Protein–RNA interactions for Protein: Q96M83

CCDC7, Coiled-coil domain-containing protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 1,385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC7Q96M83 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC7Q96M83 VAMP4-202ENST00000367740 1193 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC7Q96M83 ZNF815P-202ENST00000422825 805 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC7Q96M83 TMEM191A-209ENST00000452055 788 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC7Q96M83 ROPN1-207ENST00000484329 566 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC7Q96M83 NME2-206ENST00000513177 692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC7Q96M83 AC012574.2-201ENST00000520375 443 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC7Q96M83 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC7Q96M83 NOP2-211ENST00000540228 668 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC7Q96M83 MIR4525-201ENST00000580000 75 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC7Q96M83 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC7Q96M83 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC7Q96M83 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC7Q96M83 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC7Q96M83 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC7Q96M83 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC7Q96M83 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC7Q96M83 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC7Q96M83 POMP-201ENST00000380842 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC7Q96M83 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC7Q96M83 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC7Q96M83 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC7Q96M83 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC7Q96M83 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC7Q96M83 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC7Q96M83 LINC01205-202ENST00000497996 1493 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC7Q96M83 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC7Q96M83 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC7Q96M83 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC7Q96M83 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC7Q96M83 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC7Q96M83 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC7Q96M83 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC7Q96M83 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC7Q96M83 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC7Q96M83 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC7Q96M83 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC7Q96M83 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC7Q96M83 AL513217.1-202ENST00000458139 600 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC7Q96M83 RNF216P1-213ENST00000494947 946 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC7Q96M83 AC084864.1-201ENST00000496217 305 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC7Q96M83 BRF2-202ENST00000520601 1192 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC7Q96M83 AL390726.5-201ENST00000562942 871 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC7Q96M83 MIR6775-201ENST00000617557 69 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC7Q96M83 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC7Q96M83 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC7Q96M83 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC7Q96M83 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC7Q96M83 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC7Q96M83 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC7Q96M83 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC7Q96M83 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC7Q96M83 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC7Q96M83 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC7Q96M83 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC7Q96M83 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC7Q96M83 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC7Q96M83 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC7Q96M83 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC7Q96M83 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC7Q96M83 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC7Q96M83 TNNI1-203ENST00000367312 1100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC7Q96M83 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC7Q96M83 C17orf62-239ENST00000585080 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC7Q96M83 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC7Q96M83 AL160035.1-201ENST00000637583 576 ntTSL 4 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC7Q96M83 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC7Q96M83 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC7Q96M83 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC7Q96M83 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC7Q96M83 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC7Q96M83 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC7Q96M83 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC7Q96M83 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC7Q96M83 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC7Q96M83 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC7Q96M83 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC7Q96M83 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC7Q96M83 ANKRD19P-201ENST00000338192 862 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC7Q96M83 NAALADL1-203ENST00000356632 2118 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC7Q96M83 ECSIT-203ENST00000417981 970 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC7Q96M83 FAM86LP-201ENST00000478302 853 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC7Q96M83 OMP-201ENST00000529803 492 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC7Q96M83 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC7Q96M83 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC7Q96M83 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC7Q96M83 LBHD1-201ENST00000354588 1320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC7Q96M83 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC7Q96M83 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC7Q96M83 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC7Q96M83 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC7Q96M83 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC7Q96M83 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC7Q96M83 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC7Q96M83 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC7Q96M83 RPF1-202ENST00000370656 724 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC7Q96M83 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC7Q96M83 AC016683.1-202ENST00000438409 583 ntTSL 4 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC7Q96M83 DPF3-210ENST00000556509 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC7Q96M83 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49 ms