Protein–RNA interactions for Protein: Q96P69

GPR78, G-protein coupled receptor 78, humanhuman

Predictions only

Length 363 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPR78Q96P69 SLC32A1-201ENST00000217420 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GPR78Q96P69 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GPR78Q96P69 ELF2-202ENST00000379549 3005 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GPR78Q96P69 LDLR-202ENST00000455727 2333 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GPR78Q96P69 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
GPR78Q96P69 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GPR78Q96P69 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GPR78Q96P69 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GPR78Q96P69 TOM1L2-205ENST00000478943 2098 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GPR78Q96P69 HM13-201ENST00000335574 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GPR78Q96P69 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GPR78Q96P69 CCDC116-201ENST00000292779 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GPR78Q96P69 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GPR78Q96P69 C19orf57-201ENST00000346736 2489 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GPR78Q96P69 C21orf58-204ENST00000397682 2941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GPR78Q96P69 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GPR78Q96P69 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GPR78Q96P69 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
GPR78Q96P69 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GPR78Q96P69 TNFSF13-201ENST00000338784 1971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GPR78Q96P69 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
GPR78Q96P69 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GPR78Q96P69 DNM1-203ENST00000393594 3245 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GPR78Q96P69 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GPR78Q96P69 PXN-221ENST00000637617 3246 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GPR78Q96P69 ITFG1-201ENST00000320640 3400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GPR78Q96P69 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GPR78Q96P69 STIP1-207ENST00000538945 1900 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GPR78Q96P69 CTBP1-AS2-205ENST00000578730 2757 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GPR78Q96P69 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GPR78Q96P69 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GPR78Q96P69 HDAC11-201ENST00000295757 2960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GPR78Q96P69 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GPR78Q96P69 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GPR78Q96P69 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GPR78Q96P69 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
GPR78Q96P69 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GPR78Q96P69 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GPR78Q96P69 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
GPR78Q96P69 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GPR78Q96P69 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GPR78Q96P69 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
GPR78Q96P69 AC025674.2-201ENST00000522622 2971 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GPR78Q96P69 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
GPR78Q96P69 NDRG2-226ENST00000554104 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GPR78Q96P69 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
GPR78Q96P69 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
GPR78Q96P69 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
GPR78Q96P69 GGT1-201ENST00000248923 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GPR78Q96P69 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GPR78Q96P69 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
GPR78Q96P69 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
GPR78Q96P69 CDH24-202ENST00000397359 3552 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GPR78Q96P69 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GPR78Q96P69 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GPR78Q96P69 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GPR78Q96P69 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GPR78Q96P69 B4GALT3-213ENST00000622395 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GPR78Q96P69 LRRTM1-201ENST00000295057 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GPR78Q96P69 TSEN2-205ENST00000444864 2697 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GPR78Q96P69 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GPR78Q96P69 PPIL2-212ENST00000626352 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GPR78Q96P69 OR2V1-205ENST00000642036 2609 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GPR78Q96P69 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GPR78Q96P69 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GPR78Q96P69 AGPAT1-201ENST00000336984 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GPR78Q96P69 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GPR78Q96P69 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GPR78Q96P69 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GPR78Q96P69 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GPR78Q96P69 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GPR78Q96P69 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GPR78Q96P69 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GPR78Q96P69 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
GPR78Q96P69 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
GPR78Q96P69 TTLL13P-202ENST00000438251 2738 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GPR78Q96P69 TMEM201-202ENST00000340381 3776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GPR78Q96P69 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GPR78Q96P69 SAFB-202ENST00000454510 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GPR78Q96P69 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GPR78Q96P69 SCYL1-201ENST00000270176 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GPR78Q96P69 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GPR78Q96P69 ZCCHC17-202ENST00000373714 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GPR78Q96P69 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GPR78Q96P69 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GPR78Q96P69 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GPR78Q96P69 PRSS8-201ENST00000317508 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GPR78Q96P69 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GPR78Q96P69 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GPR78Q96P69 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GPR78Q96P69 NAA60-229ENST00000575076 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GPR78Q96P69 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GPR78Q96P69 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GPR78Q96P69 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
GPR78Q96P69 SLCO6A1-205ENST00000506729 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GPR78Q96P69 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GPR78Q96P69 SLC17A5-201ENST00000355773 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GPR78Q96P69 BTBD11-204ENST00000420571 3478 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GPR78Q96P69 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GPR78Q96P69 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms