Protein–RNA interactions for Protein: Q674R7

ATG9B, Autophagy-related protein 9B, humanhuman

Predictions only

Length 924 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG9BQ674R7 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ATG9BQ674R7 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ATG9BQ674R7 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ATG9BQ674R7 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ATG9BQ674R7 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATG9BQ674R7 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATG9BQ674R7 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATG9BQ674R7 GGT6-201ENST00000301395 2534 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATG9BQ674R7 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATG9BQ674R7 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATG9BQ674R7 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATG9BQ674R7 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATG9BQ674R7 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATG9BQ674R7 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATG9BQ674R7 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATG9BQ674R7 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATG9BQ674R7 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATG9BQ674R7 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATG9BQ674R7 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATG9BQ674R7 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATG9BQ674R7 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATG9BQ674R7 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATG9BQ674R7 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATG9BQ674R7 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATG9BQ674R7 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATG9BQ674R7 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATG9BQ674R7 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATG9BQ674R7 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATG9BQ674R7 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATG9BQ674R7 LINC02242-201ENST00000507298 641 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATG9BQ674R7 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATG9BQ674R7 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATG9BQ674R7 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATG9BQ674R7 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATG9BQ674R7 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATG9BQ674R7 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATG9BQ674R7 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATG9BQ674R7 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
ATG9BQ674R7 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATG9BQ674R7 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATG9BQ674R7 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATG9BQ674R7 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATG9BQ674R7 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATG9BQ674R7 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATG9BQ674R7 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATG9BQ674R7 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
ATG9BQ674R7 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATG9BQ674R7 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATG9BQ674R7 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATG9BQ674R7 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATG9BQ674R7 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
ATG9BQ674R7 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATG9BQ674R7 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATG9BQ674R7 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
ATG9BQ674R7 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATG9BQ674R7 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATG9BQ674R7 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATG9BQ674R7 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATG9BQ674R7 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATG9BQ674R7 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATG9BQ674R7 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATG9BQ674R7 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATG9BQ674R7 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATG9BQ674R7 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATG9BQ674R7 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATG9BQ674R7 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATG9BQ674R7 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATG9BQ674R7 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATG9BQ674R7 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATG9BQ674R7 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATG9BQ674R7 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATG9BQ674R7 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATG9BQ674R7 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATG9BQ674R7 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATG9BQ674R7 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATG9BQ674R7 AC104135.1-201ENST00000418001 763 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATG9BQ674R7 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
ATG9BQ674R7 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATG9BQ674R7 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATG9BQ674R7 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATG9BQ674R7 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATG9BQ674R7 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATG9BQ674R7 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATG9BQ674R7 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATG9BQ674R7 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATG9BQ674R7 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATG9BQ674R7 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATG9BQ674R7 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATG9BQ674R7 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATG9BQ674R7 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATG9BQ674R7 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATG9BQ674R7 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATG9BQ674R7 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATG9BQ674R7 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATG9BQ674R7 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATG9BQ674R7 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATG9BQ674R7 AQP1-201ENST00000311813 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATG9BQ674R7 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATG9BQ674R7 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATG9BQ674R7 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms