Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEV1

CSNK2A3, Casein kinase II subunit alpha 3, humanhuman

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Length 391 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSNK2A3Q8NEV1 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
CSNK2A3Q8NEV1 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
CSNK2A3Q8NEV1 IGDCC3-201ENST00000327987 4479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CSNK2A3Q8NEV1 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
CSNK2A3Q8NEV1 AL139082.1-201ENST00000613982 3433 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CSNK2A3Q8NEV1 LPAR1-203ENST00000374431 3637 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CSNK2A3Q8NEV1 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CSNK2A3Q8NEV1 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
CSNK2A3Q8NEV1 SAPCD2-201ENST00000409687 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CSNK2A3Q8NEV1 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
CSNK2A3Q8NEV1 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
CSNK2A3Q8NEV1 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CSNK2A3Q8NEV1 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CSNK2A3Q8NEV1 FAM45BP-202ENST00000592932 1624 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
CSNK2A3Q8NEV1 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CSNK2A3Q8NEV1 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CSNK2A3Q8NEV1 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CSNK2A3Q8NEV1 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CSNK2A3Q8NEV1 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CSNK2A3Q8NEV1 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CSNK2A3Q8NEV1 ARHGEF5-201ENST00000056217 5544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CSNK2A3Q8NEV1 MYH7-201ENST00000355349 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CSNK2A3Q8NEV1 AP002990.1-202ENST00000496634 5064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CSNK2A3Q8NEV1 GLIS2-201ENST00000262366 4469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CSNK2A3Q8NEV1 CDH23-202ENST00000299366 3954 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CSNK2A3Q8NEV1 ZNF497-201ENST00000311044 3468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CSNK2A3Q8NEV1 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CSNK2A3Q8NEV1 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
CSNK2A3Q8NEV1 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CSNK2A3Q8NEV1 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CSNK2A3Q8NEV1 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CSNK2A3Q8NEV1 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CSNK2A3Q8NEV1 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CSNK2A3Q8NEV1 MEIOC-201ENST00000409122 4604 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CSNK2A3Q8NEV1 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CSNK2A3Q8NEV1 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CSNK2A3Q8NEV1 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CSNK2A3Q8NEV1 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CSNK2A3Q8NEV1 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CSNK2A3Q8NEV1 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CSNK2A3Q8NEV1 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CSNK2A3Q8NEV1 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
CSNK2A3Q8NEV1 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CSNK2A3Q8NEV1 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CSNK2A3Q8NEV1 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CSNK2A3Q8NEV1 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
CSNK2A3Q8NEV1 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CSNK2A3Q8NEV1 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CSNK2A3Q8NEV1 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CSNK2A3Q8NEV1 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CSNK2A3Q8NEV1 TBCD-202ENST00000539345 3975 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CSNK2A3Q8NEV1 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CSNK2A3Q8NEV1 GTPBP1-201ENST00000216044 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CSNK2A3Q8NEV1 CHRNA7-201ENST00000306901 6181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CSNK2A3Q8NEV1 MARC1-201ENST00000366910 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CSNK2A3Q8NEV1 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CSNK2A3Q8NEV1 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CSNK2A3Q8NEV1 DENND1B-211ENST00000620048 8378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CSNK2A3Q8NEV1 SRSF8-201ENST00000587424 4028 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CSNK2A3Q8NEV1 DNAJC27-201ENST00000264711 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CSNK2A3Q8NEV1 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CSNK2A3Q8NEV1 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CSNK2A3Q8NEV1 SOCS5-202ENST00000394861 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CSNK2A3Q8NEV1 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CSNK2A3Q8NEV1 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CSNK2A3Q8NEV1 PHF24-201ENST00000242315 5718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CSNK2A3Q8NEV1 ASPG-206ENST00000551177 4851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CSNK2A3Q8NEV1 DLGAP2-215ENST00000637795 3380 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CSNK2A3Q8NEV1 TMTC1-207ENST00000552618 3915 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CSNK2A3Q8NEV1 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CSNK2A3Q8NEV1 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CSNK2A3Q8NEV1 AP000550.1-201ENST00000420508 4833 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CSNK2A3Q8NEV1 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CSNK2A3Q8NEV1 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CSNK2A3Q8NEV1 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CSNK2A3Q8NEV1 KRT77-201ENST00000341809 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CSNK2A3Q8NEV1 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CSNK2A3Q8NEV1 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CSNK2A3Q8NEV1 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CSNK2A3Q8NEV1 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
CSNK2A3Q8NEV1 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CSNK2A3Q8NEV1 RGPD5-202ENST00000272454 2907 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CSNK2A3Q8NEV1 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CSNK2A3Q8NEV1 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CSNK2A3Q8NEV1 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
CSNK2A3Q8NEV1 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CSNK2A3Q8NEV1 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CSNK2A3Q8NEV1 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CSNK2A3Q8NEV1 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CSNK2A3Q8NEV1 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
CSNK2A3Q8NEV1 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CSNK2A3Q8NEV1 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CSNK2A3Q8NEV1 ZNF559-202ENST00000393883 5095 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CSNK2A3Q8NEV1 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CSNK2A3Q8NEV1 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CSNK2A3Q8NEV1 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CSNK2A3Q8NEV1 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CSNK2A3Q8NEV1 MPPED2-202ENST00000448418 5591 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CSNK2A3Q8NEV1 PCNX4-203ENST00000406854 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CSNK2A3Q8NEV1 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
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