Protein–RNA interactions for Protein: Q5BLP8

C4orf48, Neuropeptide-like protein C4orf48, humanhuman

Predictions only

Length 95 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4orf48Q5BLP8 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
C4orf48Q5BLP8 KCNC1-201ENST00000265969 4295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
C4orf48Q5BLP8 SNX33-201ENST00000308527 8008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
C4orf48Q5BLP8 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
C4orf48Q5BLP8 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
C4orf48Q5BLP8 GRB2-203ENST00000392562 3729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
C4orf48Q5BLP8 RFFL-201ENST00000315249 7293 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
C4orf48Q5BLP8 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
C4orf48Q5BLP8 POM121L4P-202ENST00000427789 1891 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
C4orf48Q5BLP8 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
C4orf48Q5BLP8 MTUS1-204ENST00000381869 6256 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
C4orf48Q5BLP8 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
C4orf48Q5BLP8 TMEM60-201ENST00000257663 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
C4orf48Q5BLP8 OR1L4-201ENST00000259466 936 ntAPPRIS P1 BASIC10.26□□□□□ -0.77
C4orf48Q5BLP8 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
C4orf48Q5BLP8 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
C4orf48Q5BLP8 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
C4orf48Q5BLP8 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
C4orf48Q5BLP8 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
C4orf48Q5BLP8 C1orf194-204ENST00000369949 731 ntTSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
C4orf48Q5BLP8 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
C4orf48Q5BLP8 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
C4orf48Q5BLP8 PEX13-202ENST00000401576 1108 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
C4orf48Q5BLP8 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
C4orf48Q5BLP8 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
C4orf48Q5BLP8 KCNQ5-AS1-201ENST00000429832 1101 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
C4orf48Q5BLP8 AL139231.1-201ENST00000431001 312 ntTSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
C4orf48Q5BLP8 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
C4orf48Q5BLP8 UPP2-IT1-201ENST00000439185 357 ntTSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
C4orf48Q5BLP8 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
C4orf48Q5BLP8 BMI1P1-201ENST00000445879 941 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
C4orf48Q5BLP8 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
C4orf48Q5BLP8 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
C4orf48Q5BLP8 USP9YP25-201ENST00000457708 443 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
C4orf48Q5BLP8 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
C4orf48Q5BLP8 SERBP1P6-201ENST00000507707 932 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
C4orf48Q5BLP8 LINC02353-201ENST00000515181 849 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
C4orf48Q5BLP8 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
C4orf48Q5BLP8 AC105180.1-201ENST00000523317 426 ntTSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
C4orf48Q5BLP8 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
C4orf48Q5BLP8 BBOX1-AS1-203ENST00000530430 879 ntTSL 4 BASIC10.26□□□□□ -0.77
C4orf48Q5BLP8 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
C4orf48Q5BLP8 RN7SL491P-201ENST00000584748 269 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
C4orf48Q5BLP8 AC011476.3-201ENST00000593060 786 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
C4orf48Q5BLP8 BACH1-IT2-202ENST00000608072 691 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
C4orf48Q5BLP8 AC004477.3-201ENST00000614061 590 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
C4orf48Q5BLP8 AC004801.6-201ENST00000616571 978 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
C4orf48Q5BLP8 AC009318.3-201ENST00000616916 503 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
C4orf48Q5BLP8 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
C4orf48Q5BLP8 AL355306.2-208ENST00000634868 1251 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
C4orf48Q5BLP8 AC008691.1-209ENST00000642094 814 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
C4orf48Q5BLP8 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
C4orf48Q5BLP8 PMCHL2-202ENST00000450213 1917 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
C4orf48Q5BLP8 PPP2R1A-201ENST00000322088 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
C4orf48Q5BLP8 SYT12-201ENST00000393946 4534 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
C4orf48Q5BLP8 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
C4orf48Q5BLP8 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
C4orf48Q5BLP8 ADAMTS5-201ENST00000284987 9056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
C4orf48Q5BLP8 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
C4orf48Q5BLP8 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
C4orf48Q5BLP8 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
C4orf48Q5BLP8 AC004381.2-201ENST00000637768 1329 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
C4orf48Q5BLP8 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
C4orf48Q5BLP8 STRCP1-201ENST00000509801 5328 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
C4orf48Q5BLP8 DDX24-202ENST00000544005 2214 ntTSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
C4orf48Q5BLP8 PRNP-201ENST00000379440 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
C4orf48Q5BLP8 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
C4orf48Q5BLP8 IGDCC3-201ENST00000327987 4479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
C4orf48Q5BLP8 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
C4orf48Q5BLP8 PNPLA6-202ENST00000414982 4522 ntTSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
C4orf48Q5BLP8 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
C4orf48Q5BLP8 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
C4orf48Q5BLP8 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
C4orf48Q5BLP8 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
C4orf48Q5BLP8 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
C4orf48Q5BLP8 ZDHHC15-201ENST00000373367 5796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
C4orf48Q5BLP8 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
C4orf48Q5BLP8 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
C4orf48Q5BLP8 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
C4orf48Q5BLP8 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
C4orf48Q5BLP8 SALL3-205ENST00000575389 3996 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
C4orf48Q5BLP8 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
C4orf48Q5BLP8 AC105402.3-202ENST00000446781 2592 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
C4orf48Q5BLP8 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
C4orf48Q5BLP8 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
C4orf48Q5BLP8 NANOS1-202ENST00000425699 4017 ntAPPRIS P2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
C4orf48Q5BLP8 AC021755.1-201ENST00000559747 1447 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
C4orf48Q5BLP8 PPFIA4-203ENST00000367240 6434 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
C4orf48Q5BLP8 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
C4orf48Q5BLP8 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
C4orf48Q5BLP8 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
C4orf48Q5BLP8 DDX49-214ENST00000629999 1912 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
C4orf48Q5BLP8 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
C4orf48Q5BLP8 SPOCK2-201ENST00000317376 5328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
C4orf48Q5BLP8 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
C4orf48Q5BLP8 AC016582.3-202ENST00000443870 6580 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
C4orf48Q5BLP8 SF3A1-201ENST00000215793 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
C4orf48Q5BLP8 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
C4orf48Q5BLP8 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
C4orf48Q5BLP8 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms