RPS6KC1Q96S38 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RPS6KC1Q96S38 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RPS6KC1Q96S38 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RPS6KC1Q96S38 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RPS6KC1Q96S38 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RPS6KC1Q96S38 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RPS6KC1Q96S38 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RPS6KC1Q96S38 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
RPS6KC1Q96S38 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
RPS6KC1Q96S38 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RPS6KC1Q96S38 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RPS6KC1Q96S38 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RPS6KC1Q96S38 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RPS6KC1Q96S38 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RPS6KC1Q96S38 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
RPS6KC1Q96S38 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RPS6KC1Q96S38 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
RPS6KC1Q96S38 ATP6V0B-201ENST00000236067 944 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
RPS6KC1Q96S38 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RPS6KC1Q96S38 CLCN6-207ENST00000376497 814 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
RPS6KC1Q96S38 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RPS6KC1Q96S38 AL442647.2-201ENST00000429864 857 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
RPS6KC1Q96S38 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
RPS6KC1Q96S38 ATP6V0B-211ENST00000498664 825 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
RPS6KC1Q96S38 SERF1A-205ENST00000507348 663 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
RPS6KC1Q96S38 AC010327.1-201ENST00000587871 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
RPS6KC1Q96S38 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
RPS6KC1Q96S38 MIR6805-201ENST00000615055 62 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
RPS6KC1Q96S38 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
RPS6KC1Q96S38 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
RPS6KC1Q96S38 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
RPS6KC1Q96S38 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
RPS6KC1Q96S38 GRM5-205ENST00000455756 7927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
RPS6KC1Q96S38 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RPS6KC1Q96S38 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RPS6KC1Q96S38 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RPS6KC1Q96S38 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
RPS6KC1Q96S38 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RPS6KC1Q96S38 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.8 ms