Protein–RNA interactions for Protein: Q92547

TOPBP1, DNA topoisomerase 2-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOPBP1Q92547 POLD4-208ENST00000532830 904 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TOPBP1Q92547 DCTPP1-202ENST00000565758 749 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TOPBP1Q92547 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TOPBP1Q92547 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TOPBP1Q92547 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TOPBP1Q92547 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TOPBP1Q92547 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TOPBP1Q92547 FAM168A-204ENST00000450446 1364 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TOPBP1Q92547 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
TOPBP1Q92547 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TOPBP1Q92547 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
TOPBP1Q92547 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TOPBP1Q92547 HFE-203ENST00000336625 804 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TOPBP1Q92547 TP53I3-203ENST00000407482 747 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TOPBP1Q92547 RHBDD2-203ENST00000428119 1274 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TOPBP1Q92547 LINC00441-201ENST00000433480 1143 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TOPBP1Q92547 IFITM1-204ENST00000528780 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TOPBP1Q92547 AC009041.1-201ENST00000565401 544 ntTSL 4 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TOPBP1Q92547 AC009884.2-201ENST00000603110 324 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
TOPBP1Q92547 DDX5-235ENST00000630471 473 ntTSL 4 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TOPBP1Q92547 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TOPBP1Q92547 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TOPBP1Q92547 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TOPBP1Q92547 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
TOPBP1Q92547 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TOPBP1Q92547 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TOPBP1Q92547 FH-201ENST00000366560 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TOPBP1Q92547 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TOPBP1Q92547 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TOPBP1Q92547 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TOPBP1Q92547 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TOPBP1Q92547 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TOPBP1Q92547 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TOPBP1Q92547 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TOPBP1Q92547 HIST1H1B-201ENST00000331442 681 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TOPBP1Q92547 CMTM5-202ENST00000342473 725 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TOPBP1Q92547 IGHV3-48-201ENST00000390624 432 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TOPBP1Q92547 CMTM5-205ENST00000397227 818 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TOPBP1Q92547 AL118508.1-202ENST00000411595 709 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TOPBP1Q92547 ZAP70-202ENST00000451498 1085 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TOPBP1Q92547 AP000696.1-201ENST00000457669 1133 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TOPBP1Q92547 RN7SL81P-201ENST00000493781 261 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
TOPBP1Q92547 SNCB-203ENST00000506696 552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TOPBP1Q92547 LINC02380-201ENST00000510956 1038 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TOPBP1Q92547 NDUFC1-209ENST00000539002 1198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TOPBP1Q92547 NDUFC1-211ENST00000544855 1257 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TOPBP1Q92547 CMTM5-208ENST00000555731 831 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TOPBP1Q92547 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TOPBP1Q92547 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.64
TOPBP1Q92547 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TOPBP1Q92547 KIF22-208ENST00000569382 2020 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TOPBP1Q92547 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TOPBP1Q92547 SELENOS-201ENST00000398226 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TOPBP1Q92547 SLC35G5-201ENST00000382435 1321 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TOPBP1Q92547 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TOPBP1Q92547 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TOPBP1Q92547 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TOPBP1Q92547 IL9RP3-201ENST00000442856 1674 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
TOPBP1Q92547 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TOPBP1Q92547 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TOPBP1Q92547 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TOPBP1Q92547 PCNA-202ENST00000379160 1359 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TOPBP1Q92547 TMEM242-201ENST00000367144 1030 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TOPBP1Q92547 AL590093.1-201ENST00000416119 623 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TOPBP1Q92547 IGF1-205ENST00000424202 612 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TOPBP1Q92547 DUTP3-201ENST00000450025 415 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
TOPBP1Q92547 FTH1P22-201ENST00000456305 520 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
TOPBP1Q92547 REEP5-205ENST00000504247 480 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TOPBP1Q92547 NSD1-211ENST00000511258 809 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TOPBP1Q92547 REEP5-207ENST00000513339 1139 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TOPBP1Q92547 ALG1L13P-204ENST00000523017 765 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TOPBP1Q92547 AC009119.2-201ENST00000561562 723 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TOPBP1Q92547 AC107464.3-201ENST00000609172 737 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
TOPBP1Q92547 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TOPBP1Q92547 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TOPBP1Q92547 STK26-204ENST00000481105 1835 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TOPBP1Q92547 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TOPBP1Q92547 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TOPBP1Q92547 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TOPBP1Q92547 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TOPBP1Q92547 TMPRSS3-202ENST00000398397 1342 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TOPBP1Q92547 ALAS2-202ENST00000335854 1795 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TOPBP1Q92547 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TOPBP1Q92547 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TOPBP1Q92547 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TOPBP1Q92547 CGB1-201ENST00000301407 573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TOPBP1Q92547 TMEM208-201ENST00000304800 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TOPBP1Q92547 NQO2-202ENST00000380430 1098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TOPBP1Q92547 CD300A-204ENST00000392625 1163 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TOPBP1Q92547 SLC13A3-205ENST00000417157 876 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TOPBP1Q92547 LAMA4-208ENST00000431543 1080 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TOPBP1Q92547 AC105362.1-201ENST00000511234 564 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TOPBP1Q92547 C14orf132-204ENST00000556728 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TOPBP1Q92547 PPCDC-205ENST00000563393 1149 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TOPBP1Q92547 PPCDC-208ENST00000567336 892 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TOPBP1Q92547 RN7SL596P-201ENST00000582123 288 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
TOPBP1Q92547 LINC01224-201ENST00000593573 798 ntTSL 4 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TOPBP1Q92547 AC004706.3-207ENST00000634823 977 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TOPBP1Q92547 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TOPBP1Q92547 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53 ms