Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTU1

TCF23, Transcription factor 23, humanhuman

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCF23Q7RTU1 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
TCF23Q7RTU1 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
TCF23Q7RTU1 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
TCF23Q7RTU1 MED29-204ENST00000599213 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
TCF23Q7RTU1 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
TCF23Q7RTU1 TRAF6-201ENST00000348124 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
TCF23Q7RTU1 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
TCF23Q7RTU1 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
TCF23Q7RTU1 RNF135-202ENST00000328381 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
TCF23Q7RTU1 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
TCF23Q7RTU1 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
TCF23Q7RTU1 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
TCF23Q7RTU1 MIOS-201ENST00000340080 3453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
TCF23Q7RTU1 NANOS1-202ENST00000425699 4017 ntAPPRIS P2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
TCF23Q7RTU1 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
TCF23Q7RTU1 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
TCF23Q7RTU1 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
TCF23Q7RTU1 CEP170B-203ENST00000453495 6813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
TCF23Q7RTU1 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
TCF23Q7RTU1 NRG2-209ENST00000541337 3723 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
TCF23Q7RTU1 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
TCF23Q7RTU1 VSIG10L-201ENST00000335624 3397 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
TCF23Q7RTU1 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
TCF23Q7RTU1 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
TCF23Q7RTU1 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
TCF23Q7RTU1 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
TCF23Q7RTU1 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
TCF23Q7RTU1 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
TCF23Q7RTU1 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
TCF23Q7RTU1 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
TCF23Q7RTU1 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
TCF23Q7RTU1 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
TCF23Q7RTU1 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
TCF23Q7RTU1 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
TCF23Q7RTU1 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
TCF23Q7RTU1 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
TCF23Q7RTU1 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
TCF23Q7RTU1 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
TCF23Q7RTU1 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
TCF23Q7RTU1 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
TCF23Q7RTU1 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
TCF23Q7RTU1 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
TCF23Q7RTU1 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
TCF23Q7RTU1 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
TCF23Q7RTU1 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
TCF23Q7RTU1 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
TCF23Q7RTU1 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
TCF23Q7RTU1 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC13□□□□□ -0.33
TCF23Q7RTU1 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC13□□□□□ -0.33
TCF23Q7RTU1 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
TCF23Q7RTU1 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
TCF23Q7RTU1 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
TCF23Q7RTU1 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
TCF23Q7RTU1 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
TCF23Q7RTU1 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC13□□□□□ -0.33
TCF23Q7RTU1 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
TCF23Q7RTU1 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
TCF23Q7RTU1 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
TCF23Q7RTU1 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC13□□□□□ -0.33
TCF23Q7RTU1 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
TCF23Q7RTU1 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
TCF23Q7RTU1 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
TCF23Q7RTU1 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC13□□□□□ -0.33
TCF23Q7RTU1 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC13□□□□□ -0.33
TCF23Q7RTU1 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
TCF23Q7RTU1 DLGAP2-215ENST00000637795 3380 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
TCF23Q7RTU1 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
TCF23Q7RTU1 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
TCF23Q7RTU1 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
TCF23Q7RTU1 CHFR-204ENST00000443047 2990 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
TCF23Q7RTU1 ATP2A3-204ENST00000397035 4182 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
TCF23Q7RTU1 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
TCF23Q7RTU1 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
TCF23Q7RTU1 ABCG4-205ENST00000619701 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
TCF23Q7RTU1 PATZ1-202ENST00000266269 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
TCF23Q7RTU1 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
TCF23Q7RTU1 PDZD4-201ENST00000164640 3689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
TCF23Q7RTU1 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
TCF23Q7RTU1 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
TCF23Q7RTU1 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
TCF23Q7RTU1 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
TCF23Q7RTU1 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
TCF23Q7RTU1 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
TCF23Q7RTU1 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
TCF23Q7RTU1 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
TCF23Q7RTU1 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
TCF23Q7RTU1 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
TCF23Q7RTU1 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
TCF23Q7RTU1 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
TCF23Q7RTU1 PHTF1-202ENST00000369598 3000 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
TCF23Q7RTU1 MALSU1-202ENST00000466681 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
TCF23Q7RTU1 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
TCF23Q7RTU1 CASC3-201ENST00000264645 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
TCF23Q7RTU1 DNAJC5-201ENST00000360864 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
TCF23Q7RTU1 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
TCF23Q7RTU1 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
TCF23Q7RTU1 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
TCF23Q7RTU1 MFRP-205ENST00000619721 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
TCF23Q7RTU1 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
TCF23Q7RTU1 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms