Protein–RNA interactions for Protein: Q96FS4

SIPA1, Signal-induced proliferation-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,042 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIPA1Q96FS4 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SIPA1Q96FS4 PLSCR4-204ENST00000446574 1442 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SIPA1Q96FS4 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SIPA1Q96FS4 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SIPA1Q96FS4 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SIPA1Q96FS4 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SIPA1Q96FS4 LINC00593-202ENST00000560853 1483 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SIPA1Q96FS4 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SIPA1Q96FS4 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SIPA1Q96FS4 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
SIPA1Q96FS4 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
SIPA1Q96FS4 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SIPA1Q96FS4 GTF2A1L-203ENST00000430487 1575 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
SIPA1Q96FS4 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SIPA1Q96FS4 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.09
SIPA1Q96FS4 TRMO-203ENST00000375119 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SIPA1Q96FS4 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SIPA1Q96FS4 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SIPA1Q96FS4 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SIPA1Q96FS4 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SIPA1Q96FS4 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SIPA1Q96FS4 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SIPA1Q96FS4 MROH1-201ENST00000326134 5183 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SIPA1Q96FS4 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SIPA1Q96FS4 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SIPA1Q96FS4 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SIPA1Q96FS4 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SIPA1Q96FS4 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
SIPA1Q96FS4 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SIPA1Q96FS4 LARGE-AS1-202ENST00000424291 1065 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SIPA1Q96FS4 AL592464.1-201ENST00000429389 429 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SIPA1Q96FS4 C1QTNF6-203ENST00000434784 975 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SIPA1Q96FS4 SLC45A2-204ENST00000509381 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SIPA1Q96FS4 AC020659.2-202ENST00000512295 513 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SIPA1Q96FS4 GNLY-210ENST00000524600 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SIPA1Q96FS4 AGER-214ENST00000538695 487 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SIPA1Q96FS4 UEVLD-212ENST00000541984 755 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SIPA1Q96FS4 AC125603.2-201ENST00000546835 876 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SIPA1Q96FS4 AC003070.2-201ENST00000589730 386 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SIPA1Q96FS4 AC145423.3-201ENST00000615987 467 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
SIPA1Q96FS4 AGER-215ENST00000620802 737 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SIPA1Q96FS4 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SIPA1Q96FS4 GPR182-203ENST00000622922 591 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
SIPA1Q96FS4 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SIPA1Q96FS4 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SIPA1Q96FS4 KRT8P35-201ENST00000483942 1338 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
SIPA1Q96FS4 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SIPA1Q96FS4 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SIPA1Q96FS4 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SIPA1Q96FS4 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SIPA1Q96FS4 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SIPA1Q96FS4 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SIPA1Q96FS4 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SIPA1Q96FS4 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SIPA1Q96FS4 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SIPA1Q96FS4 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SIPA1Q96FS4 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SIPA1Q96FS4 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SIPA1Q96FS4 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SIPA1Q96FS4 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SIPA1Q96FS4 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SIPA1Q96FS4 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SIPA1Q96FS4 KAT8-201ENST00000219797 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SIPA1Q96FS4 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SIPA1Q96FS4 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SIPA1Q96FS4 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SIPA1Q96FS4 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SIPA1Q96FS4 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
SIPA1Q96FS4 LINC00094-204ENST00000599836 1689 ntAPPRIS P5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SIPA1Q96FS4 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SIPA1Q96FS4 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SIPA1Q96FS4 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SIPA1Q96FS4 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SIPA1Q96FS4 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SIPA1Q96FS4 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SIPA1Q96FS4 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SIPA1Q96FS4 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SIPA1Q96FS4 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SIPA1Q96FS4 DYNLRB2-201ENST00000305904 497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SIPA1Q96FS4 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SIPA1Q96FS4 MTHFSD-202ENST00000381214 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SIPA1Q96FS4 MASP2-202ENST00000400898 726 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SIPA1Q96FS4 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SIPA1Q96FS4 RPARP-AS1-201ENST00000473970 1297 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SIPA1Q96FS4 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SIPA1Q96FS4 LINC02279-201ENST00000553435 737 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SIPA1Q96FS4 DUX4L45-201ENST00000566406 1057 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
SIPA1Q96FS4 RN7SL560P-201ENST00000577943 264 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
SIPA1Q96FS4 TNNT1-212ENST00000588981 1163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SIPA1Q96FS4 AC009542.2-202ENST00000619004 1067 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
SIPA1Q96FS4 AC099850.1-201ENST00000451775 1338 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SIPA1Q96FS4 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SIPA1Q96FS4 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SIPA1Q96FS4 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SIPA1Q96FS4 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
SIPA1Q96FS4 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SIPA1Q96FS4 ELP6-201ENST00000296149 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SIPA1Q96FS4 CHI3L2-212ENST00000524472 1435 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SIPA1Q96FS4 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SIPA1Q96FS4 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.6 ms