Protein–RNA interactions for Protein: Q15836

VAMP3, Vesicle-associated membrane protein 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP3Q15836 PTCH1-207ENST00000429896 6563 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
VAMP3Q15836 IL1RL2-201ENST00000264257 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
VAMP3Q15836 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
VAMP3Q15836 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
VAMP3Q15836 OSBPL9-201ENST00000361556 2721 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
VAMP3Q15836 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
VAMP3Q15836 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
VAMP3Q15836 FAM122B-203ENST00000370790 4246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
VAMP3Q15836 PIK3R6-204ENST00000619866 3041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
VAMP3Q15836 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
VAMP3Q15836 GRM1-202ENST00000355289 3874 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
VAMP3Q15836 BAIAP3-203ENST00000421665 3875 ntTSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
VAMP3Q15836 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
VAMP3Q15836 HOTTIP-203ENST00000521028 3345 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
VAMP3Q15836 ABCA17P-202ENST00000469908 4188 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
VAMP3Q15836 CCDC14-220ENST00000488653 4156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
VAMP3Q15836 PFKP-203ENST00000381125 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
VAMP3Q15836 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
VAMP3Q15836 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
VAMP3Q15836 PAX8-204ENST00000397647 3633 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
VAMP3Q15836 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
VAMP3Q15836 TCF21-202ENST00000367882 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
VAMP3Q15836 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
VAMP3Q15836 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC11.1□□□□□ -0.63
VAMP3Q15836 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
VAMP3Q15836 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
VAMP3Q15836 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
VAMP3Q15836 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
VAMP3Q15836 FAM189A2-204ENST00000455972 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
VAMP3Q15836 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
VAMP3Q15836 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
VAMP3Q15836 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
VAMP3Q15836 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
VAMP3Q15836 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
VAMP3Q15836 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
VAMP3Q15836 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
VAMP3Q15836 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
VAMP3Q15836 GPR161-208ENST00000537209 8256 ntTSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
VAMP3Q15836 KNDC1-202ENST00000368571 3925 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
VAMP3Q15836 EXO5-201ENST00000296380 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
VAMP3Q15836 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
VAMP3Q15836 ARHGEF4-217ENST00000611048 3486 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
VAMP3Q15836 HDAC2-205ENST00000519065 9874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
VAMP3Q15836 GPA33-201ENST00000367868 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
VAMP3Q15836 ST8SIA1-203ENST00000396037 9714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
VAMP3Q15836 MDM1-201ENST00000303145 2918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
VAMP3Q15836 FGFRL1-201ENST00000264748 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
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VAMP3Q15836 RASAL2-201ENST00000367649 4378 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
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VAMP3Q15836 SLC28A1-203ENST00000394573 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
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VAMP3Q15836 SYNPO-202ENST00000394243 7063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
VAMP3Q15836 DCAF12L1-201ENST00000371126 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
VAMP3Q15836 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
VAMP3Q15836 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
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VAMP3Q15836 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
VAMP3Q15836 LGALS8-203ENST00000341872 2437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
VAMP3Q15836 BDNF-208ENST00000418212 4125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
VAMP3Q15836 AP000347.1-201ENST00000417194 5004 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
VAMP3Q15836 CDK5RAP2-201ENST00000349780 6228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
VAMP3Q15836 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
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VAMP3Q15836 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
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VAMP3Q15836 PTK7-205ENST00000352931 4023 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
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VAMP3Q15836 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
VAMP3Q15836 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
VAMP3Q15836 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
VAMP3Q15836 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
VAMP3Q15836 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
VAMP3Q15836 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
VAMP3Q15836 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
VAMP3Q15836 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
VAMP3Q15836 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
VAMP3Q15836 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
VAMP3Q15836 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
VAMP3Q15836 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
VAMP3Q15836 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
VAMP3Q15836 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
VAMP3Q15836 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
VAMP3Q15836 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
VAMP3Q15836 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
VAMP3Q15836 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
VAMP3Q15836 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
VAMP3Q15836 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
VAMP3Q15836 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
VAMP3Q15836 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC11.09□□□□□ -0.63
VAMP3Q15836 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
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