Protein–RNA interactions for Protein: Q5SV97

PERM1, PGC-1 and ERR-induced regulator in muscle protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 790 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PERM1Q5SV97 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PERM1Q5SV97 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PERM1Q5SV97 NOS1AP-201ENST00000361897 4931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PERM1Q5SV97 TRMT2B-201ENST00000372935 2921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PERM1Q5SV97 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PERM1Q5SV97 ADAM15-204ENST00000359280 2874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PERM1Q5SV97 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PERM1Q5SV97 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PERM1Q5SV97 IRGQ-201ENST00000422989 9685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PERM1Q5SV97 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PERM1Q5SV97 FAM8A1-201ENST00000259963 4677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PERM1Q5SV97 POLDIP3-202ENST00000339677 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PERM1Q5SV97 TNNI1-203ENST00000367312 1100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PERM1Q5SV97 ZFAND2B-203ENST00000409206 1159 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PERM1Q5SV97 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PERM1Q5SV97 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PERM1Q5SV97 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PERM1Q5SV97 GGTLC2-202ENST00000448514 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PERM1Q5SV97 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PERM1Q5SV97 AL513217.1-202ENST00000458139 600 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PERM1Q5SV97 AC083973.1-206ENST00000518213 815 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PERM1Q5SV97 STMN4-207ENST00000523048 1224 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PERM1Q5SV97 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PERM1Q5SV97 SMIM22-202ENST00000586440 549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PERM1Q5SV97 NDUFB1-207ENST00000617122 417 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PERM1Q5SV97 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PERM1Q5SV97 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PERM1Q5SV97 BCS1L-205ENST00000412366 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PERM1Q5SV97 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PERM1Q5SV97 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PERM1Q5SV97 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PERM1Q5SV97 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PERM1Q5SV97 DSE-202ENST00000359564 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PERM1Q5SV97 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PERM1Q5SV97 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PERM1Q5SV97 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PERM1Q5SV97 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PERM1Q5SV97 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PERM1Q5SV97 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PERM1Q5SV97 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PERM1Q5SV97 SBF1-201ENST00000348911 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PERM1Q5SV97 DTNB-228ENST00000496972 2328 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PERM1Q5SV97 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PERM1Q5SV97 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PERM1Q5SV97 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PERM1Q5SV97 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PERM1Q5SV97 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PERM1Q5SV97 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PERM1Q5SV97 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PERM1Q5SV97 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PERM1Q5SV97 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PERM1Q5SV97 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PERM1Q5SV97 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PERM1Q5SV97 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PERM1Q5SV97 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PERM1Q5SV97 INPP5B-202ENST00000373023 4694 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PERM1Q5SV97 TBK1-201ENST00000331710 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PERM1Q5SV97 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PERM1Q5SV97 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PERM1Q5SV97 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PERM1Q5SV97 HIPK4-201ENST00000291823 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PERM1Q5SV97 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PERM1Q5SV97 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
PERM1Q5SV97 SUMF2-205ENST00000413756 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PERM1Q5SV97 H2AFV-207ENST00000446531 1041 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PERM1Q5SV97 RHOXF1P1-201ENST00000454625 772 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PERM1Q5SV97 AC007389.4-201ENST00000454674 793 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
PERM1Q5SV97 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PERM1Q5SV97 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PERM1Q5SV97 MIR4259-201ENST00000584466 101 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
PERM1Q5SV97 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PERM1Q5SV97 TXNL4A-212ENST00000592957 546 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PERM1Q5SV97 Six3os1_5.1-201ENST00000611000 271 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
PERM1Q5SV97 IFNL3-202ENST00000613087 734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PERM1Q5SV97 AL033527.5-201ENST00000641382 801 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
PERM1Q5SV97 MIOS-201ENST00000340080 3453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PERM1Q5SV97 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PERM1Q5SV97 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PERM1Q5SV97 ACSL3-202ENST00000392066 3147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PERM1Q5SV97 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PERM1Q5SV97 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PERM1Q5SV97 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PERM1Q5SV97 EYA4-205ENST00000430974 2364 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PERM1Q5SV97 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PERM1Q5SV97 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PERM1Q5SV97 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
PERM1Q5SV97 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PERM1Q5SV97 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PERM1Q5SV97 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PERM1Q5SV97 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PERM1Q5SV97 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
PERM1Q5SV97 AL161772.1-201ENST00000610494 4412 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
PERM1Q5SV97 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PERM1Q5SV97 MVK-207ENST00000539575 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PERM1Q5SV97 ANOS1-201ENST00000262648 6314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PERM1Q5SV97 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PERM1Q5SV97 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PERM1Q5SV97 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PERM1Q5SV97 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PERM1Q5SV97 WDR20-202ENST00000322340 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms